35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0618 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0618  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 312 aa  620  1e-177  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.773916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0885  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  49.54 
 
 		 307 aa  248  8e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1011  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  49.25 
 
 		 317 aa  242  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.404081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1306  hypothetical protein  36.53 
 
 		 374 aa  156  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340844  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0878  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.82 
 
 		 266 aa  97.4  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.605473  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2682  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.07 
 
 		 328 aa  96.7  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0578  peptidoglycan-binding protein, putative  30.13 
 
 		 338 aa  95.5  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.641348  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0578  putative peptidoglycan-binding protein  30.13 
 
 		 338 aa  95.5  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0426  peptidoglycan binding domain-containing protein  22.11 
 
 		 281 aa  53.9  0.000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.43216  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1246  peptidoglycan binding domain-containing protein  23.95 
 
 		 508 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1122  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.57 
 
 		 279 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.429481  normal  0.843879 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4662  peptidoglycan binding domain-containing protein  49.06 
 
 		 241 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.486604 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2632  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.57 
 
 		 116 aa  47.8  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6252  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.81 
 
 		 386 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2622  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.22 
 
 		 201 aa  46.2  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0710  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.9 
 
 		 250 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.296001 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2412  peptidoglycan binding domain-containing protein  45 
 
 		 1557 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0713  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.28 
 
 		 276 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621682  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2333  opcA protein  46.3 
 
 		 445 aa  45.1  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0699  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.48 
 
 		 250 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1945  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.76 
 
 		 266 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0459891  normal  0.0921332 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6247  putative transglycosylase  45.28 
 
 		 393 aa  43.9  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3046  hypothetical protein  30.12 
 
 		 231 aa  43.5  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.68 
 
 		 433 aa  43.5  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  30.3 
 
 		 438 aa  43.1  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  34.92 
 
 		 383 aa  43.5  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0672  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30 
 
 		 245 aa  43.1  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.317968 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1407  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.67 
 
 		 239 aa  43.1  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.295856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.16 
 
 		 1012 aa  43.1  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1959  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.89 
 
 		 487 aa  43.1  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315261  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4855  cell wall hydrolase/autolysin  32.86 
 
 		 396 aa  43.1  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  40.35 
 
 		 470 aa  42.7  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2957  lytic murein transglycosylase  42.31 
 
 		 470 aa  42.7  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.344089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2479  lytic murein transglycosylase  41.51 
 
 		 419 aa  42.7  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0304253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3393  lytic murein transglycosylase  38.98 
 
 		 409 aa  42.4  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>