More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_24440 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_24440  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  100 
 
 
259 aa  516  1.0000000000000001e-145  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0112  ABC transporter related  43.15 
 
 
375 aa  219  3e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.818375  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0128  ABC transporter related  38.74 
 
 
376 aa  211  5.999999999999999e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.15406  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.92 
 
 
392 aa  203  3e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.495762  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0281  ABC transporter related protein  38.67 
 
 
393 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1258  ABC transporter related  40.17 
 
 
412 aa  180  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0279  ABC transporter related  33.98 
 
 
339 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0343631  normal  0.247104 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  32.64 
 
 
256 aa  176  4e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3496  ABC transporter-like protein  39.68 
 
 
384 aa  175  6e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  36.29 
 
 
255 aa  175  7e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0781  iron(III) dicitrate transport permease-like protein yusV  35.1 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.215395  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0163  ABC transporter-like  36.08 
 
 
333 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2112  ABC transporter related  36.48 
 
 
330 aa  168  7e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00532716  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  34.8 
 
 
251 aa  168  9e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2251  ABC transporter related  35.57 
 
 
342 aa  167  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.02986 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3089  ABC transporter related  37.15 
 
 
340 aa  167  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.267363 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3503  ABC transporter related  33.2 
 
 
273 aa  166  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2088  ABC transporter related  33.86 
 
 
267 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000943272  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  35.98 
 
 
455 aa  166  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  32.13 
 
 
266 aa  166  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0810  putative ferrichrome ABC transporter, ATP-binding protein  32.53 
 
 
260 aa  165  9e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.024008  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5233  ABC transporter related  38.52 
 
 
268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3768  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.8 
 
 
273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3480  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.8 
 
 
273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3492  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.8 
 
 
273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  37.3 
 
 
260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3639  ABC transporter related  34.78 
 
 
269 aa  163  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395378  normal  0.0643524 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3834  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.8 
 
 
273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.860088  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4042  ABC transporter related protein  37.2 
 
 
257 aa  163  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  37.29 
 
 
264 aa  163  3e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0797  ferrichrome ABC transporter ATP-binding protein  32.64 
 
 
260 aa  163  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.274021  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1465  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.8 
 
 
273 aa  163  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000310402 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  34.96 
 
 
267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3334  hypothetical protein  34.51 
 
 
267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1392  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.65 
 
 
264 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00709289  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3784  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.8 
 
 
273 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0409851  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2320  ABC transporter related protein  34.63 
 
 
277 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  31.33 
 
 
266 aa  162  6e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3580  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  32.4 
 
 
273 aa  162  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.961054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3864  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  32.4 
 
 
273 aa  162  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.4 
 
 
273 aa  161  9e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000209969 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2731  ABC transporter related  36.14 
 
 
255 aa  160  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2099  ABC transporter related  33.86 
 
 
261 aa  160  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0416  ABC transporter related  37.25 
 
 
284 aa  160  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2416  ABC transporter related  35.37 
 
 
273 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.118562 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  33.86 
 
 
293 aa  160  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  33.47 
 
 
262 aa  160  2e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1814  ABC transporter related  34.18 
 
 
275 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2406  ABC transporter-related protein  32.4 
 
 
271 aa  159  4e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000284506  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7287  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron (III) dicitrate)  33.73 
 
 
264 aa  158  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0308  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, ATP-binding protein  35.77 
 
 
279 aa  158  7e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0646  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
333 aa  157  1e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.473104 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0333  ABC transporter related  35.22 
 
 
282 aa  157  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0342  ABC transporter related protein  35.77 
 
 
332 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  38.31 
 
 
262 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0080  ABC transporter related  35.45 
 
 
258 aa  157  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.871899  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5060  ABC transporter related protein  38.33 
 
 
264 aa  156  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  33.2 
 
 
255 aa  156  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  34.27 
 
 
418 aa  155  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1297  ABC transporter related  34.4 
 
 
357 aa  155  6e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.934919  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1010  ABC transporter related  32.91 
 
 
254 aa  155  7e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  35.44 
 
 
269 aa  155  8e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2417  ABC transporter-like protein  35.48 
 
 
274 aa  155  8e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  32.94 
 
 
271 aa  155  9e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0967158 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4240  ABC transporter related  34.9 
 
 
285 aa  154  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3543  ABC transporter related  35.43 
 
 
271 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1809  ABC transporter related  33.73 
 
 
274 aa  154  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4086  ABC transporter related  34.75 
 
 
279 aa  154  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.778722 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5230  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  32.1 
 
 
270 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5629  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  32.1 
 
 
270 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0187  ABC transporter related  35.54 
 
 
275 aa  154  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184625  normal  0.796471 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  33.05 
 
 
266 aa  153  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  33.73 
 
 
289 aa  152  4e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5746  ABC transporter related  31.33 
 
 
264 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5473  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.49 
 
 
270 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5061  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.49 
 
 
270 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5078  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.49 
 
 
270 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5447  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.49 
 
 
270 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.753542  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3096  ABC transporter  34.78 
 
 
263 aa  152  7e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5504  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.49 
 
 
270 aa  152  7e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  33.47 
 
 
255 aa  150  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1927  ABC transporter related  35.32 
 
 
262 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0701632 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  33.47 
 
 
255 aa  150  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5510  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.49 
 
 
270 aa  151  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04360  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  34.6 
 
 
285 aa  151  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  33.47 
 
 
255 aa  150  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02590  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  36.21 
 
 
302 aa  151  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.225702  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5559  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.49 
 
 
270 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  33.47 
 
 
255 aa  150  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2465  ABC transporter related protein  32.82 
 
 
296 aa  150  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1120  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  33.86 
 
 
266 aa  150  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.721216  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5174  ABC transporter related  32.49 
 
 
270 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1178  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.11 
 
 
262 aa  150  2e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.240461  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1324  ABC transporter related  31.71 
 
 
265 aa  150  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1301  ABC transporter-related protein  35.83 
 
 
261 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0739  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  33.47 
 
 
255 aa  150  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12803  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.91 
 
 
263 aa  150  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2653  ABC transporter related protein  35.39 
 
 
275 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.015626  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3077  ABC transporter related protein  34.27 
 
 
294 aa  149  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00414894  normal  0.257844 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  33.6 
 
 
268 aa  150  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>