More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_20790 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_20790  glutathione peroxidase  100 
 
 		 180 aa  373  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0968  Glutathione peroxidase  71.35 
 
 		 184 aa  275  3e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000061106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08510  glutathione peroxidase  69.44 
 
 		 180 aa  271  3e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.44579 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2679  Glutathione peroxidase  52.22 
 
 		 184 aa  197  5e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2662  glutathione peroxidase  50.83 
 
 		 181 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0111206  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0282  Glutathione peroxidase  58.64 
 
 		 158 aa  186  2e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5485  glutathione peroxidase  49.44 
 
 		 178 aa  176  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.219921  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1198  glutathione peroxidase  53.22 
 
 		 178 aa  175  4e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00025984  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1026  glutathione peroxidase  52.63 
 
 		 178 aa  174  5e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.04413  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0265  Peroxiredoxin  47.98 
 
 		 165 aa  171  5.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000231119  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2663  glutathione peroxidase  50 
 
 		 157 aa  171  6.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.190046  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  50.91 
 
 		 158 aa  170  9e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01902  probable glutathione peroxidase  47.78 
 
 		 165 aa  167  9e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101099  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1771  glutathione peroxidase  46.93 
 
 		 161 aa  166  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1059  glutathione peroxidase  46.82 
 
 		 178 aa  166  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.428642  normal  0.565362 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  48.86 
 
 		 158 aa  165  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  44.44 
 
 		 158 aa  161  6e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0694  glutathione peroxidase  44.69 
 
 		 161 aa  161  6e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000130339  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0841  glutathione peroxidase  44.44 
 
 		 164 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0436995  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  46.11 
 
 		 160 aa  159  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1368  glutathione peroxidase  47.8 
 
 		 165 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0904  glutathione peroxidase  46.11 
 
 		 158 aa  159  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000826936  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2146  Peroxiredoxin  46.11 
 
 		 160 aa  159  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3973  Peroxiredoxin  45.03 
 
 		 165 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360978 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  46.11 
 
 		 160 aa  159  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1407  glutathione peroxidase  47.8 
 
 		 165 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0308338  normal  0.103968 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  46.11 
 
 		 160 aa  159  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1178  glutathione peroxidase  45 
 
 		 158 aa  159  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.375161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0867  glutathione peroxidase  46.11 
 
 		 159 aa  159  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000118287  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3925  Glutathione peroxidase  45.03 
 
 		 165 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1926  glutathione peroxidase  46.11 
 
 		 160 aa  158  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  45.56 
 
 		 160 aa  158  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2975  Glutathione peroxidase  47.25 
 
 		 161 aa  158  4e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36322  normal  0.036622 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1384  glutathione peroxidase  47.25 
 
 		 165 aa  158  4e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1950  glutathione peroxidase  46.11 
 
 		 160 aa  158  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.210596  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2154  glutathione peroxidase  46.11 
 
 		 160 aa  158  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  45.56 
 
 		 161 aa  157  7e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1300  glutathione peroxidase  46.63 
 
 		 161 aa  157  7e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1563  glutathione peroxidase, putative  45.81 
 
 		 162 aa  157  8e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3184  glutathione peroxidase  45 
 
 		 160 aa  157  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  45 
 
 		 160 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0851  glutathione peroxidase  45.12 
 
 		 161 aa  156  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425919  decreased coverage  0.00020946 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2964  glutathione peroxidase  46.67 
 
 		 160 aa  154  7e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3685  glutathione peroxidase  42.78 
 
 		 163 aa  153  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2011  glutathione peroxidase  43.82 
 
 		 159 aa  153  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0261647  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1769  glutathione peroxidase  43.02 
 
 		 162 aa  153  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0182367  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2875  glutathione peroxidase  45.61 
 
 		 161 aa  153  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2074  glutathione peroxidase  43.82 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895406  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1571  glutathione peroxidase  43.82 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154895  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2510  glutathione peroxidase  43.82 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2599  glutathione peroxidase  43.82 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2454  glutathione peroxidase  43.82 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0273  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1346  glutathione peroxidase  43.82 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2552  glutathione peroxidase  43.02 
 
 		 161 aa  152  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.40006  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3238  glutathione peroxidase  43.82 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400465  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2773  glutathione peroxidase  45.61 
 
 		 161 aa  152  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000478947  hitchhiker  0.00587193 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2006  glutathione peroxidase family protein  43.26 
 
 		 160 aa  152  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2705  glutathione peroxidase  45.03 
 
 		 161 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000249576  hitchhiker  0.0000800256 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1499  glutathione peroxidase  46.06 
 
 		 157 aa  152  2.9999999999999998e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.278578  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1080  glutathione peroxidase  50.64 
 
 		 164 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000852506  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2639  glutathione peroxidase  45.51 
 
 		 158 aa  151  4e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.833403 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0020  glutathione peroxidase  44.83 
 
 		 168 aa  151  5e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2764  glutathione peroxidase  42.86 
 
 		 161 aa  151  5e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0187221  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2615  putative glutathione peroxidase  47.24 
 
 		 184 aa  151  5.9999999999999996e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1721  putative glutathione peroxidase  47.24 
 
 		 184 aa  151  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326937  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1829  putative glutathione peroxidase  47.24 
 
 		 184 aa  151  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0559  glutathione peroxidase  43.65 
 
 		 161 aa  150  7e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4022  Glutathione peroxidase  43.02 
 
 		 181 aa  150  8.999999999999999e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.350366 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2741  glutathione peroxidase  43.5 
 
 		 162 aa  149  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000260986  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0250  glutathione peroxidase  44.58 
 
 		 164 aa  149  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02770  glutathione peroxidase  40.22 
 
 		 160 aa  149  3e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3267  glutathione peroxidase  46.95 
 
 		 158 aa  148  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0118  glutathione peroxidase  43.58 
 
 		 160 aa  148  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2329  putative glutathione peroxidase  42.29 
 
 		 161 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27520  putative glutathione peroxidase  43.9 
 
 		 161 aa  148  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.78279  normal  0.0357307 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0889  glutathione peroxidase  42.78 
 
 		 168 aa  148  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50899 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6295  glutathione peroxidase  43.6 
 
 		 162 aa  148  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7246  glutathione peroxidase  43.18 
 
 		 182 aa  147  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1334  Peroxiredoxin  41.67 
 
 		 169 aa  148  5e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0131674  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1364  glutathione peroxidase  47.56 
 
 		 158 aa  147  6e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00178793  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0226  Peroxiredoxin  42.46 
 
 		 163 aa  147  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1390  glutathione peroxidase  47.56 
 
 		 158 aa  147  6e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1872  glutathione peroxidase  42.22 
 
 		 159 aa  147  7e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0683727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0123  glutathione peroxidase  43.82 
 
 		 161 aa  147  7e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2054  glutathione peroxidase  43.02 
 
 		 159 aa  147  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4148  Glutathione peroxidase  44.85 
 
 		 158 aa  147  9e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.784559  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6042  glutathione peroxidase  43.02 
 
 		 159 aa  147  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0446  Glutathione peroxidase  42.78 
 
 		 157 aa  147  9e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000054357  normal  0.0344695 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2035  glutathione peroxidase  43.02 
 
 		 159 aa  147  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1597  glutathione peroxidase  45 
 
 		 159 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00235323  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3298  glutathione peroxidase  41.9 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.40101  decreased coverage  0.0000000224321 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1090  glutathione peroxidase  44.13 
 
 		 160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4077  glutathione peroxidase  41.34 
 
 		 162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1909  peroxiredoxin  42.53 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154084  normal  0.204796 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5344  glutathione peroxidase  41.9 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.213102 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2947  glutathione peroxidase  40.56 
 
 		 167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.781382  hitchhiker  0.0011995 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2683  Peroxiredoxin  44.12 
 
 		 160 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299838  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2910  Glutathione peroxidase  41.01 
 
 		 165 aa  145  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3665  glutathione peroxidase  44.85 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4117  Peroxiredoxin  44.58 
 
 		 182 aa  145  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>