More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_20300 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_20300  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  100 
 
 
340 aa  684    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4121  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  67.25 
 
 
345 aa  460  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.991808 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3749  alcohol dehydrogenase  66.09 
 
 
345 aa  435  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3625  zinc-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  61.47 
 
 
340 aa  427  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698872  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0184  alcohol dehydrogenase  56.18 
 
 
338 aa  379  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0165  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  54.6 
 
 
347 aa  367  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0624  zinc-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  55.75 
 
 
338 aa  357  9.999999999999999e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2673  alcohol dehydrogenase  52.35 
 
 
338 aa  334  1e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2717  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  52.77 
 
 
341 aa  331  1e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2100  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.17 
 
 
340 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16630  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  48.43 
 
 
349 aa  317  2e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3360  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50 
 
 
338 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06010  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  48.73 
 
 
351 aa  308  6.999999999999999e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04280  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  50.15 
 
 
340 aa  306  4.0000000000000004e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0844  threonine dehydrogenase  50.14 
 
 
347 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1032  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.62 
 
 
344 aa  304  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0831  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.24 
 
 
340 aa  304  2.0000000000000002e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151744  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0215  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  49.13 
 
 
346 aa  301  1e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0696766 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22800  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  48.82 
 
 
339 aa  300  2e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2284  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.94 
 
 
338 aa  298  8e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.399136 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1970  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.52 
 
 
341 aa  296  3e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3354  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50 
 
 
338 aa  295  5e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2318  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.38 
 
 
338 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.263931  normal  0.648846 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1854  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.69 
 
 
348 aa  289  6e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2144  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.29 
 
 
349 aa  288  9e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.862427  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1473  alcohol dehydrogenase  46.2 
 
 
340 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.308593  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2438  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.41 
 
 
347 aa  280  2e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.931486  hitchhiker  0.00356491 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0477  alcohol dehydrogenase  48.16 
 
 
351 aa  279  4e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1589  alcohol dehydrogenase  44.64 
 
 
351 aa  272  6e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0185  alcohol dehydrogenase  44.74 
 
 
340 aa  271  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0265  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  49.57 
 
 
345 aa  269  4e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0894063  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  43.31 
 
 
345 aa  266  5e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0949  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  44.93 
 
 
345 aa  260  2e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0171372  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.74 
 
 
353 aa  249  4e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1641  threonine dehydrogenase related Zn-dependent dehydrogenase  44.04 
 
 
326 aa  245  8e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0570  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.29 
 
 
346 aa  193  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06280  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  34.21 
 
 
384 aa  187  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5217  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.96 
 
 
384 aa  186  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3669  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.33 
 
 
386 aa  183  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.949441  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0575  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.84 
 
 
389 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3025  putative alcohol dehydrogenase  34.83 
 
 
380 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04540  alcohol dehydrogenase, zinc-containing, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02810)  34.38 
 
 
355 aa  182  9.000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.825375 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0573  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.61 
 
 
389 aa  182  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2283  alcohol dehydrogenase  31.09 
 
 
422 aa  180  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0243543  hitchhiker  0.000541864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4441  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.33 
 
 
384 aa  181  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204388  normal  0.287337 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1474  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.38 
 
 
380 aa  180  4e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.228942  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0322  alcohol dehydrogenase  33.62 
 
 
347 aa  179  8e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.65143  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2034  hypothetical protein  33.71 
 
 
346 aa  178  1e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1352  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.42 
 
 
388 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3657  alcohol dehydrogenase  33.91 
 
 
347 aa  178  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.573189  normal  0.2926 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2300  alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 
388 aa  178  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394357  hitchhiker  0.00000777829 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3368  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.89 
 
 
384 aa  177  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4879  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.86 
 
 
346 aa  177  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.539752  normal  0.655263 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5892  alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 
346 aa  176  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.032769  normal  0.939128 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4498  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.4 
 
 
389 aa  176  5e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2366  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.14 
 
 
347 aa  176  5e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.0010665  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2370  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.25 
 
 
389 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1860  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.39 
 
 
346 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4290  alcohol dehydrogenase  32.67 
 
 
346 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.590215 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5561  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.16 
 
 
389 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210102  normal  0.0249106 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1837  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.33 
 
 
389 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.607752  normal  0.577621 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1334  alcohol dehydrogenase  34.46 
 
 
344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3187  alcohol dehydrogenase  32.99 
 
 
389 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0553  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.73 
 
 
382 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  hitchhiker  0.000850612 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3822  alcohol dehydrogenase  32.39 
 
 
346 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3120  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.06 
 
 
410 aa  172  5e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4130  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.13 
 
 
343 aa  172  5.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.9286  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2512  alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 
346 aa  172  7.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.881464  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4500  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.57 
 
 
392 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.658078  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2296  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.66 
 
 
379 aa  171  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5446  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.91 
 
 
392 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.715601  normal  0.534231 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3148  alcohol dehydrogenase  33.96 
 
 
382 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.539421  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2449  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.32 
 
 
417 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250445  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1928  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.39 
 
 
370 aa  171  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3148  putative alcohol dehydrogenase  30.67 
 
 
415 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559418  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3396  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.87 
 
 
393 aa  170  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0592  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.37 
 
 
401 aa  170  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4057  alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 
433 aa  170  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.788461  normal  0.848638 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2124  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.26 
 
 
377 aa  170  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.770168  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5445  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.16 
 
 
390 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.430041  normal  0.349478 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1637  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.96 
 
 
351 aa  169  5e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000634163  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4548  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.67 
 
 
355 aa  169  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00643704 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1174  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.56 
 
 
410 aa  169  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4415  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.67 
 
 
345 aa  169  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.742114  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0561  alcohol dehydrogenase  31.14 
 
 
404 aa  169  5e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.324844  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0924  putative zinc-dependent alcohol dehydrogenase (oxidoreductase)  33.8 
 
 
345 aa  169  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.175832  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1223  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.06 
 
 
390 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000417243 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4017  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
382 aa  169  6e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.530875 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2657  alcohol dehydrogenase  31.55 
 
 
388 aa  169  8e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0041  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.5 
 
 
405 aa  169  8e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1619  alcohol dehydrogenase  32.64 
 
 
384 aa  168  9e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.682346 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5816  alcohol dehydrogenase  32.11 
 
 
346 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.136095 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2760  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  30.54 
 
 
425 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2916  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  30.54 
 
 
492 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843639  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1091  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.19 
 
 
342 aa  168  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2090  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.49 
 
 
351 aa  168  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000167964 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3114  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30 
 
 
377 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4997  alcohol dehydrogenase  32.84 
 
 
348 aa  167  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11924  dehydrogenase  33.71 
 
 
384 aa  167  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1380  alcohol dehydrogenase  33.05 
 
 
348 aa  168  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378076  normal  0.439071 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>