More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0291 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0291  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
312 aa  636    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3414  glycosyl transferase family 2  60.07 
 
 
306 aa  366  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0939  glycosyl transferase family 2  44.59 
 
 
317 aa  263  3e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000145876 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3309  glycosyl transferase family 2  43.65 
 
 
317 aa  260  3e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4279  glycosyl transferase family protein  42.12 
 
 
333 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1293  ribonuclease III  40.86 
 
 
323 aa  232  5e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3999  ribonuclease III  40.58 
 
 
312 aa  224  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329271  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14340  glycosyl transferase  39.74 
 
 
334 aa  222  6e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.049035  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14420  glycosyl transferase  35.9 
 
 
297 aa  192  8e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3259  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 
320 aa  180  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3121  glycosyl transferase family protein  35.1 
 
 
315 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0465511  hitchhiker  0.00127882 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2155  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  33.33 
 
 
326 aa  166  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1832  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.35 
 
 
327 aa  162  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6493  glycosyl transferase family protein  32.89 
 
 
335 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.729855 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2078  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.69 
 
 
327 aa  160  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0725  glycosyl transferase family protein  32.47 
 
 
324 aa  161  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.367599  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3696  glycosyl transferase family protein  31.89 
 
 
312 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.785719  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2611  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.03 
 
 
327 aa  160  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2690  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
337 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125609  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2549  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.83 
 
 
322 aa  157  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.83 
 
 
322 aa  157  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0885  glycosyl transferase family protein  31.14 
 
 
310 aa  157  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000118125 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02180  undecaprenyl phosphate-L-Ara4FN transferase  31.83 
 
 
322 aa  156  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1404  glycosyl transferase family 2  31.83 
 
 
322 aa  156  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.83 
 
 
322 aa  156  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2399  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.83 
 
 
322 aa  156  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.911848  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02139  hypothetical protein  31.83 
 
 
322 aa  156  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2981  glycosyl transferase family 2  33.91 
 
 
312 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18360  putative glycosyl transferase  34.94 
 
 
339 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.70098  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2408  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.19 
 
 
322 aa  152  8e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1446  glycosyl transferase, family 2  31.83 
 
 
308 aa  151  1e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4016  glycosyl transferase family 2  31.29 
 
 
326 aa  151  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322981  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1592  putative glycosyl transferase  34.62 
 
 
339 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.357089  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0065  glycosyl transferase family 2  31.83 
 
 
312 aa  149  5e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000100424  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1257  glycosyl transferase family 2  32.46 
 
 
331 aa  149  8e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.281246  normal  0.668936 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2842  glycosyl transferase family protein  31.61 
 
 
340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1196  glycosyl transferase family 2  32.46 
 
 
331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.452852  normal  0.209329 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4225  glycosyl transferase family 2  31.61 
 
 
327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.868062  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0301  glycosyl transferase family 2  30.79 
 
 
309 aa  147  3e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000142099  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4310  glycosyl transferase family 2  30.7 
 
 
320 aa  146  5e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0212  glycosyl transferase family 2  32.56 
 
 
331 aa  146  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.921554  normal  0.557032 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4133  glycosyl transferase family 2  29.68 
 
 
310 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000533827 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2526  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  29.13 
 
 
327 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2434  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  29.13 
 
 
327 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2483  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  29.13 
 
 
327 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2538  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  29.13 
 
 
327 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2359  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 
319 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0526  glycosyl transferase family 2  30.99 
 
 
309 aa  144  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2642  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  28.8 
 
 
327 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.812613  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3635  glycosyl transferase family 2  29.9 
 
 
312 aa  142  6e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.338719  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2876  glycosyl transferase family 2  30.52 
 
 
320 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1321  putative polymixin resistance glycosyltransferase transmembrane protein  30.56 
 
 
332 aa  142  7e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.689338  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3592  glycosyl transferase family 2  33.55 
 
 
341 aa  142  7e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000663913 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0125  glycosyl transferase family 2  31.35 
 
 
319 aa  142  9e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.403715  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3414  ribonuclease III  30.59 
 
 
330 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714089  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1513  ribonuclease III  30.59 
 
 
330 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.01126 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2174  glycosyl transferase family 2  29.51 
 
 
350 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2346  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
327 aa  139  6e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2872  glycosyl transferase family 2  33.98 
 
 
336 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0433  glycosyl transferase family protein  31.73 
 
 
320 aa  138  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3094  glycosyl transferase family protein  29.74 
 
 
324 aa  137  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000830791  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1351  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.34 
 
 
327 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2927  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.35 
 
 
327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1411  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 
314 aa  136  6.0000000000000005e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0925  glycosyl transferase family protein  31.8 
 
 
349 aa  135  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.812185  normal  0.602112 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3450  glycosyl transferase family 2  30.79 
 
 
314 aa  135  8e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1479  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.69 
 
 
308 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0018066  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1770  glycosyl transferase family protein  31.48 
 
 
344 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23431  glycosyl transferase family protein  30.89 
 
 
342 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3516  glycosyl transferase family 2  31.11 
 
 
314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000921398 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0713  glycosyl transferase  30.19 
 
 
343 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0273832 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0439  glycosyl transferase family 2  30.32 
 
 
320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.406471 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2387  putative polymixin resistance glycosyltransferase  30.82 
 
 
347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.177477 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2681  b-glycosyltransferase, glycosyltransferase family 2 protein  30.1 
 
 
312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0800  glycosyl transferase family protein  30.57 
 
 
366 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.985817 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1881  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.46 
 
 
335 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.254489  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5287  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.17 
 
 
323 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5112  glycosyltransferase, group 2 family protein  29.17 
 
 
323 aa  133  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5129  glycosyltransferase, group 2 family protein  28.85 
 
 
323 aa  133  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1391  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.46 
 
 
335 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4251  glycosyl transferase family protein  31.33 
 
 
339 aa  133  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1943  glycosyl transferase family 2  32.04 
 
 
322 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  0.190394 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2402  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.46 
 
 
335 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.745168  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0016  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.46 
 
 
335 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5684  group 2 family glycosyl transferase  29.17 
 
 
323 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2238  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.46 
 
 
335 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2192  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.46 
 
 
335 aa  133  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000025698  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16431  glycosyl transferase family protein  33.12 
 
 
321 aa  133  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.713365  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5528  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.17 
 
 
323 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1153  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.46 
 
 
335 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2276  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.46 
 
 
335 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1798  glycosyl transferase family protein  31.15 
 
 
344 aa  133  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.673209  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1413  glycosyl transferase family protein  31.48 
 
 
341 aa  132  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.274131 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1800  glycosyl transferase family 2  30.82 
 
 
350 aa  132  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  hitchhiker  0.00270774 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0692  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.87 
 
 
324 aa  132  9e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.58802  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2398  hypothetical protein  29.61 
 
 
319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0135  glycosyl transferases-like  27.92 
 
 
319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0498044  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1485  polyprenyl-phosphate beta-D-glucosyltransferase  27.87 
 
 
324 aa  132  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.376864  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3950  glycosyl transferase family protein  29.51 
 
 
312 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0123  Ribonuclease III  30.84 
 
 
350 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>