35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3453 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3453  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  579  1e-164  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0497  hypothetical protein  98.93 
 
 		 281 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.664537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3629  hypothetical protein  97.15 
 
 		 281 aa  542  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4075  hypothetical protein  84.49 
 
 		 245 aa  437  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0514  hypothetical protein  70.57 
 
 		 282 aa  424  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0596  hypothetical protein  70.57 
 
 		 282 aa  412  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0540  hypothetical protein  74.9 
 
 		 282 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0535  hypothetical protein  74.9 
 
 		 282 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3803  hypothetical protein  74.13 
 
 		 282 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0483  hypothetical protein  50.2 
 
 		 292 aa  273  3e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2684  hypothetical protein  49.2 
 
 		 288 aa  257  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.318467 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3289  hypothetical protein  33.46 
 
 		 286 aa  158  9e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2131  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 		 265 aa  53.1  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1802  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 		 261 aa  51.6  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.202097  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1508  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 		 257 aa  50.4  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.118262  normal  0.888378 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.45 
 
 		 243 aa  49.7  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1070  extracellular solute-binding protein  23.9 
 
 		 281 aa  49.3  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.703712 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3796  extracellular solute-binding protein  26.16 
 
 		 283 aa  49.3  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.814508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1759  histidine kinase  25.64 
 
 		 596 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.37697  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0286  prephenate dehydratase  30.09 
 
 		 256 aa  48.5  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.936099 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3526  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 584 aa  47.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.28 
 
 		 620 aa  47.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.838333  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2081  histidine kinase  26.4 
 
 		 597 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2175  histidine kinase  26.4 
 
 		 599 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1312  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 584 aa  47.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0117  amino acid ABC transporter periplasmic protein  35.85 
 
 		 254 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2732  extracellular solute-binding protein  23 
 
 		 284 aa  45.8  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1037  histidine kinase  22.78 
 
 		 608 aa  45.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0331  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.31 
 
 		 843 aa  43.9  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2470  solute-binding family 1 protein  23.56 
 
 		 245 aa  43.5  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.162983  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0931  solute-binding family 3 protein  25.19 
 
 		 541 aa  43.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000314501  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3228  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 609 aa  43.1  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19140  cyclohexadienyl dehydratase precursor  26.19 
 
 		 268 aa  42.7  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.288191  normal  0.371616 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1584  glutamine ABC transporter periplasmic protein  21.93 
 
 		 248 aa  42.4  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118123  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1143  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 		 291 aa  42  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00243654  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>