274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2705 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_2705  redoxin domain-containing protein  100 
 
 
193 aa  400  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00254505  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1431  redoxin domain-containing protein  51.05 
 
 
184 aa  197  9e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.37409  hitchhiker  0.00436762 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3117  thioredoxin, putative  52.46 
 
 
184 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1443  redoxin domain-containing protein  50 
 
 
184 aa  194  6e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.972914  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1378  redoxin domain-containing protein  49.47 
 
 
184 aa  192  4e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.519735  hitchhiker  0.000299029 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2340  redoxin domain-containing protein  51.59 
 
 
165 aa  156  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2523  thioredoxin-like protein  39.69 
 
 
223 aa  144  6e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.741385  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2196  thioredoxin, putative  37.99 
 
 
170 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.104453 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0365  thioredoxin protein  39.82 
 
 
187 aa  111  6e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0759  putative suppressor for copper-sensitivity D  47.32 
 
 
178 aa  101  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0406  putative thioredoxin protein  36.36 
 
 
183 aa  98.2  7e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02846  hypothetical protein  29.95 
 
 
170 aa  97.1  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1759  thioredoxin, putative  29.14 
 
 
188 aa  95.5  4e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0116  redoxin domain-containing protein  42.86 
 
 
174 aa  91.7  6e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0665765  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1378  thioredoxin family protein  41.07 
 
 
175 aa  89  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3068  suppressor for copper-sensitivity D, putative  27.72 
 
 
170 aa  88.6  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003039  membrane protein suppressor for copper-sensitivity ScsD  31.14 
 
 
152 aa  87  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4223  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.37 
 
 
174 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3198  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.29 
 
 
188 aa  86.7  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4151  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.37 
 
 
174 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4355  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.37 
 
 
174 aa  86.3  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3452  suppressor for copper-sensitivity D, putative  32.14 
 
 
169 aa  86.3  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0225  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.81 
 
 
179 aa  84  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.55912  normal  0.220757 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1075  suppressor for copper-sensitivity D  30.07 
 
 
168 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1226  suppressor for copper-sensitivity D  29.37 
 
 
168 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.608659 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0501  putative thioredoxin  29.05 
 
 
164 aa  83.2  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1211  suppressor for copper-sensitivity D  34.82 
 
 
168 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.746268  normal  0.80439 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1180  suppressor for copper-sensitivity D  34.82 
 
 
168 aa  82  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1191  suppressor for copper-sensitivity D  34.82 
 
 
168 aa  82.4  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3548  redoxin domain-containing protein  36.7 
 
 
182 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3003  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.64 
 
 
177 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0578774  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3348  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.68 
 
 
166 aa  78.6  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0565  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.08 
 
 
183 aa  77  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.711291  hitchhiker  0.0029887 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0176  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.74 
 
 
219 aa  75.5  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.102737  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0494  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.29 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.779352  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0403  suppressor for copper-sensitivity D, putative  24.69 
 
 
162 aa  64.7  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3647  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  27.34 
 
 
178 aa  62  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732955  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1546  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  26.92 
 
 
178 aa  62  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.756281 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3890  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  26.92 
 
 
178 aa  62  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0569168  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4321  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  26.92 
 
 
178 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3387  periplasmic protein thiol:disulfide oxidoreductase DsbE  25.62 
 
 
178 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0383915  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1872  heat shock protein DnaJ-like  26.15 
 
 
180 aa  60.1  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.506662  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25 
 
 
169 aa  57  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45300  cytochrome C biogenesis protein CcmG  27.27 
 
 
180 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3846  cytochrome c biogenesis protein CcmG  27.27 
 
 
180 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.971219  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1583  periplasmic protein thiol:disulfide oxidoreductase DsbE  23.95 
 
 
178 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.241926  normal  0.737644 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25 
 
 
169 aa  55.1  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30390  cytochrome C biogenesis protein  25.45 
 
 
176 aa  54.7  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0772446  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1311  transporter  28.09 
 
 
211 aa  53.5  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0971109  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  23.74 
 
 
170 aa  53.1  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1885  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.27 
 
 
447 aa  53.5  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.404766  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  29.41 
 
 
403 aa  52  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3484  redoxin domain-containing protein  24.35 
 
 
180 aa  51.6  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.234166  normal  0.21665 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0506  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  20.86 
 
 
175 aa  51.6  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0010915  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  27.43 
 
 
403 aa  51.2  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  25.96 
 
 
173 aa  51.2  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1288  thiol:disulfide interchange protein CycY  20 
 
 
208 aa  51.2  0.000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2205  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.6 
 
 
232 aa  50.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000183966 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3629  thiol:disulfide interchange protein DsbE  24.69 
 
 
178 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2046  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  27.93 
 
 
437 aa  50.4  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0189188  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3802  redoxin domain-containing protein  27.18 
 
 
278 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1566  hypothetical protein  22.29 
 
 
172 aa  50.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  23.57 
 
 
183 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4236  redoxin domain protein  29.63 
 
 
278 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1396  thiredoxin  23.85 
 
 
196 aa  50.1  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2761  thiol:disulfide interchange protein  21.83 
 
 
278 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376077  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1628  redoxin domain-containing protein  29.63 
 
 
278 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0881722  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2593  putative thiol:disulfide interchange protein  24 
 
 
276 aa  49.7  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.357458  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0371  thioredoxin  32.65 
 
 
187 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18200  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.27 
 
 
178 aa  50.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000397372  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2006  redoxin domain-containing protein  24.58 
 
 
176 aa  49.7  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0112011  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1180  RecJ exonuclease  26.32 
 
 
160 aa  49.7  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0271144 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5120  redoxin domain-containing protein  28.57 
 
 
269 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32600  thiol:disulfide interchange protein  21.13 
 
 
278 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.251961  normal  0.0539892 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1467  Redoxin domain protein  30.09 
 
 
193 aa  48.9  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.885317  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.32 
 
 
184 aa  48.9  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1905  putative thiol:disulfide interchange protein  26.92 
 
 
238 aa  48.9  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3088  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  24.11 
 
 
199 aa  48.9  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1980  thiol:disulfide interchange protein, putative  26.92 
 
 
238 aa  48.9  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.52 
 
 
171 aa  48.5  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03730  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  27.42 
 
 
212 aa  48.9  0.00005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0104824  normal  0.12424 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3262  redoxin domain-containing protein  28.57 
 
 
269 aa  48.9  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0170639  normal  0.755125 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1515  thioredoxin-like protein  23.58 
 
 
176 aa  48.9  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.748451 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0735  redoxin domain-containing protein  29.36 
 
 
211 aa  48.5  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0511  redoxin domain-containing protein  25.27 
 
 
270 aa  48.5  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.662182 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1411  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.36 
 
 
180 aa  48.5  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1768  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.56 
 
 
446 aa  48.5  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.197214  normal  0.508736 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0413  periplasmic protein thiol  23.23 
 
 
197 aa  48.5  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0344  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.69 
 
 
183 aa  48.5  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00014833  hitchhiker  0.000312976 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0377  periplasmic thioredoxin (cytochrome c biogenesis)  21.21 
 
 
198 aa  48.5  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2785  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  24.59 
 
 
179 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04380  cytochrome c biogenesis protein  27.93 
 
 
396 aa  48.1  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181653 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2023  redoxin domain-containing protein  27.55 
 
 
161 aa  48.1  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1000  redoxin domain-containing protein  24.29 
 
 
238 aa  47.8  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  21.37 
 
 
173 aa  47.8  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2921  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  26.67 
 
 
269 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253355  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1491  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.03 
 
 
247 aa  47.4  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.327411 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3560  redoxin domain-containing protein  25.47 
 
 
278 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4145  thiol:disulfide interchange protein DsbE  22.88 
 
 
185 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2488  thiol:disulfide interchange protein DsbE  22.88 
 
 
185 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.881771  normal  0.015378 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>