33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2978 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2978  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  751    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.484225 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4778  hypothetical protein  33.22 
 
 		 316 aa  149  5e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.041833  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0503  hypothetical protein  27.62 
 
 		 362 aa  99.4  9e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0677  dienelactone hydrolase  28.05 
 
 		 394 aa  94.7  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0342  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  26.26 
 
 		 381 aa  90.5  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2468  hypothetical protein  26.2 
 
 		 425 aa  88.6  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.425781  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0637  dienelactone hydrolase  26.62 
 
 		 392 aa  87.8  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3747  dienelactone hydrolase  25.57 
 
 		 392 aa  86.7  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3562  dienelactone hydrolase  26.9 
 
 		 392 aa  86.3  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2433  hypothetical protein  28.64 
 
 		 345 aa  84  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1930  hypothetical protein  25.34 
 
 		 374 aa  80.9  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.173781  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3838  hypothetical protein  25.87 
 
 		 360 aa  78.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00401866  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3950  hypothetical protein  25.87 
 
 		 328 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.992848 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3924  hypothetical protein  25.87 
 
 		 385 aa  77.8  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0127899  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1267  hypothetical protein  26.87 
 
 		 329 aa  77.8  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2932  hypothetical protein  26.17 
 
 		 399 aa  73.6  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2461  hypothetical protein  27.01 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29170  hypothetical protein  29.68 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3262  hypothetical protein  24.57 
 
 		 435 aa  60.8  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0112416 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1726  hypothetical protein  28.4 
 
 		 710 aa  55.1  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1391  hypothetical protein  23.1 
 
 		 427 aa  51.6  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.298142 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2712  peptidase S15  36.67 
 
 		 309 aa  50.4  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.85912  decreased coverage  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2578  serine/threonine protein kinase  27.33 
 
 		 985 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.790371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  38.1 
 
 		 298 aa  47.4  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  26.91 
 
 		 254 aa  47.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3330  hypothetical protein  23.31 
 
 		 396 aa  47  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.225742  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3664  hypothetical protein  40.91 
 
 		 669 aa  46.2  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  39.29 
 
 		 299 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2670  Alpha/beta hydrolase  40 
 
 		 304 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7069  carboxymethylenebutenolidase  26.29 
 
 		 408 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599928  normal  0.137084 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5622  Acetyl xylan esterase  24.73 
 
 		 407 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.951758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  31.67 
 
 		 292 aa  43.5  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1326  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  26.95 
 
 		 277 aa  43.5  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>