More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1466 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_1466  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
324 aa  647    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0188  oligopeptide ABC transporter, permease protein  70.93 
 
 
325 aa  468  1.0000000000000001e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0036  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.7 
 
 
325 aa  357  9.999999999999999e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0122528  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.77 
 
 
332 aa  344  1e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.486831  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2551  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.68 
 
 
331 aa  323  2e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2202  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.77 
 
 
327 aa  317  2e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.238052  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1344  dipeptide ABC transporter, permease protein  47.99 
 
 
330 aa  308  6.999999999999999e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.782695 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.83 
 
 
329 aa  301  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1328  dipeptide ABC transporter, permease protein  45.28 
 
 
359 aa  296  3e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 
327 aa  291  8e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0232196  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0012  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  45.24 
 
 
300 aa  285  7e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.465454  normal  0.0116121 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0215  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  45.54 
 
 
330 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3067  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 
370 aa  280  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.998653  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1126  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.72 
 
 
322 aa  260  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0398727  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3548  nickel ABC transporter permease  41.72 
 
 
322 aa  260  2e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00865819  normal  0.0646606 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1072  nickel ABC transporter, permease protein  41.72 
 
 
322 aa  260  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.494547  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1362  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, permease component  40.73 
 
 
324 aa  251  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00715477 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1346  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transporter permease component  40.8 
 
 
324 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.981924  normal  0.347741 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2105  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter, permease  40.8 
 
 
324 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000398948 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1924  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, permease component  40.8 
 
 
324 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0499049  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1377  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, permease component  40.73 
 
 
324 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.872874  normal  0.311563 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1676  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, permease component  37.88 
 
 
330 aa  217  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.96403  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.03 
 
 
325 aa  204  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1001  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.87 
 
 
316 aa  196  6e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.54 
 
 
320 aa  195  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.766968 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.54 
 
 
320 aa  195  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
316 aa  192  5e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00583871  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1434  peptide ABC transporter, permease protein  32.09 
 
 
326 aa  192  5e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393954  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4385  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.24 
 
 
316 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.02052e-22 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0997  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.56 
 
 
316 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.28482e-62 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.68 
 
 
333 aa  189  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391976  normal  0.26803 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0823  oligopeptide ABC transporter, permease  34.92 
 
 
316 aa  189  5e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.164685  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0946  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.92 
 
 
316 aa  189  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0808  oligopeptide ABC transporter, permease  34.92 
 
 
316 aa  188  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282065  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0859  oligopeptide ABC transporter permease  35.24 
 
 
316 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0909  oligopeptide ABC transporter permease protein  35.24 
 
 
316 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0836804  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0210  oligopeptide ABC transporter, permease  33.12 
 
 
318 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0232  oligopeptide ABC transporter permease protein  33.12 
 
 
318 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0249  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.12 
 
 
318 aa  182  6e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.86 
 
 
322 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0219  oligopeptide ABC transporter permease  33.44 
 
 
307 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5079  oligopeptide ABC transporter, permease protein  32.18 
 
 
318 aa  178  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823719  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0242  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.44 
 
 
307 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0206  oligopeptide ABC transporter, permease  32.18 
 
 
318 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.45 
 
 
320 aa  177  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000183272  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0004  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.27 
 
 
320 aa  176  6e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.101832  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0267  oligopeptide ABC transporter, permease protein  32.49 
 
 
318 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.81 
 
 
318 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1563  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.81 
 
 
321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0231928  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.37 
 
 
321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.06 
 
 
326 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.09 
 
 
325 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.46 
 
 
324 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.29 
 
 
306 aa  172  5e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.55 
 
 
318 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.48 
 
 
328 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0246  oligopeptide ABC transporter, permease protein  32.13 
 
 
307 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0542782  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.12 
 
 
326 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.75386 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2554  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  31.76 
 
 
321 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.93 
 
 
334 aa  170  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.12 
 
 
334 aa  169  5e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2257  oligopeptide ABC transporter, permease component  31.45 
 
 
321 aa  169  5e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.25 
 
 
333 aa  169  7e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1411  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.06 
 
 
319 aa  169  7e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.11 
 
 
314 aa  169  7e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0408  peptide ABC transporter, permease protein  31.03 
 
 
319 aa  168  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.599742  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.28 
 
 
321 aa  168  1e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.55 
 
 
321 aa  168  1e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000859188  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.5 
 
 
313 aa  168  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4284  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.64 
 
 
323 aa  168  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.181861  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1081  peptide ABC transporter, permease protein  28.83 
 
 
337 aa  167  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.446829  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0351  peptide ABC transporter, permease protein  31.03 
 
 
319 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.01 
 
 
328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.892452  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6954  oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  30.16 
 
 
319 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0131  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.11 
 
 
326 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.45 
 
 
313 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.65 
 
 
313 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0709141  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.55 
 
 
312 aa  166  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.794004  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.08 
 
 
319 aa  166  5e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3251  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  31.55 
 
 
312 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.177339  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3257  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  30.38 
 
 
306 aa  165  9e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.38 
 
 
306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5358  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  32.4 
 
 
315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.91 
 
 
322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.3137  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5256  putative ABC transporter (permease protein)  31.86 
 
 
313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.132635 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4233  oligopeptide transport, system permease  36.01 
 
 
306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4245  oligopeptide ABC transporter, permease  36.01 
 
 
306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2849  ABC transporter permease protein  30.94 
 
 
313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.585703  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1484  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.52 
 
 
339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.186938  normal  0.127201 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4610  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36.01 
 
 
306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5300  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  29.43 
 
 
316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340844  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1004  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.76 
 
 
308 aa  163  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.243628  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2575  peptide ABC transporter, permease protein  31.01 
 
 
305 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.38 
 
 
315 aa  164  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2469  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.21 
 
 
345 aa  164  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.21 
 
 
346 aa  163  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3866  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.21 
 
 
346 aa  163  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.76 
 
 
308 aa  163  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.46607  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.81 
 
 
317 aa  163  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2266  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.01 
 
 
305 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0437136  normal  0.510815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>