45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2267 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2267  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  503  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.311902 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2951  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  38.1 
 
 		 206 aa  136  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1438  hypothetical protein  34.82 
 
 		 228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2426  hypothetical protein  32.51 
 
 		 221 aa  112  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3437  hypothetical protein  35.74 
 
 		 203 aa  111  9e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.631868 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3050  hypothetical protein  33.74 
 
 		 229 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1495  hypothetical protein  32.94 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2731  hypothetical protein  32.64 
 
 		 245 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2225  hypothetical protein  36.1 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1413  hypothetical protein  30.29 
 
 		 202 aa  106  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0598562  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1628  hypothetical protein  31.15 
 
 		 245 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00936248 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2824  hypothetical protein  31.4 
 
 		 245 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0559762 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2748  hypothetical protein  31.4 
 
 		 245 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.668199  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1833  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  31.9 
 
 		 243 aa  102  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.36996 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0279  hypothetical protein  33.33 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4204  MobA-like protein-like protein  27.65 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212178  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2712  MobA-like protein-like  26.91 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2187  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  27.27 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2139  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.27 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02165  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  25.38 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.892695  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5190  MobA-like protein-like protein  32.79 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.802275  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2512  hypothetical protein  26.11 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0124  hypothetical protein  30.28 
 
 		 190 aa  52.8  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  28.67 
 
 		 199 aa  52  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.68 
 
 		 202 aa  52  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  31.67 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  32.48 
 
 		 192 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3554  hypothetical protein  31.45 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704282  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  30.66 
 
 		 199 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0104  hypothetical protein  27.08 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.808072 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  30.57 
 
 		 216 aa  50.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  29.41 
 
 		 534 aa  49.7  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2205  hypothetical protein  26.05 
 
 		 242 aa  50.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  22.37 
 
 		 189 aa  48.1  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  23.81 
 
 		 187 aa  47.4  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  28.85 
 
 		 575 aa  45.8  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1224  MobA-like protein-like protein  21.71 
 
 		 201 aa  45.4  0.0008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.607114  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5262  hypothetical protein  29.45 
 
 		 191 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3796  hypothetical protein  30.65 
 
 		 185 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328726  normal  0.349027 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1634  MobA-like protein  30.65 
 
 		 188 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.74 
 
 		 539 aa  43.5  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1745  hypothetical protein  23.86 
 
 		 185 aa  43.5  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5429  hypothetical protein  28.22 
 
 		 205 aa  43.5  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2921  hypothetical protein  27.24 
 
 		 216 aa  43.1  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.627898 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4230  hypothetical protein  29.84 
 
 		 188 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>