89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0590 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0590  LppC family lipoprotein  100 
 
 		 573 aa  1112    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.990028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04379  LppC superfamily  65.68 
 
 		 576 aa  688    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.418769  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1675  LppC family lipoprotein  54.43 
 
 		 576 aa  551  1e-156  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1749  hypothetical protein  54.61 
 
 		 576 aa  550  1e-155  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4995  putative lipoprotein  30.97 
 
 		 604 aa  183  7e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.713572  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57480  putative lipoprotein  30.77 
 
 		 604 aa  179  9e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0356  LppC putative lipoprotein  27.41 
 
 		 629 aa  162  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2102  LppC family lipoprotein  31.5 
 
 		 631 aa  158  3e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0757  LppC family lipoprotein  31.46 
 
 		 635 aa  157  7e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4684  LppC putative lipoprotein  28.24 
 
 		 603 aa  156  8e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0911  LppC family lipoprotein  29.72 
 
 		 602 aa  151  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4113  LppC putative lipoprotein  27.83 
 
 		 604 aa  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4419  lipoprotein, putative  27.46 
 
 		 604 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0598181  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13140  LppC lipoprotein  29.08 
 
 		 607 aa  140  8.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4523  LppC family lipoprotein  28.44 
 
 		 605 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1325  LppC family lipoprotein  28.07 
 
 		 605 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.967741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4399  LppC family lipoprotein  28.25 
 
 		 605 aa  130  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.204458 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2204  LppC family lipoprotein  32.15 
 
 		 628 aa  125  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.972417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0676  LppC family lipoprotein  27.5 
 
 		 705 aa  125  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0933  LppC family lipoprotein  27.32 
 
 		 605 aa  125  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0260  lipoprotein antigen  28.49 
 
 		 396 aa  125  3e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3145  ATPase  26.66 
 
 		 661 aa  125  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1933  putative lipoprotein  28.49 
 
 		 394 aa  125  3e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.814696  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0185  putative lipoprotein  28.01 
 
 		 625 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2463  LppC family lipoprotein  29.63 
 
 		 617 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.36704  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0389  LppC family lipoprotein  29.69 
 
 		 607 aa  110  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.743997  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2212  LppC family lipoprotein  28.77 
 
 		 621 aa  109  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.228557 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0273  LppC putative lipoprotein  28.29 
 
 		 603 aa  107  7e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000539466  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0300  putative lipoprotein  24.65 
 
 		 619 aa  104  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2923  hypothetical protein  26.29 
 
 		 603 aa  101  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004501  LppC putative lipoprotein  24.5 
 
 		 555 aa  100  7e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000349106  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3066  hypothetical protein  26 
 
 		 603 aa  99.8  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3354  putative lipoprotein  28.21 
 
 		 595 aa  97.4  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3692  LppC family lipoprotein  25.27 
 
 		 616 aa  97.4  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348011  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2200  LppC putative lipoprotein  26.45 
 
 		 596 aa  96.7  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0352  LppC family lipoprotein  25.72 
 
 		 634 aa  94.7  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.184471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3684  LppC family lipoprotein  24.05 
 
 		 627 aa  94  7e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0261  LppC family lipoprotein  24.26 
 
 		 628 aa  94  7e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0227  LppC family lipoprotein  25.39 
 
 		 634 aa  93.6  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.238094 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1177  LppC family lipoprotein  22.77 
 
 		 677 aa  93.2  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.055728 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03355  putative lipoprotein  25.83 
 
 		 666 aa  93.2  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0113  putative lipoprotein  24.28 
 
 		 653 aa  93.2  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4251  LppC family lipoprotein  27.01 
 
 		 626 aa  92.8  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.945552  hitchhiker  0.0000000616017 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00891  hypothetical protein  22.55 
 
 		 603 aa  91.3  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4099  LppC family lipoprotein  24.28 
 
 		 634 aa  88.6  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4187  LppC family lipoprotein  24.28 
 
 		 634 aa  87.8  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3989  LppC family lipoprotein  24.28 
 
 		 634 aa  87.8  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3880  LppC family lipoprotein  23.78 
 
 		 627 aa  87.4  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0981735 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2654  putative lipoprotein LppC  25.71 
 
 		 603 aa  86.3  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2282  putative lipoprotein-like protein  25.84 
 
 		 510 aa  84.7  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4069  LppC family lipoprotein  24.02 
 
 		 634 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3782  LppC family lipoprotein  24.77 
 
 		 682 aa  76.3  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0529967  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0551  LppC family lipoprotein  22.8 
 
 		 678 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.551185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0316  Putative lipoprotein-like protein  25.6 
 
 		 612 aa  75.5  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.915463  hitchhiker  0.000474295 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0143  lipoprotein, putative  25.6 
 
 		 612 aa  75.5  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3339  putative lipoprotein  22.8 
 
 		 678 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3584  LppC family lipoprotein  24.09 
 
 		 704 aa  74.7  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.129912 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3693  LppC putative lipoprotein  22.75 
 
 		 658 aa  74.3  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0558  LppC family lipoprotein  22.8 
 
 		 678 aa  74.3  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03014  hypothetical protein  22.8 
 
 		 678 aa  73.9  0.000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02965  hypothetical protein  22.8 
 
 		 678 aa  73.9  0.000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3442  putative lipoprotein  22.87 
 
 		 678 aa  73.6  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4466  putative lipoprotein  22.87 
 
 		 678 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3629  putative lipoprotein  22.87 
 
 		 678 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2394  putative lipoprotein-like protein  25.49 
 
 		 617 aa  73.2  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.527391  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3625  putative lipoprotein  22.56 
 
 		 678 aa  71.2  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3624  LppC family lipoprotein  23.24 
 
 		 680 aa  67.4  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3522  LppC superfamily  22.32 
 
 		 680 aa  67.8  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.173213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3559  LppC superfamily  22.32 
 
 		 680 aa  67.8  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3451  LppC superfamily  22.32 
 
 		 680 aa  67.8  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0252  LppC family lipoprotein  24.8 
 
 		 624 aa  67  0.0000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.625916  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3453  LppC superfamily  22.32 
 
 		 680 aa  67  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3619  LppC family protein  22.32 
 
 		 680 aa  67  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4336  LppC family lipoprotein  24.16 
 
 		 674 aa  63.2  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.765962  normal  0.192423 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0314  LppC family lipoprotein  22.89 
 
 		 672 aa  63.2  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.92899  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0740  LppC precursor  21.56 
 
 		 604 aa  62.4  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.164476  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0308  LppC family lipoprotein  22.88 
 
 		 672 aa  61.2  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0539  LppC family lipoprotein  23.35 
 
 		 657 aa  58.9  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0475  putative LppC lipoprotein  23.35 
 
 		 689 aa  58.9  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1120  hypothetical protein  23.35 
 
 		 689 aa  58.9  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3863  Extracellular ligand-binding receptor  30.66 
 
 		 651 aa  55.1  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0863227 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1037  extracellular ligand-binding receptor  25.1 
 
 		 643 aa  54.3  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000129321  unclonable  0.0000121148 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0105  ABC-type transport systems, periplasmic component  25 
 
 		 627 aa  50.8  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1694  putative lipoprotein-like  23.4 
 
 		 525 aa  50.4  0.00009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.97529  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3957  hypothetical protein  32.48 
 
 		 400 aa  49.3  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4432  hypothetical protein  21.12 
 
 		 721 aa  49.7  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1387  Extracellular ligand-binding receptor  26.53 
 
 		 424 aa  46.2  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1763  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  27.27 
 
 		 677 aa  43.9  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1534  putative lipoprotein-like protein  28.49 
 
 		 402 aa  43.5  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.75635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>