59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0191 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0191  Tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 
834 aa  1670    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.621128  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3088  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.1 
 
 
943 aa  98.2  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.258254  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4174  serine/threonine protein kinase  26.1 
 
 
990 aa  82.4  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.957673  normal  0.29957 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3570  serine/threonine protein kinase  26.12 
 
 
1479 aa  69.7  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0837409 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0790  putative adenylate/guanylate cyclase  31.35 
 
 
449 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0810  putative adenylate/guanylate cyclase  31.35 
 
 
449 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190298  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0795  putative adenylate/guanylate cyclase  31.35 
 
 
449 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3980  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.19 
 
 
1023 aa  68.6  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1184  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  23.03 
 
 
631 aa  63.9  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.78 
 
 
810 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1433  protein kinase  24.37 
 
 
963 aa  62.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.698997  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2983  serine/threonine protein kinase  27.44 
 
 
982 aa  60.8  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.28698  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2796  serine/threonine protein kinase  29.9 
 
 
982 aa  60.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0264511  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11929  lignin peroxidase lipJ  27.17 
 
 
462 aa  59.3  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.831009  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2891  serine/threonine protein kinase  27.07 
 
 
985 aa  58.5  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.242068  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 
878 aa  57.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.39 
 
 
632 aa  57.4  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3642  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  21.92 
 
 
622 aa  56.6  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1942  TPR repeat-containing protein  20.15 
 
 
626 aa  56.2  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.420919 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0534  adenylate/guanylate cyclase  21.88 
 
 
642 aa  56.2  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397996  normal  0.0249995 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3340  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  21.92 
 
 
622 aa  55.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.309134 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0089  adenylate/guanylate cyclase  22.2 
 
 
647 aa  53.9  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1384  putative adenylate cyclase  22.95 
 
 
581 aa  53.9  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316041  normal  0.0440449 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1071  adenylate/guanylate cyclase  28.02 
 
 
680 aa  52.8  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212449  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  27.64 
 
 
1037 aa  52.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3146  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  21.48 
 
 
598 aa  52.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  25.71 
 
 
745 aa  52.4  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11143  hypothetical protein  36.99 
 
 
164 aa  52  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1263  adenylate/guanylate cyclase  30.97 
 
 
1027 aa  51.2  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505762  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4280  transcriptional regulator domain-containing protein  24.66 
 
 
531 aa  50.8  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2362  serine/threonine protein kinase  27.49 
 
 
1435 aa  50.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0458945 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6629  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  23.82 
 
 
568 aa  50.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2321  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  22.97 
 
 
568 aa  50.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154208  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4393  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.99 
 
 
1019 aa  50.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.618951  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1254  adenylate/guanylate cyclase  30.97 
 
 
1027 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419758  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1237  adenylate/guanylate cyclase  30.97 
 
 
1027 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1652  adenylate/guanylate cyclase  26.26 
 
 
275 aa  48.9  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal  0.0809005 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0770  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.14 
 
 
757 aa  48.9  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.424396 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2091  putative adenylate/guanylate cyclase  31.96 
 
 
263 aa  48.9  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.832203  normal  0.176351 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3450  adenylate/guanylate cyclase  23.71 
 
 
652 aa  48.1  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3418  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  20.55 
 
 
595 aa  47.8  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565429  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0115  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
472 aa  47.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0078  adenylate/guanylate cyclase  28.93 
 
 
471 aa  47.8  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.294245  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  28.75 
 
 
1358 aa  47  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4613  putative adenylate/guanylate cyclase  32.32 
 
 
261 aa  47.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.863604  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  22.98 
 
 
280 aa  47.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  25.71 
 
 
1979 aa  46.6  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2395  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.6 
 
 
736 aa  46.6  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1855  adenylate/guanylate cyclase  26.6 
 
 
275 aa  45.8  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.527311  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4563  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  22.52 
 
 
624 aa  46.2  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.724776 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3419  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  22.44 
 
 
723 aa  46.2  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1265  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.88 
 
 
1087 aa  45.8  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  22.01 
 
 
927 aa  45.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5448  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.98 
 
 
629 aa  45.1  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296082 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4168  putative adenylate/guanylate cyclase  32.38 
 
 
271 aa  45.1  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.697513  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4092  adenylate/guanylate cyclase  32.38 
 
 
271 aa  45.1  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4322  putative adenylate/guanylate cyclase  32.38 
 
 
271 aa  44.7  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  24.86 
 
 
462 aa  44.3  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  24.05 
 
 
929 aa  44.3  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>