227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1386 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_1386  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
165 aa  343  4e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205195  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2602  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  80 
 
 
165 aa  290  6e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0226362  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1415  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  79.88 
 
 
164 aa  287  6e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.982851  normal  0.391906 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1335  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  79.39 
 
 
165 aa  282  1.0000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0193971  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1591  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  79.63 
 
 
164 aa  282  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1046  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  78.18 
 
 
165 aa  279  1e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.468215  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2133  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  77.58 
 
 
165 aa  277  4e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7666  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  74.39 
 
 
168 aa  251  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6953  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  71.6 
 
 
168 aa  248  4e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0372547 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5270  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  66.25 
 
 
173 aa  213  7e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2188  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  64.2 
 
 
168 aa  209  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3213  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  62.11 
 
 
172 aa  208  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.442348  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2473  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  64.38 
 
 
173 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3155  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  65.62 
 
 
174 aa  204  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.146964  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2590  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  64.63 
 
 
168 aa  203  9e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0646054  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2243  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  63.12 
 
 
172 aa  199  9e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132931  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3674  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  56.02 
 
 
165 aa  198  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2116  Xanthine phosphoribosyltransferase  64.38 
 
 
175 aa  198  3e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1131  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  59.24 
 
 
159 aa  197  5e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.585634  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3234  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  56.52 
 
 
161 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1506  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  60.51 
 
 
162 aa  195  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.359909  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3025  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  58.33 
 
 
163 aa  194  6e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0855  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  58.97 
 
 
165 aa  192  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.899266  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0213  Xanthine phosphoribosyltransferase  59.49 
 
 
163 aa  192  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.90776  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2342  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  60.13 
 
 
167 aa  189  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1017  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  60.13 
 
 
167 aa  189  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.183272  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1049  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  60.13 
 
 
167 aa  189  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.902845  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2477  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  55.9 
 
 
172 aa  188  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00627128  normal  0.0241876 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1928  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  57.05 
 
 
163 aa  187  4e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.266105  normal  0.026765 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1793  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  56.33 
 
 
167 aa  185  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000757815  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1146  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  57.41 
 
 
176 aa  185  3e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000218222  normal  0.206234 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2097  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  54.37 
 
 
162 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2747  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  57.42 
 
 
162 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.87858  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1006  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  53.21 
 
 
188 aa  168  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1067  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  53.21 
 
 
188 aa  167  8e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1064  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  52.56 
 
 
192 aa  164  5e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3172  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  50.63 
 
 
186 aa  164  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00233  xanthine phosphoribosyltransferase  48.39 
 
 
152 aa  160  6e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3369  Xanthine phosphoribosyltransferase  48.39 
 
 
152 aa  160  6e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3343  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.39 
 
 
152 aa  160  6e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0283  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.39 
 
 
152 aa  160  6e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.382963  normal  0.332523 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0265  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.39 
 
 
152 aa  160  6e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0292  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.39 
 
 
152 aa  160  6e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0133034 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00236  hypothetical protein  48.39 
 
 
152 aa  160  6e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0964  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  50.32 
 
 
152 aa  160  6e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0235  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.39 
 
 
152 aa  160  6e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0270  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.39 
 
 
152 aa  160  6e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0930  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  47.1 
 
 
152 aa  159  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0347  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  47.74 
 
 
152 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0356  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  47.74 
 
 
152 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0366  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  47.74 
 
 
152 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3143  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.9 
 
 
160 aa  159  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.167132 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0358  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  47.74 
 
 
152 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000166936 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0351  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  47.74 
 
 
152 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3289  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.39 
 
 
152 aa  158  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3304  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  47.44 
 
 
152 aa  158  4e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000126609  hitchhiker  0.000156844 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3319  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  47.77 
 
 
185 aa  157  4e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3291  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  47.44 
 
 
152 aa  158  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.191144  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3153  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  47.44 
 
 
152 aa  158  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0457  Xanthine phosphoribosyltransferase  53.79 
 
 
154 aa  158  4e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3436  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.39 
 
 
152 aa  157  7e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0764  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  47.1 
 
 
152 aa  156  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0003  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.79 
 
 
154 aa  154  5.0000000000000005e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0897  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.1 
 
 
152 aa  153  9e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2433  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.79 
 
 
151 aa  153  9e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1867  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  47.8 
 
 
154 aa  150  8e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00174281  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0975  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.75 
 
 
152 aa  147  8e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.935967  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004271  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  45.28 
 
 
154 aa  141  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01159  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  44.03 
 
 
154 aa  136  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1738  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
169 aa  69.3  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0383  phosphoribosyltransferase  31.01 
 
 
186 aa  68.6  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0167235  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0637  phosphoribosyltransferase  29.05 
 
 
179 aa  66.6  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.31901  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22270  predicted phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 
170 aa  66.2  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0877  phosphoribosyltransferase  29.93 
 
 
208 aa  64.7  0.0000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.267757  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2887  phosphoribosyltransferase  28 
 
 
168 aa  63.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10220  predicted phosphoribosyltransferase  30.97 
 
 
170 aa  63.5  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1451  phosphoribosyltransferase  30.46 
 
 
170 aa  62.8  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.930666  normal  0.536266 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1712  phosphoribosyltransferase  32.28 
 
 
169 aa  61.6  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0833  phosphoribosyltransferase  29.17 
 
 
148 aa  60.5  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.892512  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1986  phosphoribosyltransferase  28.08 
 
 
186 aa  60.1  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0798  phosphoribosyltransferase  25.34 
 
 
181 aa  59.7  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000521483 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0977  phosphoribosyltransferase  32.03 
 
 
171 aa  59.7  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0436  phosphoribosyltransferase  27.15 
 
 
173 aa  58.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0447  phosphoribosyltransferase  27.15 
 
 
173 aa  58.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0157865 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1435  phosphoribosyltransferase  26.99 
 
 
174 aa  58.2  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011265  normal  0.560383 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0024  phosphoribosyltransferase  30.6 
 
 
165 aa  57.8  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.128172 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2827  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  29.93 
 
 
206 aa  57.4  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0228  phosphoribosyltransferase  27.59 
 
 
179 aa  57.4  0.00000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5008  phosphoribosyltransferase  28 
 
 
174 aa  57.4  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1984  putative transferase  28.76 
 
 
173 aa  57  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.116476 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2856  phosphoribosyltransferase  28.1 
 
 
173 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.736332 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1884  phosphoribosyltransferase  30.46 
 
 
174 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.209133  normal  0.725799 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0201  phosphoribosyltransferase  32.67 
 
 
169 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0836  phosphoribosyltransferase  27.44 
 
 
218 aa  56.2  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1964  phosphoribosyltransferase  25.79 
 
 
180 aa  56.2  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0577675  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0154  phosphoribosyltransferase  27.7 
 
 
205 aa  55.8  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1607  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  26.45 
 
 
196 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0880276  normal  0.268016 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2529  phosphoribosyltransferase  26.45 
 
 
196 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00263166  hitchhiker  0.000000130558 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1408  phosphoribosyltransferase  28.12 
 
 
194 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000053436 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3161  phosphoribosyltransferase  30.43 
 
 
174 aa  55.5  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>