134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_01270 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_01270  putative metal-binding protein  100 
 
 		 68 aa  132  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11220  copper/silver-translocating P-type ATPase  53.73 
 
 		 925 aa  67.8  0.00000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.363514 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0439  heavy metal translocating P-type ATPase  54.41 
 
 		 867 aa  67  0.00000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1553  heavy metal translocating P-type ATPase  49.21 
 
 		 859 aa  56.6  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.534956  normal  0.0124284 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0661  copper-translocating P-type ATPase  41.18 
 
 		 797 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0143  Heavy metal transport/detoxification protein  49.25 
 
 		 65 aa  51.2  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.816482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0521  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 807 aa  51.2  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2279  copper ion binding protein  42.42 
 
 		 69 aa  51.2  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0631  heavy metal translocating P-type ATPase  39.68 
 
 		 800 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735513 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5366  heavy metal translocating P-type ATPase  46.03 
 
 		 1021 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5494  heavy metal translocating P-type ATPase  46.03 
 
 		 1021 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0117323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0654  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  39.44 
 
 		 732 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  43.75 
 
 		 942 aa  50.1  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0625  heavy metal translocating P-type ATPase  39.68 
 
 		 799 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0643992  normal  0.943938 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0586  heavy metal translocating P-type ATPase  39.68 
 
 		 799 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.943128 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0141  Heavy metal transport/detoxification protein  45.45 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4777  heavy metal translocating P-type ATPase  44.44 
 
 		 1013 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.701128 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0745  Heavy metal transport/detoxification protein  42.19 
 
 		 471 aa  49.3  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000126874  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0206  Heavy metal transport/detoxification protein  38.81 
 
 		 69 aa  47.4  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.855434  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  42.65 
 
 		 827 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4827  heavy metal translocating P-type ATPase  45.9 
 
 		 946 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2244  heavy metal translocating P-type ATPase  42.19 
 
 		 737 aa  47  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10590  copper/silver-translocating P-type ATPase  38.1 
 
 		 755 aa  46.6  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.11171  normal  0.524998 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2449  Heavy metal transport/detoxification protein  46.77 
 
 		 64 aa  46.2  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228051  normal  0.0680079 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1680  Heavy metal transport/detoxification protein  38.71 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5373  heavy metal translocating P-type ATPase  44.26 
 
 		 937 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.698068 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  39.34 
 
 		 835 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2844  Heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  46.67 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3299  heavy metal translocating P-type ATPase  42.62 
 
 		 1182 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741237  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0081  mercuric transport protein periplasmic component  40 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.675229 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2131  mercuric transport protein periplasmic component  40 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0092  mercuric transport protein periplasmic component  38.46 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4578  heavy metal translocating P-type ATPase  34.92 
 
 		 799 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530867  decreased coverage  0.00687508 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0162  copper-translocating P-type ATPase  42.86 
 
 		 1040 aa  44.3  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2168  copper-translocating P-type ATPase  41.94 
 
 		 971 aa  44.3  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3691  heavy metal translocating P-type ATPase  44.07 
 
 		 793 aa  44.7  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  48.39 
 
 		 855 aa  44.3  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0240  mercuric transport protein periplasmic component  38.46 
 
 		 98 aa  44.7  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0081  heavy metal translocating P-type ATPase  42.42 
 
 		 751 aa  44.3  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.768822  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  36.51 
 
 		 792 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1298  putative mercuric reductase  37.5 
 
 		 562 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.881891 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21370  copper/silver-translocating P-type ATPase  43.55 
 
 		 819 aa  43.5  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.770676  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3789  heavy metal translocating P-type ATPase  36.36 
 
 		 836 aa  43.9  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0366996  normal  0.767636 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4065  heavy metal translocating P-type ATPase  36.36 
 
 		 836 aa  43.9  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0750  copper-translocating P-type ATPase  37.7 
 
 		 732 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6496  mercuric transport protein periplasmic protein  36.92 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43034  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  39.39 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1215  periplasmic mecuric binding protein, MerP  36.92 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6173  Hg(II) resistance protein MerP  36.92 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000203357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6346  Hg(II) resistance protein MerP  36.92 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000621364  unclonable  0.0000000448474 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1450  heavy metal transport/detoxification protein  34.92 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15470  periplasmic mercuric ion binding protein, MerP  36.92 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000149366  unclonable  3.5058299999999997e-22 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4343  mercuric transport protein periplasmic component  36.92 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0103  mercuric transport protein periplasmic component  36.92 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  38.1 
 
 		 792 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0420  Heavy metal transport/detoxification protein  46.15 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2339  mercuric transport protein periplasmic component  36.92 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4316  heavy metal translocating P-type ATPase  44.07 
 
 		 835 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2045  Heavy metal transport/detoxification protein  42.37 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0135722  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0657  copper-translocating P-type ATPase  33.85 
 
 		 724 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.737443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1312  mercuric transport protein periplasmic component  37.5 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629911  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3496  copper-translocating P-type ATPase  38.57 
 
 		 805 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1752  Heavy metal transport/detoxification protein  45.45 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2989  Heavy metal transport/detoxification protein  36.92 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4546  heavy metal translocating P-type ATPase  35.48 
 
 		 750 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2511  mercuric transport protein periplasmic protein  36.51 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.356859 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3490  mercuric transport protein periplasmic component  36.92 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1468  heavy metal transport/detoxification protein  34.92 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21010  copper-translocating P-type ATPase  39.34 
 
 		 829 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0821  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 790 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  42.62 
 
 		 827 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  37.7 
 
 		 840 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1661  heavy metal translocating P-type ATPase  39.34 
 
 		 825 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119959  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3584  copper-translocating P-type ATPase  38.57 
 
 		 805 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1686  heavy metal translocating P-type ATPase  41.67 
 
 		 811 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3243  heavy metal translocating P-type ATPase  40.98 
 
 		 841 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2021  copper-translocating P-type ATPase  41.67 
 
 		 811 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3653  heavy metal translocating P-type ATPase  38.57 
 
 		 805 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20130  cation transport ATPase  32.31 
 
 		 76 aa  41.6  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00552668  normal  0.0128064 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  36.07 
 
 		 798 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2126  Heavy metal transport/detoxification protein  38.98 
 
 		 93 aa  42  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0166  mercuric transport protein periplasmic component MerP  36.92 
 
 		 91 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.695125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10610  copper chaperone  36.51 
 
 		 69 aa  42  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.201144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  36.67 
 
 		 833 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3726  copper ion binding protein  41.54 
 
 		 64 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.663439  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  37.5 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3888  heavy metal translocating P-type ATPase  42.19 
 
 		 1087 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.840701  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1851  copper-translocating P-type ATPase  43.55 
 
 		 1061 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.845444  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1755  copper-translocating P-type ATPase  43.55 
 
 		 1061 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.55306  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  37.88 
 
 		 838 aa  41.6  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19780  copper chaperone  35.94 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208404  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0131  Heavy metal transport/detoxification protein  37.88 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0854  copper-translocating P-type ATPase  43.55 
 
 		 1061 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1144  copper-translocating P-type ATPase  43.55 
 
 		 1063 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0405  cation-transporting ATPase membrane protein  42.42 
 
 		 1061 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0316  cation-transporting ATPase membrane protein  43.55 
 
 		 1063 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.707407  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3586  heavy metal translocating P-type ATPase  39.68 
 
 		 824 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845066  hitchhiker  0.000954776 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1785  mercuric transport protein periplasmic component  37.5 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37235  normal  0.942363 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01410  periplasmic mercuric ion binding protein MerP  35.38 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>