64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1538 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_4530  hypothetical protein  83.88 
 
 
978 bp  726    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2299  hypothetical protein  83.81 
 
 
978 bp  722    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.187044  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2555  hypothetical protein  83.81 
 
 
978 bp  722    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00750734  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0115  hypothetical protein  83.58 
 
 
978 bp  702    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2402  hypothetical protein  83.68 
 
 
978 bp  700    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.283143  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0670  hypothetical protein  87.09 
 
 
978 bp  983    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3447  hypothetical protein  83.68 
 
 
978 bp  710    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3040  hypothetical protein  83.68 
 
 
978 bp  710    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1538    100 
 
 
1007 bp  1996    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.987441  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1861  hypothetical protein  86.99 
 
 
991 bp  969    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633128  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1510  hypothetical protein  85.41 
 
 
978 bp  839    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1547  hypothetical protein  83.28 
 
 
978 bp  678    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1511  hypothetical protein  82.91 
 
 
978 bp  632  1e-179  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3113  hypothetical protein  89.15 
 
 
624 bp  630  1e-178  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0116  hypothetical protein  82.71 
 
 
978 bp  626  1e-177  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2622  hypothetical protein  83.04 
 
 
960 bp  620  1e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0144606  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2814  hypothetical protein  82.29 
 
 
978 bp  599  1e-169  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4547  hypothetical protein  82.25 
 
 
978 bp  591  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1377    88.51 
 
 
1010 bp  569  1e-160  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3473  hypothetical protein  86.9 
 
 
978 bp  545  1e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1812  hypothetical protein  89.39 
 
 
951 bp  498  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3446  hypothetical protein  86.72 
 
 
597 bp  472  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3041  hypothetical protein  86.72 
 
 
597 bp  472  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1546  hypothetical protein  89.6 
 
 
981 bp  468  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0945    87.08 
 
 
479 bp  400  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.836757  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0499  hypothetical protein  85.5 
 
 
561 bp  391  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1241  hypothetical protein  86.39 
 
 
978 bp  365  2e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1859    83.81 
 
 
930 bp  307  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.434219  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0606  hypothetical protein  81.43 
 
 
978 bp  289  8e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0957  hypothetical protein  82.82 
 
 
978 bp  281  2e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00250015  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1264  hypothetical protein  82.73 
 
 
978 bp  270  7e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1890  hypothetical protein  82.61 
 
 
978 bp  264  4e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1889  hypothetical protein  87.69 
 
 
267 bp  262  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3575    81.8 
 
 
515 bp  238  3e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0979  hypothetical protein  90.1 
 
 
243 bp  230  6e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1571  hypothetical protein  89.11 
 
 
201 bp  218  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641007  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3114    82.61 
 
 
298 bp  188  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1728  hypothetical protein  84.58 
 
 
243 bp  182  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1858    87.43 
 
 
210 bp  180  5e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.681721  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3809  hypothetical protein  84.15 
 
 
339 bp  178  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3677    89.81 
 
 
902 bp  127  7e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3676    89.81 
 
 
1107 bp  127  7e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0200  hypothetical protein  86.67 
 
 
882 bp  97.6  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2394  hypothetical protein  83.94 
 
 
315 bp  97.6  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.176236  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1921  hypothetical protein  96 
 
 
978 bp  83.8  0.00000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3680  hypothetical protein  96 
 
 
978 bp  83.8  0.00000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2541    83.93 
 
 
387 bp  79.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.494511  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0134  hypothetical protein  87.18 
 
 
111 bp  75.8  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2392  hypothetical protein  83.65 
 
 
978 bp  71.9  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.134929  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2393  hypothetical protein  83.65 
 
 
717 bp  71.9  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0597783  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0135  hypothetical protein  88.71 
 
 
978 bp  67.9  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3681  hypothetical protein  100 
 
 
972 bp  60  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1609  hypothetical protein  84.62 
 
 
150 bp  60  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2533  hypothetical protein  84.62 
 
 
981 bp  60  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0991372  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0494  hypothetical protein  96.88 
 
 
138 bp  56  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2922  hypothetical protein  90.91 
 
 
978 bp  56  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2307  hypothetical protein  85.94 
 
 
981 bp  56  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3627  hypothetical protein  87.5 
 
 
978 bp  56  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4299  hypothetical protein  87.5 
 
 
978 bp  56  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2838  hypothetical protein  81.91 
 
 
561 bp  52  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.579373  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2785  hypothetical protein  92.11 
 
 
978 bp  52  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0143634  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2034  hypothetical protein  87.76 
 
 
87 bp  50.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.285013  normal  0.158282 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3682  hypothetical protein  83.33 
 
 
597 bp  48.1  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4749  hypothetical protein  86.54 
 
 
978 bp  48.1  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.291957  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>