More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2130 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0732  glutamine synthetase family protein  65.11 
 
 		 455 aa  637    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212286  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2130  glutamine synthetase catalytic region  100 
 
 		 454 aa  948    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.357355 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3881  glutamate--ammonia ligase  65.11 
 
 		 456 aa  635    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.130901  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2633  glutamine synthetase catalytic region  85.43 
 
 		 454 aa  803    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0200628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1870  L-glutamine synthetase  77.38 
 
 		 455 aa  765    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.156318  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2893  Glutamate--ammonia ligase  84.55 
 
 		 455 aa  795    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.893589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0686  glutamine synthetase family protein  64.67 
 
 		 455 aa  634  1e-180  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.22551  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0993  glutamate--ammonia ligase  66.81 
 
 		 459 aa  624  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2319  L-glutamine synthetase  66.81 
 
 		 459 aa  624  1e-178  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1610  glutamate--ammonia ligase  65.5 
 
 		 459 aa  627  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0679  L-glutamine synthetase  63.8 
 
 		 453 aa  611  1e-173  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.08688  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7784  glutamine synthetase catalytic region  61.67 
 
 		 452 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2783  L-glutamine synthetase  60.75 
 
 		 450 aa  590  1e-167  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2794  glutamate--ammonia ligase  61.73 
 
 		 455 aa  578  1e-164  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0169506  normal  0.297978 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4547  glutamate--ammonia ligase  62.69 
 
 		 453 aa  577  1.0000000000000001e-163  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01963  glutamine synthetase family protein  55.37 
 
 		 426 aa  504  1e-141  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00039077  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3196  L-glutamine synthetase  51.11 
 
 		 455 aa  443  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1760  Glutamate--ammonia ligase  50.89 
 
 		 447 aa  441  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0148642 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12876  glutamine synthetase glnA4  51 
 
 		 457 aa  433  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1851  L-glutamine synthetase  50.55 
 
 		 446 aa  426  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.36214  normal  0.378692 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1637  Glutamate--putrescine ligase  50.55 
 
 		 483 aa  424  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0634583  normal  0.087119 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4065  glutamate--ammonia ligase  49.23 
 
 		 469 aa  424  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2076  Glutamate--ammonia ligase  51.21 
 
 		 454 aa  419  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1797  Glutamate--putrescine ligase  47.45 
 
 		 455 aa  421  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1965  glutamine synthetase catalytic region  49.01 
 
 		 463 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.771992 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3298  hypothetical protein  49 
 
 		 459 aa  417  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0966227 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4670  glutamine synthetase catalytic region  45.81 
 
 		 458 aa  413  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0773  glutamate--ammonia ligase  48.66 
 
 		 458 aa  412  1e-114  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2278  glutamate--ammonia ligase  47.12 
 
 		 459 aa  395  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206165 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2587  L-glutamine synthetase  46.9 
 
 		 464 aa  397  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2393  glutamine synthetase, catalytic region  47.23 
 
 		 493 aa  394  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2057  glutamate--ammonia ligase  46.65 
 
 		 455 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.454402  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2103  glutamate--ammonia ligase  46.65 
 
 		 455 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183312  normal  0.0293144 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2040  glutamate--ammonia ligase  46.65 
 
 		 455 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.373617 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0657  glutamate--putrescine ligase  44.57 
 
 		 470 aa  350  3e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.178319  normal  0.618001 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4416  Glutamate--putrescine ligase  42.76 
 
 		 460 aa  342  5.999999999999999e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.163105  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4059  L-glutamine synthetase  40.77 
 
 		 535 aa  326  5e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.305883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0612  glutamate--ammonia ligase  37.97 
 
 		 459 aa  325  1e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802601 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1603  glutamate--ammonia ligase  40.77 
 
 		 468 aa  322  9.000000000000001e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0361504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4406  Glutamate--ammonia ligase  37.22 
 
 		 461 aa  277  3e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5139  Glutamate--ammonia ligase  34.87 
 
 		 457 aa  268  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.551864 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2502  L-glutamine synthetase  34 
 
 		 452 aa  266  4e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.979847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4024  Glutamate--putrescine ligase  35.19 
 
 		 471 aa  259  5.0000000000000005e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.283085 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2178  hypothetical protein  32.37 
 
 		 457 aa  254  3e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2206  hypothetical protein  32.37 
 
 		 457 aa  253  5.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4698  L-glutamine synthetase  34.55 
 
 		 460 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.786087 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0110  glutamine synthetase, catalytic region  33.64 
 
 		 458 aa  246  8e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0676  L-glutamine synthetase  34.09 
 
 		 457 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.291312  normal  0.545703 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2101  glutamine synthetase catalytic region  34.27 
 
 		 455 aa  231  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00945274  normal  0.235579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0501  glutamate--ammonia ligase  34.46 
 
 		 466 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0512  glutamate--ammonia ligase  34.46 
 
 		 466 aa  226  6e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0523  glutamate--ammonia ligase  34.46 
 
 		 466 aa  226  6e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.172344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2532  hypothetical protein  32.66 
 
 		 455 aa  223  4e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.877582  normal  0.863101 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  36.27 
 
 		 450 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1031  L-glutamine synthetase  33.33 
 
 		 444 aa  216  8e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0199582  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1096  L-glutamine synthetase  33.78 
 
 		 449 aa  207  4e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0634  glutamine synthetase, type I  35.38 
 
 		 444 aa  206  9e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144254  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  34.87 
 
 		 452 aa  205  1e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1921  glutamine synthetase  31.36 
 
 		 447 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1435  glutamine synthetase, type I  33.24 
 
 		 437 aa  199  9e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4259  L-glutamine synthetase  31.58 
 
 		 447 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2380  Glutamate--putrescine ligase  32.44 
 
 		 456 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0068155  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2819  glutamine synthetase, type I  32.18 
 
 		 448 aa  197  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0521  glutamine synthetase, type I  31.96 
 
 		 446 aa  197  3e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0384  L-glutamine synthetase  32.38 
 
 		 446 aa  197  3e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.882152  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_941  glutamine synthetase, type I  34.19 
 
 		 443 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  31.81 
 
 		 439 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0161  L-glutamine synthetase  30.45 
 
 		 475 aa  196  6e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.636195  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  34.34 
 
 		 451 aa  195  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1466  glutamine synthetase, type I  32.12 
 
 		 446 aa  195  1e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3960  glutamate--putrescine ligase  30.98 
 
 		 440 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3740  glutamate--putrescine ligase  30.54 
 
 		 447 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.120298  normal  0.581989 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06870  Glutamine synthetase, putative  31.51 
 
 		 482 aa  195  2e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3492  glutamate--ammonia ligase  31.81 
 
 		 447 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.38104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0453  glutamine synthetase, type I  31.61 
 
 		 446 aa  194  2e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1455  glutamate--putrescine ligase  31.29 
 
 		 440 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.171449  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2119  glutamine synthetase, type I  34.55 
 
 		 445 aa  194  3e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  33.94 
 
 		 446 aa  194  3e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0159  glutamine synthetase  32.73 
 
 		 445 aa  194  3e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.463093  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7497  Glutamate--ammonia ligase  33.71 
 
 		 445 aa  194  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  32.11 
 
 		 439 aa  193  6e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1260  L-glutamine synthetase  32.72 
 
 		 461 aa  193  7e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  34.79 
 
 		 433 aa  192  8e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3936  glutamate--putrescine ligase  30.23 
 
 		 476 aa  192  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  31.58 
 
 		 447 aa  192  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0952  L-glutamine synthetase  33.42 
 
 		 443 aa  192  1e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15270  L-glutamine synthetase  33.33 
 
 		 444 aa  192  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  32.47 
 
 		 456 aa  192  1e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1123  glutamine synthetase, type I  33.85 
 
 		 443 aa  191  2e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  31.66 
 
 		 439 aa  191  2e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0715  glutamine synthetase family protein  30.59 
 
 		 476 aa  191  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  33.77 
 
 		 445 aa  191  2.9999999999999997e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2273  glutamine synthetase, type I  33.33 
 
 		 443 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1112  glutamine synthetase, type I  32.13 
 
 		 445 aa  190  4e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.729434 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0768  glutamine synthetase family protein  30.59 
 
 		 476 aa  190  5e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.150739  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34400  glutamine synthetase catalytic domain family protein  31.11 
 
 		 446 aa  190  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1125  L-glutamine synthetase  34.87 
 
 		 443 aa  190  5e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0811977  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3148  glutamine synthetase, putative  28.07 
 
 		 452 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1487  glutamine synthetase, type I  32.39 
 
 		 444 aa  189  8e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2707  glutamate--putrescine ligase  28.07 
 
 		 452 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210959  normal  0.606055 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>