More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0856 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0856  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  495  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4348  protein of unknown function DUF140  63.52 
 
 
285 aa  333  2e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6634  protein of unknown function DUF140  61.9 
 
 
260 aa  315  6e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451559  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0701  hypothetical protein  68.72 
 
 
261 aa  314  9e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03700  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  59.68 
 
 
250 aa  306  3e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.270229  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09380  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  61.87 
 
 
267 aa  299  4e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1128  protein of unknown function DUF140  60.16 
 
 
268 aa  288  4e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2250  protein of unknown function DUF140  60.34 
 
 
267 aa  284  1.0000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5002  hypothetical protein  50 
 
 
254 aa  249  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4707  hypothetical protein  50 
 
 
254 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4619  hypothetical protein  50 
 
 
254 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1554  hypothetical protein  49.34 
 
 
237 aa  246  3e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5204  hypothetical protein  49.34 
 
 
237 aa  245  6e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.217332 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13535  integral membrane protein YrbE4a  47.33 
 
 
254 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000148357 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2826  hypothetical protein  55.69 
 
 
257 aa  240  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3952  protein of unknown function DUF140  47.39 
 
 
254 aa  238  5e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4606  hypothetical protein  49.37 
 
 
255 aa  231  6e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.809194  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1522  hypothetical protein  47.84 
 
 
271 aa  231  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3673  hypothetical protein  45.53 
 
 
270 aa  231  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1545  hypothetical protein  47.84 
 
 
271 aa  231  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3746  hypothetical protein  45.53 
 
 
270 aa  231  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507857  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3686  hypothetical protein  45.53 
 
 
270 aa  231  9e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.86718  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10598  integral membrane protein YrbE2a  46.61 
 
 
265 aa  230  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2988  protein of unknown function DUF140  46.22 
 
 
285 aa  230  2e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2506  hypothetical protein  46.47 
 
 
269 aa  228  6e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.423121 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4401  hypothetical protein  44.76 
 
 
250 aa  225  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4540  hypothetical protein  45.87 
 
 
270 aa  225  6e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.113009 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2099  hypothetical protein  47.66 
 
 
255 aa  224  9e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0264  hypothetical protein  44.35 
 
 
256 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.720653 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0273  hypothetical protein  44.35 
 
 
256 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4172  hypothetical protein  47.46 
 
 
257 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2849  hypothetical protein  45.45 
 
 
270 aa  223  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0283  hypothetical protein  44.35 
 
 
256 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.23346 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10168  integral membrane protein YrbE1a  46.19 
 
 
265 aa  223  3e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0361  hypothetical protein  46.31 
 
 
256 aa  222  4e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4152  hypothetical protein  46.91 
 
 
269 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0713  hypothetical protein  44.49 
 
 
265 aa  216  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0654  hypothetical protein  43.75 
 
 
269 aa  215  4e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0633475  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3830  protein of unknown function DUF140  46.31 
 
 
267 aa  216  4e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1625  hypothetical protein  43.75 
 
 
266 aa  214  7e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1650  hypothetical protein  43.75 
 
 
266 aa  214  7e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0498  hypothetical protein  43.75 
 
 
269 aa  215  7e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0382697  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1676  hypothetical protein  43.75 
 
 
266 aa  214  7e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.277826  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0132  hypothetical protein  44.92 
 
 
265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.99032  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3984  hypothetical protein  43.93 
 
 
257 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4190  hypothetical protein  44.07 
 
 
255 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.731627  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0520  protein of unknown function DUF140  47.58 
 
 
262 aa  207  9e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0012  hypothetical protein  43.5 
 
 
312 aa  206  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261504  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0957  hypothetical protein  43.93 
 
 
281 aa  206  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3025  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents permease component-like protein  45.38 
 
 
269 aa  201  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0106  hypothetical protein  45.34 
 
 
265 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.963801 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0116  hypothetical protein  45.34 
 
 
265 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.239683  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0125  hypothetical protein  45.34 
 
 
265 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.288689  normal  0.150892 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1246  protein of unknown function DUF140  44.3 
 
 
285 aa  176  4e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.869523  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4170  protein of unknown function DUF140  45.95 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0920  hypothetical protein  46.28 
 
 
255 aa  161  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.403471 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1221  protein of unknown function DUF140  42.25 
 
 
349 aa  159  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3789  protein of unknown function DUF140  39.17 
 
 
272 aa  152  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  34.68 
 
 
256 aa  146  3e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1620  protein of unknown function DUF140  40.62 
 
 
246 aa  144  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.346599  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  33.74 
 
 
250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  34.54 
 
 
257 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  33.19 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  31.91 
 
 
256 aa  133  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  31.98 
 
 
258 aa  132  6e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0833  hypothetical protein  40.72 
 
 
297 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  30.87 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3239  protein of unknown function DUF140  36.28 
 
 
255 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205423  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  30.51 
 
 
256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2892  protein of unknown function DUF140  35.84 
 
 
255 aa  129  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1780  hypothetical protein  32.39 
 
 
260 aa  128  8.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.117267 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0014  hypothetical protein  33.73 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394088  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2961  hypothetical protein  35.09 
 
 
255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597784  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0394  hypothetical protein  35.71 
 
 
255 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138543  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3513  ABC transporter, inner membrane subunit  35.71 
 
 
255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  35.11 
 
 
258 aa  125  6e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2219  hypothetical protein  33.2 
 
 
260 aa  125  8.000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  32.38 
 
 
270 aa  125  8.000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2692  hypothetical protein  35.27 
 
 
255 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327255  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0415  hypothetical protein  35.27 
 
 
255 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177362  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3121  hypothetical protein  32.23 
 
 
258 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  32.74 
 
 
263 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11995  integral membrane protein YrbE3a  44.36 
 
 
141 aa  123  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  34.83 
 
 
257 aa  123  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0318  hypothetical protein  34.82 
 
 
255 aa  123  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.256439  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1577  hypothetical protein  34.3 
 
 
268 aa  122  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.303696 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2769  hypothetical protein  35.27 
 
 
255 aa  122  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686184  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  30.77 
 
 
270 aa  122  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0708  protein of unknown function DUF140  35.92 
 
 
272 aa  121  8e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356543  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0333  hypothetical protein  34.38 
 
 
255 aa  121  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0342  hypothetical protein  34.38 
 
 
255 aa  121  9e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.610119 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2708  hypothetical protein  32.92 
 
 
260 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0685  hypothetical protein  29.54 
 
 
250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1871  protein of unknown function DUF140  30.36 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0106887 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0097  hypothetical protein  31.43 
 
 
265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.180124  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  32.37 
 
 
257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  32.31 
 
 
263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3393  hypothetical protein  33.94 
 
 
259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  32.31 
 
 
263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  29.36 
 
 
267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>