More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0637 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3316  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  100 
 
 
304 aa  633  1e-180  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0637  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  100 
 
 
304 aa  633  1e-180  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.144121  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3486  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  96.7 
 
 
304 aa  614  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0801  hypothetical protein  94.41 
 
 
304 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3590  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  84.82 
 
 
305 aa  552  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3188  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  84.49 
 
 
305 aa  531  1e-150  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3657  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  83.83 
 
 
305 aa  529  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3780  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  83.83 
 
 
305 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0648  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  83.83 
 
 
305 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4310  acetyl esterase  59.26 
 
 
309 aa  350  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0866063  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4412  alpha/beta fold family hydrolase  58.45 
 
 
302 aa  350  2e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4356  acetyl esterase  59.26 
 
 
309 aa  349  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4421  acetyl esterase  59.26 
 
 
309 aa  349  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0112532  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4265  acetyl esterase  59.18 
 
 
309 aa  347  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4243  acetyl esterase  58.84 
 
 
309 aa  346  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4089  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  56.42 
 
 
304 aa  337  9.999999999999999e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1460  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  57.81 
 
 
308 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.247506  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0755  GDXG family lipase  51.83 
 
 
337 aa  324  1e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  35.84 
 
 
311 aa  195  9e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3322  Alpha/beta hydrolase fold-3  57.06 
 
 
178 aa  192  4e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  40 
 
 
309 aa  185  9e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.55 
 
 
311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.77 
 
 
313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1023  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.45 
 
 
313 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1786  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.54 
 
 
317 aa  170  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.193562  hitchhiker  0.00646519 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02184  hypothetical protein  50.7 
 
 
161 aa  169  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2443  putative lipase  34.41 
 
 
292 aa  169  5e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  34.56 
 
 
314 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.99 
 
 
320 aa  166  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  34.56 
 
 
314 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  35.81 
 
 
310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.69 
 
 
312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.81 
 
 
310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0880  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.55 
 
 
324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.691733  hitchhiker  0.0000246401 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.47 
 
 
310 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6777  lipolytic protein  38.49 
 
 
316 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1072  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.89 
 
 
301 aa  159  7e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1537  lipolytic protein  43.17 
 
 
318 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000528451  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  33.45 
 
 
310 aa  157  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4256  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.25 
 
 
347 aa  154  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0760103  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0443  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.43 
 
 
371 aa  154  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2006  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.43 
 
 
352 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.368207  normal  0.502337 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.52 
 
 
314 aa  154  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2844  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.8 
 
 
337 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.446939  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1920  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.82 
 
 
340 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.884364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2094  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.82 
 
 
339 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.317288  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36320  esterase/lipase  36.75 
 
 
353 aa  152  8.999999999999999e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5283  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.04 
 
 
340 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.966169  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.03 
 
 
310 aa  151  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0328  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.64 
 
 
311 aa  151  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3269  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  36.59 
 
 
328 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3113  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.66 
 
 
337 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723098  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1186  Alpha/beta hydrolase fold-3  37.29 
 
 
311 aa  150  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.102278  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3121  esterase/lipase/thioesterase  34.8 
 
 
321 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2703  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.54 
 
 
316 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00278676  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1940  Alpha/beta hydrolase fold-3  39.34 
 
 
375 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50518  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1986  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.34 
 
 
375 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2861  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.58 
 
 
301 aa  149  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2448  esterase  33.23 
 
 
352 aa  148  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2325  carboxylesterase Est2  33.23 
 
 
321 aa  148  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.152899  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2512  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.39 
 
 
317 aa  148  9e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.119667  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1194  carboxylesterase Est2  33.23 
 
 
321 aa  148  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.5931  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1921  carboxylesterase Est2  33.23 
 
 
321 aa  148  9e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1766  lipase  35.09 
 
 
339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1430  esterase  33.23 
 
 
319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482815  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3383  esterase  33.23 
 
 
319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418724  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3812  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.66 
 
 
339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422077  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1441  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.72 
 
 
317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3998  esterase/lipase/thioesterase  35.47 
 
 
337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000526107  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2072  putative fusion protein  33.59 
 
 
884 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.987766  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1713  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.8 
 
 
329 aa  146  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386293  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1991  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.8 
 
 
320 aa  146  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2149  esterase  32.89 
 
 
327 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6313  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  31.58 
 
 
311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.179325  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3653  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.68 
 
 
308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.83 
 
 
313 aa  146  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.414824 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2286  carboxylesterase Est2  32.91 
 
 
319 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.124272  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2080  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.17 
 
 
339 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1333  putative lipase  35.44 
 
 
328 aa  146  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0109525 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1935  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.22 
 
 
319 aa  145  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0879113  normal  0.508771 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1958  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.33 
 
 
339 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0704762  normal  0.359976 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.3 
 
 
318 aa  145  7.0000000000000006e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1620  lipolytic protein  36.84 
 
 
312 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0105415  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3090  esterase/lipase/thioesterase  33.87 
 
 
312 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.06 
 
 
339 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.05 
 
 
311 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_003296  RS02616  lipase signal peptide protein  34.59 
 
 
339 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0587  lipase  33.92 
 
 
337 aa  144  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0403  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.25 
 
 
336 aa  144  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0746  Alpha/beta hydrolase fold-3  34.23 
 
 
331 aa  144  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.192331 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2768  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.67 
 
 
308 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.718585 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0542  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.92 
 
 
337 aa  144  2e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4203  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.06 
 
 
375 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307246  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3867  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.45 
 
 
310 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.695714  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3222  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.57 
 
 
316 aa  143  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1249  esterase/lipase  35.06 
 
 
365 aa  143  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0945507  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1039  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.2 
 
 
319 aa  143  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.240306  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3484  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.47 
 
 
289 aa  143  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0604  esterase/lipase-like protein  34.02 
 
 
346 aa  143  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000548029 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4223  putative lipase/esterase  34.88 
 
 
320 aa  143  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>