More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_01050 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_01050  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  100 
 
 
314 aa  633  1e-180  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.250641 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1591  dioxygenase  56.19 
 
 
318 aa  345  5e-94  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.600793  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1178  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  55.05 
 
 
316 aa  339  4e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000736816  hitchhiker  0.00901561 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2074  2-nitropropane dioxygenase, NPD  53.44 
 
 
315 aa  336  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000655776  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1725  2-nitropropane dioxygenase, NPD  55.88 
 
 
313 aa  335  7.999999999999999e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000021316  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  50.48 
 
 
316 aa  323  2e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000252963  normal  0.0405419 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  52.86 
 
 
317 aa  323  3e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1989  2-nitropropane dioxygenase NPD  56.48 
 
 
325 aa  322  7e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0311  dioxygenase  51.3 
 
 
321 aa  322  7e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3819  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  55.45 
 
 
315 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000661973  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0640  2-nitropropane dioxygenase, NPD  57.19 
 
 
316 aa  320  1.9999999999999998e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000697959  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  50.99 
 
 
326 aa  305  6e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10270  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  52.29 
 
 
320 aa  305  8.000000000000001e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0212117  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0431  trans-2-enoyl-ACP reductase II  50.63 
 
 
321 aa  300  2e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0346  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  52.24 
 
 
319 aa  299  4e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.182837  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11150  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  54.14 
 
 
323 aa  298  9e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  49 
 
 
323 aa  297  2e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0946  2-nitropropane dioxygenase, NPD  55.86 
 
 
313 aa  282  5.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00349563  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0126  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  50 
 
 
314 aa  280  2e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0317277  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  50 
 
 
314 aa  280  2e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0565011  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1587  2-nitropropane dioxygenase, NPD  48.84 
 
 
309 aa  278  9e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000431839  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1035  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.93 
 
 
317 aa  241  1e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0997484  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3672  2-nitropropane dioxygenase  42.16 
 
 
311 aa  215  9e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2965  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.74 
 
 
338 aa  209  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.752049  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1961  dioxygenase  38.62 
 
 
281 aa  208  1e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7295  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.97 
 
 
311 aa  204  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00985  putative dioxygenase  39.8 
 
 
314 aa  203  4e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0964  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.39 
 
 
319 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0729206  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2858  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.38 
 
 
316 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1416  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  39.93 
 
 
313 aa  194  2e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.578712 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1839  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.32 
 
 
319 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0922  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.46 
 
 
319 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0098  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.89 
 
 
313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.718222  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6901  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.81 
 
 
328 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4186  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.86 
 
 
329 aa  178  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35 
 
 
334 aa  176  3e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1526  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.23 
 
 
355 aa  176  5e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172251  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2356  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.29 
 
 
386 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28800  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  32.29 
 
 
324 aa  173  3.9999999999999995e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.135482 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0580  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.37 
 
 
312 aa  172  5.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0758  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.58 
 
 
331 aa  172  6.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4504  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.85 
 
 
338 aa  171  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.372283  normal  0.089603 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3433  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.28 
 
 
331 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.0477625 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3574  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.59 
 
 
331 aa  171  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129826  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1854  hypothetical protein  35.02 
 
 
316 aa  170  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0198092  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3064  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.2 
 
 
311 aa  168  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3844  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.57 
 
 
315 aa  168  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2151  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.28 
 
 
332 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2021  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.75 
 
 
331 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.01256  normal  0.586253 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3306  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.65 
 
 
342 aa  167  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.152065  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2390  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.74 
 
 
314 aa  167  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0521943  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1222  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.83 
 
 
305 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3609  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.59 
 
 
323 aa  166  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5355  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.73 
 
 
328 aa  166  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6828  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.82 
 
 
325 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670939  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3815  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.18 
 
 
314 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0363  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.69 
 
 
325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5586  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.98 
 
 
305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.658342  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4142  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.22 
 
 
332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480237  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3013  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.41 
 
 
324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4296  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.22 
 
 
332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.458916  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4067  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.22 
 
 
332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3732  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.41 
 
 
324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1008  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.95 
 
 
323 aa  163  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1290  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.49 
 
 
378 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.62886  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0744  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.78 
 
 
354 aa  162  6e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1401  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.54 
 
 
324 aa  161  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0544  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  35.05 
 
 
326 aa  161  1e-38  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1257  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  31.92 
 
 
364 aa  161  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0826  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.33 
 
 
332 aa  160  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.289165  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.66 
 
 
324 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51080  putative dioxygenase  34.84 
 
 
328 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000609604 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0974  trans-2-enoyl-ACP reductase II  30.09 
 
 
348 aa  160  4e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1457  2-nitropropane dioxygenase  31.92 
 
 
365 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.907571 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1255  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  31.92 
 
 
364 aa  159  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1009  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.66 
 
 
345 aa  159  6e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1283  2-nitropropane dioxygenase  31.64 
 
 
364 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0152  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.6 
 
 
345 aa  158  1e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.174988  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1385  2-nitropropane dioxygenase  31.64 
 
 
364 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4359  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.16 
 
 
328 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255712  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5534  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.65 
 
 
323 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.99 
 
 
360 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0690438  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0800  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.29 
 
 
325 aa  157  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5434  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.23 
 
 
323 aa  157  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.295794  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2031  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.94 
 
 
342 aa  156  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6053  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.15 
 
 
335 aa  156  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483236  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1526  2-nitropropane dioxygenase  31.58 
 
 
364 aa  156  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2062  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35 
 
 
369 aa  156  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3001  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.86 
 
 
328 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.152083  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1483  2-nitropropane dioxygenase  31.86 
 
 
364 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4576  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.11 
 
 
330 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.403113  normal  0.255193 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5146  putative 2-nitropropane dioxygenase  33.75 
 
 
334 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199752  normal  0.0588296 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0738  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.28 
 
 
325 aa  153  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.11052  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0133  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.91 
 
 
352 aa  153  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.899957  normal  0.134277 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1435  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.15 
 
 
362 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.212936  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1419  nitropropane dioxygenase  32.09 
 
 
363 aa  152  7e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1075  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.15 
 
 
328 aa  152  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3924  nitropropane dioxygenase  31.64 
 
 
363 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2091  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.24 
 
 
362 aa  150  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4367  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.33 
 
 
325 aa  150  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>