23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2009 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2009  hypothetical protein  100 
 
 		 581 aa  1170    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.077757 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0131  hypothetical protein  46.98 
 
 		 566 aa  451  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3868  Heparinase II/III family protein  34.59 
 
 		 628 aa  219  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103442  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2452  hypothetical protein  27.54 
 
 		 649 aa  177  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4959  hypothetical protein  27.36 
 
 		 644 aa  172  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0961  hypothetical protein  30.19 
 
 		 645 aa  171  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.600462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21320  hypothetical protein  31.7 
 
 		 660 aa  170  7e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.12083  normal  0.0898044 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5337  Heparinase II/III family protein  28.49 
 
 		 597 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4527  heparinase II/III family protein  27.37 
 
 		 646 aa  158  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0598567 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5054  Heparinase II/III family protein  27.88 
 
 		 598 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5870  Heparinase II/III family protein  26.17 
 
 		 649 aa  150  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7349  hypothetical protein  28.54 
 
 		 601 aa  149  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3564  heparinase II/III family protein  30.75 
 
 		 623 aa  145  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3961  hypothetical protein  27.65 
 
 		 647 aa  139  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.104475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2603  hypothetical protein  25.93 
 
 		 637 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29060  hypothetical protein  29.65 
 
 		 676 aa  125  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3390  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.78 
 
 		 1246 aa  85.9  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.032281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3391  Heparinase II/III family protein  27.27 
 
 		 618 aa  85.5  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0366049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2455  Heparinase II/III family protein  24.37 
 
 		 628 aa  82.4  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201359  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3947  thr operon leader peptide  25.17 
 
 		 624 aa  76.6  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1459  Heparinase II/III family protein  23.86 
 
 		 626 aa  74.3  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.230111  normal  0.696506 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1685  hypothetical protein  25.16 
 
 		 629 aa  63.9  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.238249  normal  0.0538261 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2654  hypothetical protein  21.46 
 
 		 847 aa  58.9  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.246589  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>