More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1521 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1521  chaperone protein DnaJ  100 
 
 
388 aa  794    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173202  normal  0.704316 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4973  chaperone protein DnaJ  75.32 
 
 
386 aa  580  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0482542  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3209  chaperone protein DnaJ  64.68 
 
 
385 aa  502  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.492328  normal  0.368243 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0071  molecular chaperone, heat shock protein  63.8 
 
 
379 aa  497  1e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0979  hypothetical protein  58.75 
 
 
379 aa  483  1e-135  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.127432 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6905  chaperone protein DnaJ  59.64 
 
 
389 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.725874  normal  0.252864 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1088  chaperone protein DnaJ  48.35 
 
 
394 aa  382  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.038983  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0854  chaperone protein DnaJ  49.24 
 
 
395 aa  373  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000496587  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2125  chaperone protein DnaJ  47.67 
 
 
385 aa  372  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128449  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1872  chaperone protein DnaJ  46.95 
 
 
395 aa  372  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000340868  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5050  chaperone protein DnaJ  52.74 
 
 
368 aa  364  2e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1582  chaperone protein DnaJ  48.1 
 
 
395 aa  362  7.0000000000000005e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.633859 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08256  chaperone protein dnaJ  52.47 
 
 
376 aa  358  9.999999999999999e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.482747  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1487  chaperone protein DnaJ  47.04 
 
 
382 aa  347  2e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.992778  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1422  chaperone protein DnaJ  44.72 
 
 
400 aa  342  9e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.234078  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0455  chaperone protein DnaJ  49.22 
 
 
373 aa  338  9.999999999999999e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1691  chaperone protein DnaJ  46.63 
 
 
401 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.211452  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1776  chaperone protein DnaJ  56.37 
 
 
383 aa  335  7.999999999999999e-91  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0730  chaperone protein DnaJ  43.96 
 
 
386 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1797  chaperone protein DnaJ  45.64 
 
 
379 aa  313  3.9999999999999997e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1398  co-chaperone protein DnaJ  43.96 
 
 
356 aa  311  2e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0366797  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1180  molecular chaperone, DnaJ family  43.96 
 
 
356 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.642107  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4726  chaperone protein DnaJ  43.44 
 
 
375 aa  308  8e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  42.24 
 
 
377 aa  308  9e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1207  chaperone protein DnaJ  43.96 
 
 
359 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2056  chaperone protein DnaJ  44.19 
 
 
374 aa  305  8.000000000000001e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2499  chaperone protein DnaJ  43.81 
 
 
380 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47726  normal  0.719527 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4727  chaperone protein DnaJ  43.7 
 
 
374 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  44.96 
 
 
382 aa  302  6.000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0706  chaperone protein DnaJ  43.7 
 
 
374 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.421383  hitchhiker  0.00995799 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  42.38 
 
 
374 aa  302  7.000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4592  chaperone protein DnaJ  43.44 
 
 
374 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.356534 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2006  chaperone protein DnaJ  43.22 
 
 
379 aa  302  8.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2001  chaperone protein DnaJ  43.22 
 
 
379 aa  302  8.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2828  chaperone protein DnaJ  44.42 
 
 
376 aa  301  9e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000114983  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62960  chaperone protein DnaJ  43.64 
 
 
377 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.377489  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1539  molecular chaperone protein DnaJ  44.33 
 
 
372 aa  300  2e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0617832  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2495  chaperone protein DnaJ  42.67 
 
 
373 aa  301  2e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0561427  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4194  chaperone protein DnaJ  44.94 
 
 
380 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.993015  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1321  chaperone protein DnaJ  42.53 
 
 
386 aa  299  4e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42960  chaperone protein DnaJ  41.93 
 
 
375 aa  299  5e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1751  chaperone protein DnaJ  39.16 
 
 
376 aa  298  8e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  42.64 
 
 
379 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1172  chaperone protein DnaJ  45.5 
 
 
382 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.696744  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  42.64 
 
 
379 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  42.64 
 
 
379 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  42.64 
 
 
379 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  42.64 
 
 
379 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  40.36 
 
 
370 aa  297  3e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2834  chaperone protein DnaJ  45.5 
 
 
382 aa  297  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0764  chaperone protein DnaJ  41.94 
 
 
397 aa  296  4e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.252459  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2765  chaperone protein DnaJ  45.5 
 
 
382 aa  296  4e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0750  chaperone protein DnaJ  42.42 
 
 
373 aa  296  6e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.317269  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4504  dnaJ protein  44.94 
 
 
380 aa  295  7e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  41.09 
 
 
376 aa  295  8e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  41.09 
 
 
376 aa  295  8e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  41.09 
 
 
376 aa  295  8e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0579  chaperone protein DnaJ  41.28 
 
 
382 aa  295  9e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0487555  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5480  chaperone protein DnaJ  43.9 
 
 
377 aa  294  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  41.09 
 
 
376 aa  295  1e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  41.09 
 
 
376 aa  295  1e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  41.09 
 
 
376 aa  295  1e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1514  chaperone DnaJ  40.87 
 
 
375 aa  294  1e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  41.09 
 
 
376 aa  295  1e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  41.09 
 
 
376 aa  295  1e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  40.83 
 
 
376 aa  294  2e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  42.89 
 
 
377 aa  294  2e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3623  chaperone protein DnaJ  41.9 
 
 
375 aa  294  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1460  chaperone protein DnaJ  44.35 
 
 
385 aa  294  2e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0211  chaperone protein DnaJ  43.93 
 
 
385 aa  294  2e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1184  chaperone protein DnaJ  45.25 
 
 
380 aa  293  3e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0143708 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  42.38 
 
 
377 aa  293  4e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3573  chaperone protein DnaJ  43.52 
 
 
374 aa  292  5e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1988  chaperone protein DnaJ  41.86 
 
 
379 aa  292  7e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.731806  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0623  chaperone protein DnaJ  41.71 
 
 
384 aa  292  8e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.187499  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4393  chaperone protein DnaJ  40.36 
 
 
370 aa  291  1e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.354344  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1311  chaperone protein DnaJ  43.29 
 
 
396 aa  291  1e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3504  chaperone protein DnaJ  43.52 
 
 
374 aa  291  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000140999  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0212  chaperone protein DnaJ  44.91 
 
 
372 aa  291  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.321042  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3531  chaperone protein DnaJ  45.08 
 
 
372 aa  291  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.053078  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3658  chaperone protein DnaJ  41.6 
 
 
378 aa  290  2e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3852  chaperone protein DnaJ  41.86 
 
 
378 aa  290  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2634  chaperone protein DnaJ  41.04 
 
 
380 aa  290  4e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00367611  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2732  chaperone protein DnaJ  44.27 
 
 
374 aa  290  4e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000152871  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3093  chaperone DnaJ  41.79 
 
 
381 aa  289  5.0000000000000004e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0535684  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0034  chaperone protein DnaJ  46.49 
 
 
373 aa  288  1e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4692  chaperone protein DnaJ  42.5 
 
 
374 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.811586  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3432  chaperone protein DnaJ  42.01 
 
 
388 aa  288  1e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0520699  normal  0.082957 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12790  chaperone protein DnaJ  40.77 
 
 
375 aa  288  1e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000108352  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5708  chaperone protein DnaJ  43.65 
 
 
371 aa  288  1e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2325  chaperone protein DnaJ  40.93 
 
 
376 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0502  chaperone protein DnaJ  40.93 
 
 
376 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2436  chaperone protein DnaJ  42.75 
 
 
380 aa  287  2e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00797991  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2204  chaperone protein DnaJ  40.93 
 
 
376 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1097  chaperone protein DnaJ  40.93 
 
 
376 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02252  chaperone protein DnaJ  42.34 
 
 
389 aa  288  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.139238  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0269  chaperone protein DnaJ  41.82 
 
 
378 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0722  chaperone protein DnaJ  41.82 
 
 
378 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1377  chaperone protein DnaJ  40.1 
 
 
375 aa  287  2e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0753  chaperone protein DnaJ  41.82 
 
 
378 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>