More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5542 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5542  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  100 
 
 		 610 aa  1245    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4132  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  43.68 
 
 		 610 aa  460  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.300253 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1114  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  34.11 
 
 		 605 aa  362  2e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0988  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  36.06 
 
 		 615 aa  351  2e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928875  normal  0.94372 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3595  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  36.14 
 
 		 607 aa  345  1e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0161652  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2141  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  34.2 
 
 		 624 aa  326  6e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2411  MutS domain-containing protein  33.94 
 
 		 595 aa  318  1e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.133991  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2123  MutS domain-containing protein  33.94 
 
 		 595 aa  318  1e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2469  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.7 
 
 		 626 aa  315  1.9999999999999998e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2027  MutS-like mismatch repair protein, ATPase  32.25 
 
 		 596 aa  307  3e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0247  DNA mismatch repair protein MutS-like protein  33.7 
 
 		 601 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2547  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  40.98 
 
 		 597 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04875  DNA mismatch repair protein mutS  33.33 
 
 		 601 aa  305  2.0000000000000002e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0156  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  32.78 
 
 		 586 aa  303  5.000000000000001e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2709  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  33.39 
 
 		 590 aa  301  2e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0186895  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0359  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  34.73 
 
 		 598 aa  292  1e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2236  DNA mismatch repair protein  32.47 
 
 		 590 aa  288  2.9999999999999996e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1406  DNA mismatch repair protein MutS-like  40.98 
 
 		 597 aa  283  6.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1070  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  32.2 
 
 		 593 aa  282  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2424  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  41.11 
 
 		 594 aa  274  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.720949  normal  0.166887 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2451  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  45.93 
 
 		 597 aa  245  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.412357  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0656  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.65 
 
 		 604 aa  240  4e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3182  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  32.38 
 
 		 618 aa  234  3e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0562  DNA mismatch repair protein MutS-like  42.86 
 
 		 243 aa  156  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0886  MutS domain-containing protein  32.54 
 
 		 557 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.437767  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2122  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  33.99 
 
 		 536 aa  133  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0365547  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2085  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  33.99 
 
 		 536 aa  133  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00891152  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1160  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  30.56 
 
 		 554 aa  128  4.0000000000000003e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2383  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  31.87 
 
 		 558 aa  127  6e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.356876  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0706  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  34.58 
 
 		 438 aa  123  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.574952  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1660  MutS family protein  30.52 
 
 		 538 aa  119  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0221998  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0305  MutS domain-containing protein  32.58 
 
 		 521 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.667577  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0300  MutS domain-containing protein  32.2 
 
 		 521 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0552  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  30.04 
 
 		 555 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0622  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  43.44 
 
 		 112 aa  100  9e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000499338  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1769  DNA mismatch repair protein MutS  28.95 
 
 		 846 aa  96.3  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0330  DNA mismatch repair protein MutS  30.59 
 
 		 917 aa  96.3  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  26.31 
 
 		 872 aa  94.4  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  30.71 
 
 		 873 aa  94  7e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1768  DNA mismatch repair protein MutS  28.2 
 
 		 846 aa  92.4  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2380  DNA mismatch repair protein MutS  30.95 
 
 		 893 aa  92.4  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  26.7 
 
 		 871 aa  90.5  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  29.34 
 
 		 860 aa  89.7  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  28.26 
 
 		 881 aa  88.6  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  30.49 
 
 		 903 aa  87  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  30.9 
 
 		 872 aa  87  9e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0062  MutS2 family protein  29.67 
 
 		 826 aa  87  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21825  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  30.9 
 
 		 872 aa  87  9e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0993  DNA mismatch repair protein MutS  29.25 
 
 		 882 aa  87  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0273389  normal  0.417331 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1089  DNA mismatch repair protein MutS  29.25 
 
 		 882 aa  86.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05155  putative DNA mismatch repair protein MutS  29.96 
 
 		 869 aa  86.7  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3751  DNA mismatch repair protein MutS  28.99 
 
 		 855 aa  86.7  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7097  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  28.8 
 
 		 443 aa  86.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000373438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  30.74 
 
 		 855 aa  86.7  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  30.04 
 
 		 892 aa  86.7  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1151  DNA mismatch repair protein MutS  28.14 
 
 		 882 aa  86.3  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75556  normal  0.534383 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02590  mismatch repair-related protein, putative  27.92 
 
 		 1205 aa  85.9  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.102659  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2226  DNA mismatch repair protein MutS  29.92 
 
 		 956 aa  85.9  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.137389  normal  0.561287 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  29.06 
 
 		 868 aa  85.1  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1619  DNA mismatch repair protein MutS  28.46 
 
 		 897 aa  84.7  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.510747 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  30.12 
 
 		 882 aa  84.3  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  27.61 
 
 		 872 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3054  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  28.63 
 
 		 437 aa  82.4  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.613085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  28.92 
 
 		 882 aa  82  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0119  DNA mismatch repair protein MutS  31.74 
 
 		 931 aa  81.6  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.893903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1111  DNA mismatch repair protein MutS  29.96 
 
 		 922 aa  81.3  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.88674  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  32.13 
 
 		 863 aa  81.6  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0147  DNA mismatch repair protein MutS  28.45 
 
 		 856 aa  81.6  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.692226  normal  0.372979 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1332  DNA mismatch repair protein MutS  31.33 
 
 		 930 aa  81.6  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1159  DNA mismatch repair protein MutS  29.18 
 
 		 850 aa  81.3  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0179722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0292  DNA mismatch repair protein MutS  28.95 
 
 		 784 aa  81.3  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.518405  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1115  DNA mismatch repair protein MutS  28.57 
 
 		 793 aa  80.9  0.00000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01708  protein required for mismatch repair in mitosis and meiosis (Eurofung)  26.72 
 
 		 1186 aa  80.5  0.00000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  32.38 
 
 		 872 aa  80.5  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  29.56 
 
 		 881 aa  79.7  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  27.59 
 
 		 863 aa  79.7  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1832  DNA mismatch repair protein MutS  29.06 
 
 		 882 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  31.14 
 
 		 880 aa  79.7  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3706  DNA mismatch repair protein MutS  30.23 
 
 		 1085 aa  80.1  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0191943 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2274  DNA mismatch repair protein MutS  27.07 
 
 		 911 aa  79.7  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103313 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3768  DNA mismatch repair protein MutS  29.77 
 
 		 968 aa  80.1  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02583  DNA mismatch repair protein  28.51 
 
 		 853 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.858461  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0955  DNA mismatch repair protein MutS  28.51 
 
 		 853 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  28.93 
 
 		 892 aa  79  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  28.93 
 
 		 894 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3531  DNA mismatch repair protein MutS  29.77 
 
 		 1088 aa  79.3  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0260  DNA mismatch repair protein MutS  27.5 
 
 		 804 aa  79.3  0.0000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.76262  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0979  DNA mismatch repair protein MutS  28.51 
 
 		 853 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.462533 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3816  DNA mismatch repair protein MutS  28.93 
 
 		 892 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  28.93 
 
 		 892 aa  79  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2860  DNA mismatch repair protein MutS  28.51 
 
 		 853 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2871  DNA mismatch repair protein MutS  28.51 
 
 		 853 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3986  DNA mismatch repair protein MutS  28.51 
 
 		 853 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.724345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4552  DNA mismatch repair protein MutS  28.03 
 
 		 871 aa  79.3  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3781  DNA mismatch repair protein MutS  28.93 
 
 		 892 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0472636 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3143  DNA mismatch repair protein MutS  28.51 
 
 		 853 aa  79.3  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02548  hypothetical protein  28.51 
 
 		 853 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.766489  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  27.76 
 
 		 900 aa  78.6  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  28.51 
 
 		 890 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0824  DNA mismatch repair protein MutS  28.39 
 
 		 804 aa  78.6  0.0000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>