More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1095 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1095  ABC transporter related protein  100 
 
 		 587 aa  1182    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.850281  normal  0.198173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3308  ABC transporter related  60.68 
 
 		 586 aa  715    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682367  hitchhiker  0.0000512121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2164  ABC transporter transmembrane region  64.57 
 
 		 585 aa  756    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2232  ABC transporter related  65.42 
 
 		 586 aa  789    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  34.68 
 
 		 597 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  34.68 
 
 		 597 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  32.33 
 
 		 600 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  33.81 
 
 		 598 aa  322  1.9999999999999998e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  33.45 
 
 		 614 aa  321  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  33.91 
 
 		 608 aa  320  3.9999999999999996e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  34.16 
 
 		 617 aa  320  5e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  32.3 
 
 		 597 aa  318  2e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  32.93 
 
 		 622 aa  315  9.999999999999999e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  32.37 
 
 		 607 aa  311  2e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  32.92 
 
 		 620 aa  310  6.999999999999999e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  31.77 
 
 		 594 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  32.57 
 
 		 609 aa  306  5.0000000000000004e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  31.54 
 
 		 635 aa  304  2.0000000000000002e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  32.44 
 
 		 597 aa  303  5.000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  31.89 
 
 		 602 aa  303  8.000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  34.11 
 
 		 620 aa  302  1e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  32.71 
 
 		 607 aa  301  2e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.81 
 
 		 589 aa  300  4e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2250  ABC transporter, transmembrane region  33.72 
 
 		 634 aa  300  4e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  33.63 
 
 		 594 aa  298  1e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1782  ABC transporter-related protein  32.77 
 
 		 605 aa  296  7e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.563719  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  33.07 
 
 		 666 aa  294  4e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  29.71 
 
 		 618 aa  293  4e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.92 
 
 		 598 aa  293  7e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3955  ABC transporter, transmembrane region  32.57 
 
 		 631 aa  292  9e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375009  decreased coverage  0.0046772 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.73 
 
 		 598 aa  292  1e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2049  ABC transporter related protein  32.7 
 
 		 663 aa  292  1e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.32 
 
 		 721 aa  292  1e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3941  ABC transporter, transmembrane region  32.38 
 
 		 631 aa  290  4e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4015  ABC transporter, transmembrane region  32.38 
 
 		 631 aa  290  4e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  30.12 
 
 		 637 aa  290  6e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  30.05 
 
 		 617 aa  290  7e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  29.47 
 
 		 631 aa  289  9e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0545  ABC transporter related  30.46 
 
 		 602 aa  288  1e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11298  drug ABC transporter ATP-binding protein  34.58 
 
 		 631 aa  289  1e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  34.21 
 
 		 640 aa  288  1e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.97 
 
 		 598 aa  288  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.15 
 
 		 598 aa  287  4e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  31.73 
 
 		 598 aa  286  5e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3227  ABC transporter-related protein  32.06 
 
 		 675 aa  286  5e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  29.32 
 
 		 613 aa  287  5e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  32.93 
 
 		 663 aa  287  5e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2613  ABC transporter, transmembrane region  31.21 
 
 		 625 aa  286  5.999999999999999e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.200186  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  31.71 
 
 		 611 aa  286  7e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000031667  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  32.31 
 
 		 598 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.12 
 
 		 598 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  32.12 
 
 		 598 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  32.12 
 
 		 598 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.12 
 
 		 598 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  31.09 
 
 		 618 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  33.8 
 
 		 669 aa  285  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  32.69 
 
 		 587 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  30.46 
 
 		 594 aa  284  3.0000000000000004e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.92 
 
 		 618 aa  283  4.0000000000000003e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  30.64 
 
 		 594 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  33.52 
 
 		 587 aa  282  1e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  33.52 
 
 		 587 aa  282  1e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  33.52 
 
 		 587 aa  282  1e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.52 
 
 		 587 aa  282  1e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  31.19 
 
 		 590 aa  282  1e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  32.69 
 
 		 587 aa  282  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.52 
 
 		 587 aa  282  1e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3399  ABC transporter related  30.09 
 
 		 614 aa  282  1e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  31.67 
 
 		 600 aa  282  1e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  32.22 
 
 		 600 aa  281  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2690  multidrug resistance ABC transporter  31.55 
 
 		 615 aa  281  2e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0586583  normal  0.13127 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  32.86 
 
 		 602 aa  282  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  31.62 
 
 		 611 aa  281  3e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.85 
 
 		 677 aa  281  3e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.33 
 
 		 587 aa  280  5e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.33 
 
 		 587 aa  280  6e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0858  ABC transporter, transmembrane region  29.38 
 
 		 680 aa  280  6e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.438545  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1267  ABC transporter related  31.13 
 
 		 623 aa  279  8e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00288622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6290  ABC transporter related protein  30.89 
 
 		 598 aa  279  8e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  31.12 
 
 		 614 aa  279  1e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27200  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.28 
 
 		 702 aa  279  1e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.663509  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2015  ABC transporter related  29.7 
 
 		 631 aa  279  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.945643  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  31.12 
 
 		 636 aa  279  1e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3355  ABC transporter transmembrane region  29.97 
 
 		 672 aa  278  2e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0148  ABC transporter related  30.07 
 
 		 628 aa  278  2e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7144  ABC transporter related  29.06 
 
 		 632 aa  278  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6412  ABC transporter related  33.33 
 
 		 649 aa  278  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5995  ABC transporter related  28.98 
 
 		 632 aa  277  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1071  ABC transporter related protein  31.98 
 
 		 733 aa  277  5e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  32.37 
 
 		 608 aa  276  7e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2622  ABC transporter transmembrane region  29.31 
 
 		 606 aa  276  8e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499231  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1379  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.93 
 
 		 615 aa  276  8e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  30.65 
 
 		 603 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3754  ABC transporter transmembrane region  31.89 
 
 		 613 aa  275  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0972  ABC transporter transmembrane region  32.28 
 
 		 691 aa  273  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0935036 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  31.63 
 
 		 602 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  31.3 
 
 		 671 aa  273  5.000000000000001e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0881  ATPase  30.54 
 
 		 592 aa  273  6e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  30.5 
 
 		 582 aa  273  8.000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3365  ABC transporter related  32.96 
 
 		 587 aa  273  9e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000714306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>