44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2333 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2333  hypothetical protein  100 
 
 		 427 aa  845    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179446  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0801  hypothetical protein  38.48 
 
 		 530 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535256  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5456  hypothetical protein  36.1 
 
 		 453 aa  211  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.186969 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3350  hypothetical protein  34.73 
 
 		 463 aa  206  9e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2407  hypothetical protein  34.73 
 
 		 463 aa  206  9e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4275  hypothetical protein  30.1 
 
 		 455 aa  200  3.9999999999999996e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.644089  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2386  hypothetical protein  37.28 
 
 		 449 aa  191  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.164497  normal  0.439216 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2054  hypothetical protein  33.59 
 
 		 463 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.254497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3902  hypothetical protein  34.99 
 
 		 471 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11907  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2148  hypothetical protein  30.82 
 
 		 460 aa  169  7e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000428746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6127  hypothetical protein  31.39 
 
 		 509 aa  169  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0918  hypothetical protein  31.71 
 
 		 512 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1400  hypothetical protein  31.71 
 
 		 512 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1378  hypothetical protein  31.48 
 
 		 510 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.294238  normal  0.306366 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0692  hypothetical protein  34.58 
 
 		 553 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.850291  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2383  hypothetical protein  32.01 
 
 		 502 aa  166  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0916169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1989  hypothetical protein  34.58 
 
 		 529 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436263  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4543  hypothetical protein  31.02 
 
 		 492 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277933  normal  0.737886 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0191  hypothetical protein  31.86 
 
 		 487 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0897253 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0601  hypothetical protein  34.58 
 
 		 561 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1277  hypothetical protein  30.47 
 
 		 514 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5591  hypothetical protein  30.65 
 
 		 473 aa  161  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.52477 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5830  hypothetical protein  31.34 
 
 		 491 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5613  hypothetical protein  31.34 
 
 		 491 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0706869  normal  0.469482 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1311  hypothetical protein  31.02 
 
 		 514 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.127112 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5727  hypothetical protein  32.16 
 
 		 480 aa  160  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3144  hypothetical protein  30.93 
 
 		 488 aa  151  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1483  hypothetical protein  29.35 
 
 		 488 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6346  hypothetical protein  29.35 
 
 		 488 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7012  hypothetical protein  29.35 
 
 		 488 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0419358 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2880  hypothetical protein  37.96 
 
 		 231 aa  143  6e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2395  hypothetical protein  29.1 
 
 		 477 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.466905  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2219  hypothetical protein  31.71 
 
 		 469 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0363094  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3912  hypothetical protein  27.61 
 
 		 475 aa  95.9  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0937  hypothetical protein  29.82 
 
 		 564 aa  94  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2323  hypothetical protein  26.61 
 
 		 481 aa  56.2  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.696472  decreased coverage  0.0026081 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2317  hypothetical protein  26.94 
 
 		 572 aa  52.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0240  hypothetical protein  33.33 
 
 		 440 aa  51.2  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1129  hypothetical protein  29.01 
 
 		 514 aa  47.4  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0265862  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3959  hypothetical protein  27.13 
 
 		 514 aa  45.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.134116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4327  hypothetical protein  27.13 
 
 		 513 aa  45.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.547198 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4762  hypothetical protein  26.67 
 
 		 464 aa  43.9  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549997  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2407  hypothetical protein  26.89 
 
 		 441 aa  43.1  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.349259  normal  0.218874 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3039  hypothetical protein  20.21 
 
 		 480 aa  43.1  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0289115  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>