25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0347 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0347  phage transcriptional regulator, AlpA  100 
 
 		 81 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0551  phage transcriptional regulator, AlpA  65 
 
 		 80 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0315  prophage CP4-57 regulatory  48.57 
 
 		 98 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0922  phage transcriptional regulator, AlpA  46.67 
 
 		 78 aa  63.5  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.124152  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2683  phage transcriptional regulator, AlpA  45.16 
 
 		 77 aa  63.2  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000806139  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0386  DNA-binding protein, putative  41.38 
 
 		 82 aa  57.4  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3752  phage transcriptional regulator, AlpA  41.1 
 
 		 93 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.433172  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2902  phage transcriptional regulator, AlpA  43.75 
 
 		 69 aa  53.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3781  hypothetical protein  44.07 
 
 		 75 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.650876 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2017  hypothetical protein  36.36 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.425283  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0932  phage transcriptional regulator, AlpA  34.78 
 
 		 76 aa  47.8  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.412381  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0941  AlpA family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 74 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.30814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3481  phage transcriptional regulator, AlpA  31.76 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1265  phage transcriptional regulator, AlpA  37.5 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3362  phage transcriptional regulator, AlpA  39.29 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1468  phage transcriptional regulator, AlpA  35.71 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0978574  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3427  phage transcriptional regulator, AlpA  34.48 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3429  DNA-binding protein, putative  32.26 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000259221  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2018  phage transcriptional regulator, AlpA  37.04 
 
 		 128 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04065  phage transcriptional regulator, AlpA  34.55 
 
 		 80 aa  42  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3275  phage transcriptional regulator, AlpA  36.84 
 
 		 86 aa  41.6  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0797  phage transcriptional regulator, AlpA  36.54 
 
 		 64 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0716  phage transcriptional regulator, AlpA  35.09 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2339  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 73 aa  41.2  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1256  phage transcriptional regulator, AlpA  42.22 
 
 		 64 aa  40.4  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>