34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1469 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1469  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188437 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1404  hypothetical protein  95.43 
 
 		 197 aa  340  5.999999999999999e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000195716 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1457  hypothetical protein  92.89 
 
 		 197 aa  336  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000911468 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3092  hypothetical protein  76.14 
 
 		 197 aa  267  5.9999999999999995e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2859  hypothetical protein  55.66 
 
 		 206 aa  209  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.175879  normal  0.0114173 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1594  hypothetical protein  56.78 
 
 		 212 aa  207  8e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.869699  hitchhiker  0.000000510539 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2784  hypothetical protein  54.63 
 
 		 218 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2764  hypothetical protein  55.12 
 
 		 218 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.572683  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2463  hypothetical protein  54.82 
 
 		 187 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2680  hypothetical protein  46.2 
 
 		 182 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1526  hypothetical protein  44.38 
 
 		 169 aa  122  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1625  hypothetical protein  41.76 
 
 		 171 aa  123  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100987 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3030  hypothetical protein  38.6 
 
 		 175 aa  112  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  normal  0.12237 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2602  hypothetical protein  41.67 
 
 		 170 aa  107  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2429  hypothetical protein  44.9 
 
 		 164 aa  98.2  6e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1660  hypothetical protein  40.17 
 
 		 167 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2769  hypothetical protein  41.44 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2915  hypothetical protein  41.44 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02704  hypothetical protein  32.65 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.55674  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001270  hypothetical protein  39.45 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.355888  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3161  hypothetical protein  27.93 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05145  hypothetical protein  36.7 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2171  hypothetical protein  38.27 
 
 		 179 aa  60.8  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.114551 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2814  hypothetical protein  33.96 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1105  hypothetical protein  40 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3084  hypothetical protein  36.99 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.223372  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5139  hypothetical protein  34.23 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.977257 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3800  hypothetical protein  30 
 
 		 173 aa  46.2  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0074  hypothetical protein  34.26 
 
 		 159 aa  46.2  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.863966  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0525  hypothetical protein  32.06 
 
 		 183 aa  46.2  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2137  putative transmembrane protein  32.93 
 
 		 170 aa  45.1  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00280947 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1947  hypothetical protein  29.11 
 
 		 155 aa  42  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3761  hypothetical protein  31.94 
 
 		 164 aa  42  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1203  hypothetical protein  33.06 
 
 		 164 aa  41.6  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>