More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2377 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2377  imidazolonepropionase  100 
 
 
424 aa  854    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.887652  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0914  imidazolonepropionase  61.61 
 
 
414 aa  491  9.999999999999999e-139  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2817  imidazolonepropionase  50 
 
 
423 aa  357  1.9999999999999998e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0607  imidazolonepropionase  45.13 
 
 
427 aa  338  9.999999999999999e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0328  imidazolonepropionase  44.36 
 
 
423 aa  336  3.9999999999999995e-91  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.835664 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1283  imidazolonepropionase  43.73 
 
 
424 aa  331  1e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2160  imidazolonepropionase  45.38 
 
 
424 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0242  imidazolonepropionase  43.39 
 
 
428 aa  317  2e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.61005  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4041  imidazolonepropionase  44.47 
 
 
405 aa  317  3e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3836  imidazolonepropionase  47.78 
 
 
439 aa  298  1e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.320819  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2310  imidazolonepropionase  42.78 
 
 
423 aa  298  1e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.299843  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0047  imidazolonepropionase  39.85 
 
 
413 aa  296  5e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4254  imidazolonepropionase  43.99 
 
 
408 aa  296  6e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0099  imidazolonepropionase  43.99 
 
 
410 aa  296  7e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0095  imidazolonepropionase  43.99 
 
 
408 aa  295  9e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0100  imidazolonepropionase  45.61 
 
 
408 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0077  imidazolonepropionase  43.48 
 
 
408 aa  292  8e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1291  imidazolonepropionase  44.06 
 
 
429 aa  291  2e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.563644  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3440  imidazolonepropionase  41.47 
 
 
423 aa  290  3e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3403  imidazolonepropionase  41.47 
 
 
423 aa  290  3e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3683  imidazolonepropionase  41.47 
 
 
423 aa  290  3e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0019435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3710  imidazolonepropionase  41.47 
 
 
423 aa  290  3e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.11084  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3660  imidazolonepropionase  41.47 
 
 
423 aa  290  3e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3678  imidazolonepropionase  41.21 
 
 
423 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.439583  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0095  imidazolonepropionase  42.46 
 
 
408 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3352  imidazolonepropionase  41.47 
 
 
423 aa  289  6e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3758  imidazolonepropionase  41.21 
 
 
423 aa  288  1e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0097  imidazolonepropionase  42.97 
 
 
408 aa  288  1e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0092  imidazolonepropionase  42.97 
 
 
408 aa  288  1e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3337  imidazolonepropionase  40.94 
 
 
423 aa  288  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.310939  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0098  imidazolonepropionase  42.97 
 
 
408 aa  288  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1558  imidazolonepropionase  40.94 
 
 
423 aa  286  4e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.240138  normal  0.0370079 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4449  imidazolonepropionase  44.48 
 
 
408 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3955  imidazolonepropionase  41.73 
 
 
410 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1659  imidazolonepropionase  44.07 
 
 
427 aa  280  4e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1595  imidazolonepropionase  43.09 
 
 
410 aa  279  8e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0081  imidazolonepropionase  40.35 
 
 
414 aa  278  1e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3759  imidazolonepropionase  43.63 
 
 
408 aa  276  5e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0456459 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1688  imidazolonepropionase  43.01 
 
 
403 aa  273  3e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.823771  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0080  imidazolonepropionase  42 
 
 
412 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4171  imidazolonepropionase  42.09 
 
 
414 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0655  imidazolonepropionase  37.34 
 
 
413 aa  273  5.000000000000001e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4105  imidazolonepropionase  46.52 
 
 
427 aa  271  2e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4840  imidazolonepropionase  43.06 
 
 
408 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1049  imidazolonepropionase  41.07 
 
 
429 aa  270  2.9999999999999997e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0280969  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09041  imidazolonepropionase  36.2 
 
 
411 aa  269  5e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.11911  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1298  imidazolonepropionase  41.87 
 
 
401 aa  266  4e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.167315 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4570  imidazolonepropionase  37.53 
 
 
411 aa  266  4e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256792  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0911  imidazolonepropionase  39.84 
 
 
418 aa  266  5e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.878232  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5080  imidazolonepropionase  42.67 
 
 
401 aa  265  8e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.359513  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4835  imidazolonepropionase  40.36 
 
 
401 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246682  normal  0.775663 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0585  imidazolonepropionase  44.87 
 
 
415 aa  265  1e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4904  imidazolonepropionase  42.82 
 
 
401 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67250  imidazolonepropionase  45.7 
 
 
402 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751738  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1810  imidazolonepropionase  41.88 
 
 
406 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35586  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2355  imidazolonepropionase  36.63 
 
 
412 aa  261  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5030  imidazolonepropionase  42.82 
 
 
401 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5277  imidazolonepropionase  40.53 
 
 
401 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2398  imidazolonepropionase  36.63 
 
 
412 aa  261  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3900  imidazolonepropionase  38.8 
 
 
406 aa  260  3e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2472  imidazolonepropionase  41.95 
 
 
411 aa  259  6e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4633  imidazolonepropionase  38.48 
 
 
399 aa  259  6e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0434  imidazolonepropionase  41.73 
 
 
401 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.133712  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1032  imidazolonepropionase  39.77 
 
 
403 aa  259  9e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2878  imidazolonepropionase  41.69 
 
 
411 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1534  imidazolonepropionase  41.76 
 
 
407 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2512  imidazolonepropionase  40.11 
 
 
406 aa  258  1e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0955381 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5826  imidazolonepropionase  43.44 
 
 
402 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0367  imidazolonepropionase  41.07 
 
 
401 aa  258  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5478  imidazolonepropionase  44.12 
 
 
407 aa  258  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.823405  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2113  imidazolonepropionase  40.11 
 
 
406 aa  258  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.669841  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2222  imidazolonepropionase  40.11 
 
 
406 aa  257  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.201457  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2852  imidazolonepropionase  41.93 
 
 
415 aa  257  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.579633  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2713  imidazolonepropionase  44.48 
 
 
423 aa  256  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.281626  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1303  imidazolonepropionase  43.46 
 
 
414 aa  256  6e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4073  imidazolonepropionase  46.53 
 
 
405 aa  256  7e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5909  imidazolonepropionase  42.82 
 
 
407 aa  256  7e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2168  imidazolonepropionase  42.82 
 
 
407 aa  256  7e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2084  imidazolonepropionase  43.24 
 
 
407 aa  255  9e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1102  imidazolonepropionase  43.82 
 
 
407 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.238791  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2360  imidazolonepropionase  40.05 
 
 
421 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0284206  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2207  imidazolonepropionase  43.24 
 
 
407 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2644  imidazolonepropionase  41.93 
 
 
408 aa  254  3e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142165  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2185  imidazolonepropionase  43.53 
 
 
407 aa  253  6e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.721027  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1781  imidazolonepropionase  41.99 
 
 
382 aa  251  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.381762 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2448  imidazolonepropionase  41.21 
 
 
421 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1253  imidazolonepropionase  41.69 
 
 
404 aa  251  1e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6452  imidazolonepropionase  40.21 
 
 
404 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0250  imidazolonepropionase  43.58 
 
 
393 aa  250  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.304312 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0649  imidazolonepropionase  42.08 
 
 
407 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0966  imidazolonepropionase  42.06 
 
 
382 aa  250  3e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0512874  normal  0.193869 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2719  imidazolonepropionase  42.08 
 
 
407 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1677  imidazolonepropionase  42.08 
 
 
407 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2362  imidazolonepropionase  42.08 
 
 
407 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.443035  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2923  imidazolonepropionase  42.08 
 
 
407 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1436  imidazolonepropionase  37.68 
 
 
405 aa  250  4e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632671  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2792  imidazolonepropionase  42.08 
 
 
407 aa  250  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1035  imidazolonepropionase  40.53 
 
 
425 aa  250  4e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.281228 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5926  imidazolonepropionase  38.73 
 
 
420 aa  249  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103117  normal  0.194871 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2663  imidazolonepropionase  42.08 
 
 
407 aa  249  6e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>