37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0374 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0374  hypothetical protein  100 
 
 
621 aa  1269    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6055  hypothetical protein  36.12 
 
 
696 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  27.31 
 
 
1164 aa  62  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  30.05 
 
 
620 aa  61.6  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  26.32 
 
 
588 aa  58.9  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0372  hypothetical protein  27 
 
 
587 aa  58.9  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  24.6 
 
 
1249 aa  57.8  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  27.96 
 
 
444 aa  57.8  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6053  hypothetical protein  25.87 
 
 
570 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  25.84 
 
 
679 aa  55.1  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  24.31 
 
 
548 aa  54.7  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  26.89 
 
 
615 aa  53.9  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  23.92 
 
 
1228 aa  53.5  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  26.32 
 
 
564 aa  52  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  25.94 
 
 
614 aa  52  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  25.94 
 
 
614 aa  52  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0337  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  26.53 
 
 
605 aa  51.6  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  28.27 
 
 
599 aa  51.6  0.00005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1530  hypothetical protein  23.98 
 
 
1146 aa  49.7  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.532706  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1501  hypothetical protein  23.98 
 
 
1146 aa  49.7  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0436  GTP-binding protein  24.48 
 
 
569 aa  49.7  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  22.73 
 
 
546 aa  50.4  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  26.09 
 
 
674 aa  49.3  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  25.95 
 
 
589 aa  48.5  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1545  GTP-binding protein  23.98 
 
 
569 aa  48.1  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.712051  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  24.53 
 
 
605 aa  47.8  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1096  GTP-binding protein, HSR1-related  24.87 
 
 
664 aa  47  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  22.63 
 
 
605 aa  46.2  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0403  dynamin family protein  23.81 
 
 
693 aa  45.4  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1013  hypothetical protein  25.27 
 
 
1145 aa  44.7  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.445275  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  22.69 
 
 
1219 aa  44.3  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2545  dynamin  23.6 
 
 
390 aa  44.3  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0649757  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  21.93 
 
 
1219 aa  43.9  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0896  hypothetical protein  25.34 
 
 
502 aa  43.9  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.128039  normal  0.710649 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0830  hypothetical protein  39.19 
 
 
712 aa  43.9  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00896739  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  22.22 
 
 
1219 aa  43.9  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0815  GTPase  39.19 
 
 
712 aa  43.9  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>