More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2484 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2484  ABC transporter related  100 
 
 		 225 aa  455  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1769  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  86.16 
 
 		 225 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0632527  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1898  ABC transporter related  54.21 
 
 		 236 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3310  putative phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  58.76 
 
 		 236 aa  236  3e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2346  ABC transporter-related protein  54.15 
 
 		 221 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0523662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1793  putative phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  53.4 
 
 		 231 aa  229  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.360055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1748  ABC transporter related  51.4 
 
 		 276 aa  219  3e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00373907  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1544  ABC transporter related  47.47 
 
 		 225 aa  214  5.9999999999999996e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.75811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2802  ABC transporter related  52.76 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0232474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2744  ABC transporter related  46.6 
 
 		 233 aa  175  4e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.600258  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1447  ABC transporter related  39.71 
 
 		 216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3493  ABC transporter related  40.1 
 
 		 226 aa  159  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1497  ABC transporter related  38.32 
 
 		 222 aa  158  6e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0790  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.66 
 
 		 265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2784  ABC transporter related  32.5 
 
 		 242 aa  119  4.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.197707 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3919  ABC transporter related protein  33.64 
 
 		 275 aa  113  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12501  hypothetical protein  32.1 
 
 		 261 aa  112  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4361  ABC transporter related  32.92 
 
 		 264 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0829786  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07271  putative phosphonate ABC transporter  30.61 
 
 		 246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0413071  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07251  putative phosphonate ABC transporter  30.61 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21160  ABC transporter ATP-binding protein  32.79 
 
 		 267 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.511735  normal  0.707952 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0694  ABC transporter  34.35 
 
 		 265 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.109577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0672  ATPase  32.24 
 
 		 246 aa  108  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1805  ABC transporter ATP-binding protein  32.38 
 
 		 267 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1649  ABC transporter related protein  31.71 
 
 		 248 aa  108  8.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1825  ABC transporter related  30.7 
 
 		 275 aa  106  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.123024 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3337  ABC transporter related  31.88 
 
 		 274 aa  105  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.373917 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2237  ABC transporter related  33.33 
 
 		 277 aa  105  8e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0829  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  28.94 
 
 		 280 aa  104  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2433  ABC transporter-like  32.44 
 
 		 265 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0814206  normal  0.123252 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1722  ABC transporter-related protein  32.44 
 
 		 279 aa  104  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000201925 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0130  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component  29.76 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000163104  hitchhiker  0.00000028065 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0825  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.13 
 
 		 269 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal  0.0442115 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07451  putative phosphonate ABC transporter  33.06 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3256  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  30.43 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.485781  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1616  ABC transporter related  33.04 
 
 		 277 aa  103  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6355  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  31.17 
 
 		 264 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.424299  normal  0.5531 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3198  ABC transporter related  31.56 
 
 		 266 aa  102  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.012913 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0597  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  32.63 
 
 		 270 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00266956 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2555  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  30.61 
 
 		 277 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.205375  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0914  ATP-binding protein of phosphonate ABC transporter  31.72 
 
 		 275 aa  102  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.672205  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0866  ABC transporter related  33.74 
 
 		 264 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2013  ABC transporter related  30.49 
 
 		 277 aa  102  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.697342  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1690  ABC transporter related  30.49 
 
 		 277 aa  102  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.219092 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0437  ABC transporter related protein  30.21 
 
 		 235 aa  101  7e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1745  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  29.8 
 
 		 278 aa  101  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.35608  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4994  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  31.08 
 
 		 260 aa  101  8e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0393  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  29.41 
 
 		 264 aa  101  8e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.385125 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03977  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  31.74 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2247  ABC transporter  29.71 
 
 		 277 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4571  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  31.74 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3921  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  31.74 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03938  hypothetical protein  31.74 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5619  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  31.74 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3886  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  32.17 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1278  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  30.12 
 
 		 281 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3242  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  30.12 
 
 		 279 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.980912  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2056  ABC transporter related  31.56 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.128496  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3993  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  30.12 
 
 		 279 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.642623  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07291  putative phosphonate ABC transporter  29.61 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.305194  hitchhiker  0.00460957 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0839  ABC phophonates transporter, ATPase subunit PhnC  29.96 
 
 		 301 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0851593 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4346  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  31.74 
 
 		 262 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4659  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  31.74 
 
 		 262 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02560  ABC transporter  30.12 
 
 		 249 aa  99.8  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.092761  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5858  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  29.39 
 
 		 269 aa  99.4  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3350  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  28.27 
 
 		 307 aa  99  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3338  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  28.27 
 
 		 307 aa  99  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2916  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  28.4 
 
 		 284 aa  98.6  6e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.178582  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3304  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  28.27 
 
 		 307 aa  99  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.296205  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3465  ABC transporter related  30.77 
 
 		 241 aa  98.6  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3591  thiamine transporter ATP-binding subunit  32.03 
 
 		 232 aa  98.2  9e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.205746  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0117  thiamine transporter ATP-binding subunit  32.47 
 
 		 235 aa  98.2  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.051764 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0110  thiamine transporter ATP-binding subunit  32.47 
 
 		 235 aa  98.2  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.697041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0068  thiamine transporter ATP-binding subunit  32.03 
 
 		 232 aa  98.2  9e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0070  thiamine transporter ATP-binding subunit  32.03 
 
 		 232 aa  98.2  9e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00068  thiamin transporter subunit  32.03 
 
 		 232 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0070  thiamine transporter ATP-binding subunit  32.03 
 
 		 232 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.351626  normal  0.566701 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0117  thiamine transporter ATP-binding subunit  32.47 
 
 		 235 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00067  hypothetical protein  32.03 
 
 		 232 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0112  thiamine transporter ATP-binding subunit  32.47 
 
 		 235 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.218472 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0113  thiamine transporter ATP-binding subunit  32.47 
 
 		 235 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.42965 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0309  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  31.8 
 
 		 262 aa  97.4  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.053951 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4524  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  28.57 
 
 		 307 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3694  ABC phosphonate transporter ATP-binding protein  30.67 
 
 		 274 aa  97.8  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2407  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  27.85 
 
 		 307 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1233  ABC transporter related  34.68 
 
 		 340 aa  97.4  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1201  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  31.63 
 
 		 370 aa  97.4  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2593  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  27.85 
 
 		 307 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0323  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  27.85 
 
 		 307 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.558714  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2156  phosphonate ABC transporter ATP-binding  31.72 
 
 		 253 aa  97.4  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.440278 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5876  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  28.76 
 
 		 267 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0058  thiamine transporter ATP-binding subunit  32.03 
 
 		 232 aa  97.4  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1184  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  27.85 
 
 		 307 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0104  ATPase  28.76 
 
 		 244 aa  96.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2080  ABC transporter related  31.88 
 
 		 272 aa  96.3  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0607  ABC transporter related  31.03 
 
 		 355 aa  96.3  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000630486 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07851  putative phosphonate ABC transporter  32.1 
 
 		 245 aa  96.3  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266674 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2187  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  30.13 
 
 		 275 aa  96.3  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20300  ATP-binding component of ABC phosphonate transporter  28.98 
 
 		 278 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.540657  normal  0.410183 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl572  phosphonate ABC transporter ATP-binding component  29.71 
 
 		 249 aa  95.9  4e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>