44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3034 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3034  hypothetical protein  100 
 
 
269 aa  533  1e-151  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.615757  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1663  hypothetical protein  44.94 
 
 
291 aa  204  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.766123  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1408  hypothetical protein  44.86 
 
 
288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3207  hypothetical protein  44.18 
 
 
300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1871  kinase-like protein  47.9 
 
 
255 aa  192  6e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2161  hypothetical protein  40.39 
 
 
296 aa  191  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.82045  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0521  hypothetical protein  40 
 
 
288 aa  186  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3783  hypothetical protein  37.74 
 
 
326 aa  182  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.492167  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02158  kinase-like protein  40.25 
 
 
290 aa  182  6e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.855425  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0494  kinase-like  41.06 
 
 
371 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0509  hypothetical protein  35.77 
 
 
293 aa  172  5e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.44966  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3799  glycerate kinase  37.5 
 
 
356 aa  133  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.390392  normal  0.456188 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1967  hypothetical protein  35.57 
 
 
349 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.136268 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07108  conserved hypothetical protein  35.62 
 
 
321 aa  122  5e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.769324  normal  0.661922 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1940  glycerate kinase  35.57 
 
 
349 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0354  glycerate kinase  32.7 
 
 
350 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1031  glycerate kinase  36.99 
 
 
334 aa  122  8e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.343108 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5068  hypothetical protein  33.6 
 
 
348 aa  120  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0459  Glycerate kinase  38.67 
 
 
359 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362414  normal  0.446739 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38956  predicted protein  33.9 
 
 
292 aa  105  7e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.591207  normal  0.183726 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0996  glycerate kinase  38.18 
 
 
328 aa  103  4e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.731332 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00210  conserved hypothetical protein  31.35 
 
 
312 aa  102  9e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1321  hypothetical protein  33.05 
 
 
325 aa  92.4  6e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0770352 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09161  putative kinase  27.71 
 
 
336 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565148 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0248  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  27.71 
 
 
336 aa  89.7  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.270225  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08971  putative kinase  28.23 
 
 
315 aa  89.7  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1154  hypothetical protein  30.92 
 
 
313 aa  88.2  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.332851  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0840  putative kinase  29.08 
 
 
314 aa  86.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0133007  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10421  putative kinase  24.7 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.200002  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41282  predicted protein  29.96 
 
 
358 aa  79.3  0.00000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0347701  normal  0.0262315 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14561  putative kinase  31.6 
 
 
352 aa  78.6  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08991  putative kinase  26.32 
 
 
314 aa  78.2  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.962103  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06771  putative kinase  24.58 
 
 
328 aa  69.3  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.436834  normal  0.433504 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01280  actin cross-linking, putative  29.38 
 
 
1320 aa  68.2  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0339  uridine kinase  26.83 
 
 
207 aa  48.5  0.0001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1720  phosphoribulokinase/uridine kinase  34.35 
 
 
226 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1267  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein B  25.83 
 
 
173 aa  47  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.482139  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1741  phosphoribulokinase/uridine kinase  32.79 
 
 
226 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1788  phosphoribulokinase/uridine kinase  32.79 
 
 
226 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3852  cyclic nucleotide-binding protein  29.5 
 
 
713 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.108661  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0128  putative fructose transport system kinase  28.8 
 
 
210 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496094  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3863  cyclic nucleotide-binding protein  31.51 
 
 
715 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0623706  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3723  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.51 
 
 
714 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3780  cyclic nucleotide-binding protein  31.51 
 
 
715 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>