34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1490 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1490  hypothetical protein  100 
 
 		 348 aa  724    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0815411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0568  putative transcriptional regulator protein  63.13 
 
 		 346 aa  456  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0087  transcriptional regulator  50 
 
 		 348 aa  347  2e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2910  transcriptional regulator  51.04 
 
 		 359 aa  341  1e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.246584 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4751  transcriptional regulator-like protein  48.21 
 
 		 345 aa  338  9e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0885788  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1199  putative transcriptional regulator protein  31.4 
 
 		 335 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.069662 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4566  transcriptional regulator protein-like protein  24.19 
 
 		 360 aa  77  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.439608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4096  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.05 
 
 		 334 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  22.81 
 
 		 339 aa  68.2  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1294  regulatory protein, DeoR  22.13 
 
 		 336 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0437  hypothetical protein  21.92 
 
 		 326 aa  66.2  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0494  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  22.91 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1808  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  22.48 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.503322  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0570  hypothetical protein  25.8 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.59 
 
 		 347 aa  62.4  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2437  hypothetical protein  19.93 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0841  hypothetical protein  21.59 
 
 		 351 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.189594 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0970  transcriptional regulator-like protein  20.61 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1438  hypothetical protein  20.81 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1421  hypothetical protein  22.36 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.182129 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3146  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.2 
 
 		 351 aa  51.6  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0956  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.25 
 
 		 327 aa  51.6  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0573  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.19 
 
 		 317 aa  50.1  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000975752  normal  0.773563 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2446  hypothetical protein  23.26 
 
 		 324 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2154  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.48 
 
 		 324 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2768  hypothetical protein  46.94 
 
 		 57 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.945651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2444  Helix-turn-helix type 11 domain protein  19.75 
 
 		 319 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3086  transcriptional regulator, putative  21.82 
 
 		 334 aa  47.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0499  hypothetical protein  21.67 
 
 		 229 aa  46.2  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.477682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2004  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  22.71 
 
 		 321 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.532666  normal  0.656208 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2780  Helix-turn-helix type 11 domain protein  20.61 
 
 		 333 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00079876  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0473  transcriptional regulator, putative  21.6 
 
 		 334 aa  44.3  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12131  hypothetical protein  23.86 
 
 		 332 aa  43.1  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000529286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2599  transcriptional regulator-like protein  20.94 
 
 		 340 aa  43.1  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.781453  normal  0.328063 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>