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for query gene Shew_3551 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3551  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  100 
 
 		 379 aa  737    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3276  multidrug resistance protein D  57.64 
 
 		 385 aa  366  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0164618 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000423  multidrug resistance protein D  55.35 
 
 		 378 aa  359  4e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.575568  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3485  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  51.83 
 
 		 382 aa  349  5e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3172  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  51.89 
 
 		 387 aa  346  4e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3171  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  52.16 
 
 		 387 aa  346  4e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.229989  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1199  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  51.89 
 
 		 387 aa  345  6e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3315  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  52.16 
 
 		 387 aa  343  2e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1082  major facilitator transporter  52.97 
 
 		 392 aa  342  7e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.499902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0963  multidrug resistance protein D  55.8 
 
 		 379 aa  340  2e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0211536  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2788  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  49.87 
 
 		 389 aa  339  4e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0332558  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3307  multidrug resistance protein D  56.83 
 
 		 381 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.635246  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04859  hypothetical protein  47.65 
 
 		 434 aa  316  5e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0579  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  52.39 
 
 		 395 aa  313  2.9999999999999996e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1082  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  54.05 
 
 		 395 aa  310  2e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0263  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  50.41 
 
 		 397 aa  309  5e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3263  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.69 
 
 		 399 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00113776  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3518  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.69 
 
 		 399 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0261106  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1787  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  36.69 
 
 		 399 aa  231  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3478  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  36.43 
 
 		 399 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3177  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.18 
 
 		 399 aa  230  4e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000683833  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3460  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  36.6 
 
 		 399 aa  224  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0137927  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2693  major facilitator superfamily MFS_1  44.93 
 
 		 384 aa  224  3e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.693922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3491  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  35.57 
 
 		 399 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00320112  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3170  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.4 
 
 		 399 aa  219  5e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3235  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.69 
 
 		 399 aa  218  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154906  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4263  MFS family transporter  42.82 
 
 		 383 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0514386  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50050  MFS family transporter  41.06 
 
 		 385 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.012942 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30 
 
 		 393 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.08 
 
 		 398 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.43 
 
 		 458 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.45 
 
 		 405 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.45 
 
 		 405 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.63 
 
 		 401 aa  122  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.75 
 
 		 405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.72 
 
 		 405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.14 
 
 		 405 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.72 
 
 		 434 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0827  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.94 
 
 		 389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.89 
 
 		 268 aa  117  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.122964  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  27.46 
 
 		 398 aa  116  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  28.32 
 
 		 393 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.32 
 
 		 393 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
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NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  30.26 
 
 		 392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  30.26 
 
 		 392 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.38 
 
 		 414 aa  113  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.29 
 
 		 393 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1990  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.81 
 
 		 452 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.648809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00358  permease  29.03 
 
 		 423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3062  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.58 
 
 		 412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4159  MFS permease  30.06 
 
 		 392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3477  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  49.18 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.25 
 
 		 411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.64 
 
 		 411 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002080  putative multidrug resistance protein  27.41 
 
 		 397 aa  109  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3061  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.21 
 
 		 411 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0772  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.21 
 
 		 400 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2139  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.21 
 
 		 400 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.935322  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2605  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.21 
 
 		 400 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.21 
 
 		 411 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.21 
 
 		 400 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3096  major facilitator transporter  32.21 
 
 		 411 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.79 
 
 		 409 aa  106  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4448  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.07 
 
 		 424 aa  106  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0876  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.19 
 
 		 405 aa  106  7e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.453625  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0543  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily protein  26.74 
 
 		 400 aa  106  7e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00469398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.88 
 
 		 402 aa  106  8e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0763382 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.95 
 
 		 424 aa  106  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0777  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.27 
 
 		 418 aa  106  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0196  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.88 
 
 		 402 aa  106  9e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0196  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.88 
 
 		 402 aa  106  9e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4138  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.88 
 
 		 402 aa  106  9e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.33 
 
 		 400 aa  105  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  27.6 
 
 		 420 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.97 
 
 		 392 aa  104  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0325  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.86 
 
 		 402 aa  104  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.29 
 
 		 412 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3448  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  27.7 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0109  conserved hypothetical protein, putative drug resistance transporter, Bcr/CflA family  25.61 
 
 		 413 aa  101  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000456469  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.44 
 
 		 408 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0439856  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2992  MFS transporter  27.41 
 
 		 401 aa  101  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4241  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.91 
 
 		 396 aa  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.122316 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  26.84 
 
 		 426 aa  101  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3588  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.24 
 
 		 400 aa  101  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2346  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.79 
 
 		 408 aa  101  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0297  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25 
 
 		 401 aa  100  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.169159  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.75 
 
 		 413 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236916  hitchhiker  0.00655505 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.05 
 
 		 401 aa  100  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.09 
 
 		 405 aa  100  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.95 
 
 		 424 aa  100  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3750  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.46 
 
 		 402 aa  100  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009457  VC0395_A1240  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.4 
 
 		 401 aa  99.8  7e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000341384  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_10090  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  29.71 
 
 		 392 aa  99.8  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0442276  n/a   
 
 
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NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.55 
 
 		 400 aa  99.8  7e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
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NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.73 
 
 		 412 aa  99.4  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_3271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.46 
 
 		 411 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.638949 
 
 
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NC_008577  Shewana3_3948  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.17 
 
 		 402 aa  99  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.17 
 
 		 393 aa  98.6  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_1787  inner membrane transport protein YdhC  25.7 
 
 		 399 aa  98.6  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0113984 
 
 
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NC_004347  SO_4555  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  26.61 
 
 		 402 aa  97.8  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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