34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1798 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_1798  hypothetical protein  100 
 
 
290 aa  588  1e-167  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.145429  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1845  hypothetical protein  99.31 
 
 
290 aa  584  1e-166  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2480  hypothetical protein  98.28 
 
 
290 aa  578  1e-164  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1806  hypothetical protein  97.89 
 
 
285 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1664  hypothetical protein  86.55 
 
 
293 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.933352  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2496  hypothetical protein  78.89 
 
 
290 aa  461  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.296365  hitchhiker  0.00398106 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2306  hypothetical protein  80.28 
 
 
290 aa  457  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0300856  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2711  hypothetical protein  80.57 
 
 
290 aa  456  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2376  hypothetical protein  79.93 
 
 
290 aa  456  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.284586  normal  0.912373 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2317  hypothetical protein  57.4 
 
 
283 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1455  hypothetical protein  51.43 
 
 
282 aa  296  2e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133199  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1530  hypothetical protein  50.36 
 
 
281 aa  291  7e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2384  hypothetical protein  29.39 
 
 
280 aa  149  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01920  hypothetical protein  30 
 
 
293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0403561  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3305  rare lipoprotein A  29.43 
 
 
289 aa  110  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.40538  normal  0.056072 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05383  hypothetical protein  26.15 
 
 
286 aa  109  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000507  hypothetical protein  27.2 
 
 
277 aa  105  7e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2527  hypothetical protein  28.24 
 
 
256 aa  100  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0577  hypothetical protein  27.12 
 
 
295 aa  97.8  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0585  hypothetical protein  27.27 
 
 
288 aa  95.9  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2199  putative lipoprotein  25.18 
 
 
288 aa  94  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.707312  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3865  lipoprotein  24.63 
 
 
286 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4564  putative lipoprotein  23.22 
 
 
286 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0335  putative lipoprotein  25 
 
 
278 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.91114  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1443  putative lipoprotein  23.28 
 
 
289 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4075  lipoprotein  21.8 
 
 
289 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.467843  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1325  hypothetical protein  21.86 
 
 
286 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.806201  normal  0.411891 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3789  putative lipoprotein  19.49 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0227546 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1589  lipoprotein, putative  18.71 
 
 
287 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1382  hypothetical protein  23.36 
 
 
286 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.300588  normal  0.327464 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0556  putative lipoprotein  23.47 
 
 
285 aa  55.8  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.921395  normal  0.957276 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0185  hypothetical protein  22.95 
 
 
359 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.317581 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0998  hypothetical protein  22.89 
 
 
289 aa  43.1  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0228  hypothetical protein  24.71 
 
 
374 aa  42.4  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>