51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2114 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_2114  rhomboid family protein  100 
 
 		 198 aa  391  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00343017  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4542  hypothetical protein  97.98 
 
 		 198 aa  381  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2270  Rhomboid family protein  97.47 
 
 		 198 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00653341  normal  0.491355 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2160  rhomboid family protein  93.94 
 
 		 198 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0175034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2256  rhomboid family protein  97.33 
 
 		 187 aa  357  9e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.18089  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1853  rhomboid family protein  91.89 
 
 		 188 aa  338  2.9999999999999998e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.124866  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2165  rhomboid family protein  82.72 
 
 		 201 aa  325  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0257176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2060  rhomboid family protein  81.44 
 
 		 204 aa  325  3e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00283359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1915  rhomboid family protein  84.7 
 
 		 205 aa  323  9e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135917  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2504  hypothetical protein  78.35 
 
 		 204 aa  314  5e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2350  rhomboid family protein  63.13 
 
 		 200 aa  221  4.9999999999999996e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0538538  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2553  rhomboid family protein  60.43 
 
 		 202 aa  216  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0621154  normal  0.0170558 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1875  rhomboid family protein  63.93 
 
 		 209 aa  215  4e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.413109  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2047  rhomboid family protein  65.45 
 
 		 171 aa  202  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285623  normal  0.248889 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2016  rhomboid-like protein  55.19 
 
 		 218 aa  195  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2063  rhomboid family protein  61.67 
 
 		 194 aa  192  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1827  hypothetical protein  62.5 
 
 		 205 aa  178  4e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.545159  normal  0.567455 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02194  membrane protein, Rhomboid family  47.65 
 
 		 194 aa  149  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.411202  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2148  rhomboid family membrane protein  42.53 
 
 		 206 aa  129  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01423  hypothetical protein  47.37 
 
 		 162 aa  124  9e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004038  membrane protein  42.77 
 
 		 183 aa  122  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.03896  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1088  integral membrane protein  45.81 
 
 		 186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0888  rhomboid family protein  41.94 
 
 		 186 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.592771  normal  0.86404 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2522  rhomboid family membrane protein  41.72 
 
 		 195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1567  hypothetical protein  43.45 
 
 		 183 aa  112  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.018833  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0169  Rhomboid family protein  36.54 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.406273  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0230  membrane protein, rhomboid family  39.42 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3112  rhomboid family protein  33.87 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2892  putative transmembrane protein  30.77 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2486  hypothetical protein  29.78 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0020  Rhomboid family protein  30.46 
 
 		 242 aa  51.6  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.430888  normal  0.257082 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2655  hypothetical protein  32.28 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1467  hypothetical protein  28.97 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4990  peptidase S54-type, rhomboid-like protein  35.56 
 
 		 220 aa  48.5  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.25145  normal  0.208438 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0800  rhomboid family protein  31.33 
 
 		 181 aa  46.2  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0012  Rhomboid family protein  29.65 
 
 		 282 aa  46.2  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1033  rhomboid-like protein  29.73 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0104  rhomboid family protein  27.75 
 
 		 279 aa  43.9  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.465909  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0013  rhomboid family protein  32.21 
 
 		 293 aa  43.9  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000112499  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0014  Rhomboid family protein  28.57 
 
 		 292 aa  43.5  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0019  Rhomboid family protein  28.74 
 
 		 238 aa  43.5  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2492  Rhomboid family protein  28.81 
 
 		 579 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  29.73 
 
 		 286 aa  42.4  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0711  Rhomboid family protein  33.75 
 
 		 515 aa  42.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.535917 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  37.21 
 
 		 303 aa  42  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  34.15 
 
 		 303 aa  42.4  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  35.48 
 
 		 289 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  35.48 
 
 		 289 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  35.48 
 
 		 289 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1085  Rhomboid family protein  36.07 
 
 		 204 aa  41.6  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  30.65 
 
 		 291 aa  41.6  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>