More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1409 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
322 aa  637    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5873  putative transmembrane component of ABC transporter  63.32 
 
 
294 aa  365  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.469705  normal  0.822205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1721  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.27 
 
 
304 aa  358  9e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.792713 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.37 
 
 
299 aa  356  2.9999999999999997e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.235202 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.09 
 
 
312 aa  202  7e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.514921  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1379  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.97 
 
 
308 aa  177  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.246679  normal  0.0275677 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15390  carbohydrate ABC transporter membrane protein  38.46 
 
 
314 aa  163  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.642568  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3778  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.96 
 
 
295 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0395577  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2377  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.76 
 
 
293 aa  145  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.921762  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4717  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4694  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
309 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.477759 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1491  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.36 
 
 
289 aa  129  5.0000000000000004e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.64 
 
 
286 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000108841  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
308 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.283214  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.71 
 
 
312 aa  116  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778687  hitchhiker  0.00185272 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2631  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.12 
 
 
305 aa  116  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0068  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.6 
 
 
306 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3074  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.03 
 
 
314 aa  115  8.999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.62 
 
 
316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.130846  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02940  carbohydrate ABC transporter membrane protein  29.82 
 
 
318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3596  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.23 
 
 
325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.295531  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2109  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.6 
 
 
312 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.376983 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.51 
 
 
316 aa  112  7.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.74 
 
 
313 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.24 
 
 
294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1885  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  30.72 
 
 
317 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.44963 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0943  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.45 
 
 
312 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.301949 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.93 
 
 
307 aa  110  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277747  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29330  permease component of ABC-type sugar transporter  29.25 
 
 
321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2291  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.87 
 
 
311 aa  109  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276592  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2547  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  27.62 
 
 
312 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.194318  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.31 
 
 
299 aa  109  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.34 
 
 
304 aa  109  7.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.610758  normal  0.0357706 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.67 
 
 
293 aa  108  8.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.94 
 
 
314 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000089983 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2702  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.69 
 
 
303 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000107193  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7336  ABC transporter, permease protein  31.34 
 
 
280 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00810018  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2817  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.3 
 
 
310 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.3 
 
 
289 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2918  ABC-type sugar transport system, permease component  30.8 
 
 
305 aa  108  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.03 
 
 
319 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243677  normal  0.263269 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.8 
 
 
301 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415177  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.03 
 
 
291 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00180742  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3640  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.41 
 
 
298 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1182  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.55 
 
 
306 aa  106  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0308376  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3713  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.32 
 
 
297 aa  105  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11610  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.88 
 
 
295 aa  105  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.798667 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2732  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.88 
 
 
277 aa  105  8e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.24 
 
 
310 aa  105  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.181942  normal  0.51159 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3250  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  31.27 
 
 
310 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.21 
 
 
300 aa  104  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0114019  normal  0.0892858 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1956  putative sugar ABC transporter, permease protein  30.98 
 
 
293 aa  104  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.798746  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11550  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.19 
 
 
354 aa  103  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.0144146 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.28 
 
 
306 aa  103  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.739705  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4929  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.45 
 
 
311 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.155715  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.68 
 
 
299 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.59 
 
 
293 aa  103  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.102296  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.01 
 
 
315 aa  103  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1811  putative sugar ABC transporter, permease protein  30.59 
 
 
293 aa  103  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1521  putative sugar ABC transporter, permease protein  30.59 
 
 
293 aa  103  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.97 
 
 
318 aa  103  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0272583 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20460  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.64 
 
 
321 aa  103  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000522199  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01288  predicted sugar transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  30.59 
 
 
293 aa  102  7e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2314  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.59 
 
 
293 aa  102  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.71913  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01299  hypothetical protein  30.59 
 
 
293 aa  102  7e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2163  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
291 aa  102  7e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.270526 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.75 
 
 
309 aa  102  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1426  putative sugar ABC transporter, permease protein  30.59 
 
 
293 aa  102  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2909  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.41 
 
 
348 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.120786  normal  0.0549624 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.07 
 
 
307 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.49 
 
 
336 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.788363  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  28.07 
 
 
307 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3385  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.18 
 
 
313 aa  102  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.359427  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.37 
 
 
303 aa  101  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0695484  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5488  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.27 
 
 
319 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80176  hitchhiker  0.000205378 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
305 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0388505  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.21 
 
 
320 aa  101  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0230008  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.52 
 
 
315 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175054  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.91 
 
 
313 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.62 
 
 
312 aa  101  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.541424  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2496  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.74 
 
 
311 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.78 
 
 
305 aa  100  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.62 
 
 
302 aa  100  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27 
 
 
292 aa  100  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0896196  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.67 
 
 
310 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
339 aa  99.8  5e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.14 
 
 
309 aa  100  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.800905  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1315  ABC transporter, permease protein  29.81 
 
 
301 aa  99.8  5e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0828  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.32 
 
 
316 aa  100  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.194369 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7347  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  25.89 
 
 
320 aa  99.8  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4735  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  29.23 
 
 
310 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1618  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.07 
 
 
283 aa  99.4  7e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.87 
 
 
318 aa  99.4  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949955  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.07 
 
 
309 aa  99.4  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.849073  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.1 
 
 
301 aa  99.4  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0604  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  29.23 
 
 
310 aa  99  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0623  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  28.87 
 
 
310 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4576  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.81 
 
 
314 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00748515 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.6 
 
 
313 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.308138  normal  0.32687 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>