More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1191 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A1191  suppressor for copper-sensitivity D  100 
 
 
168 aa  334  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1180  suppressor for copper-sensitivity D  99.4 
 
 
168 aa  333  7.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1211  suppressor for copper-sensitivity D  98.81 
 
 
168 aa  330  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.746268  normal  0.80439 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1075  suppressor for copper-sensitivity D  98.21 
 
 
168 aa  329  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1226  suppressor for copper-sensitivity D  98.81 
 
 
168 aa  329  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.608659 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3348  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  65.43 
 
 
166 aa  216  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1378  thioredoxin family protein  36.81 
 
 
175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0759  putative suppressor for copper-sensitivity D  36.14 
 
 
178 aa  128  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3198  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.61 
 
 
188 aa  125  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3003  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.76 
 
 
177 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0578774  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0116  redoxin domain-containing protein  35.85 
 
 
174 aa  117  6e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0665765  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4223  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.55 
 
 
174 aa  111  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0501  putative thioredoxin  32.34 
 
 
164 aa  111  5e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4151  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.15 
 
 
174 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4355  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.76 
 
 
174 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0406  putative thioredoxin protein  35.8 
 
 
183 aa  110  9e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0365  thioredoxin protein  30.12 
 
 
187 aa  107  6e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3548  redoxin domain-containing protein  34.55 
 
 
182 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0176  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.76 
 
 
219 aa  107  9.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.102737  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1443  redoxin domain-containing protein  41.59 
 
 
184 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.972914  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1378  redoxin domain-containing protein  40.71 
 
 
184 aa  102  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.519735  hitchhiker  0.000299029 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2523  thioredoxin-like protein  40 
 
 
223 aa  101  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.741385  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1431  redoxin domain-containing protein  40.54 
 
 
184 aa  100  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.37409  hitchhiker  0.00436762 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02846  hypothetical protein  34.36 
 
 
170 aa  99  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3117  thioredoxin, putative  33.54 
 
 
184 aa  98.6  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2340  redoxin domain-containing protein  41.94 
 
 
165 aa  95.9  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003039  membrane protein suppressor for copper-sensitivity ScsD  32.03 
 
 
152 aa  89.7  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0565  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.16 
 
 
183 aa  89.4  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.711291  hitchhiker  0.0029887 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0225  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.09 
 
 
179 aa  86.7  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.55912  normal  0.220757 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2196  thioredoxin, putative  33.54 
 
 
170 aa  84.7  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.104453 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2705  redoxin domain-containing protein  34.82 
 
 
193 aa  82  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00254505  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3068  suppressor for copper-sensitivity D, putative  30.77 
 
 
170 aa  80.5  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3452  suppressor for copper-sensitivity D, putative  30.06 
 
 
169 aa  75.1  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0494  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.95 
 
 
210 aa  73.9  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.779352  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0403  suppressor for copper-sensitivity D, putative  35.33 
 
 
162 aa  73.9  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1759  thioredoxin, putative  27.88 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.89 
 
 
166 aa  66.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6120  redoxin domain-containing protein  34.48 
 
 
209 aa  64.7  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1064  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  38.02 
 
 
361 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.811729  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  29.33 
 
 
167 aa  63.2  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0739  thioredoxin  28.57 
 
 
104 aa  61.2  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.186683  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  30.25 
 
 
184 aa  60.5  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0525  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.65 
 
 
178 aa  60.5  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000136072  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1239  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  33.85 
 
 
422 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.502856  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1789  Redoxin domain protein  32.77 
 
 
165 aa  58.9  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  30 
 
 
173 aa  58.9  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2714  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  27.73 
 
 
363 aa  58.5  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.420342 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3536  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.76 
 
 
186 aa  58.2  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3720  ahpC/TSA family protein  28.1 
 
 
191 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1566  hypothetical protein  27.01 
 
 
172 aa  57.8  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  29.31 
 
 
165 aa  57.8  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0311  hypothetical protein  32.38 
 
 
102 aa  57.4  0.00000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3455  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.35 
 
 
168 aa  57.4  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.61185  normal  0.0436894 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2557  putative heme-binding protein  30 
 
 
143 aa  57.4  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.299241  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2704  hypothetical protein  31.67 
 
 
205 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.396222  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4074  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.34 
 
 
355 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11808  thioredoxin, putative  31.78 
 
 
211 aa  56.6  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0805  peroxiredoxin-like  28.7 
 
 
176 aa  57  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0511  redoxin domain-containing protein  28.48 
 
 
270 aa  57  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.662182 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18200  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.09 
 
 
178 aa  56.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000397372  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0463  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  31.29 
 
 
179 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.198306 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  32.29 
 
 
108 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0061  Redoxin domain protein  30.08 
 
 
197 aa  56.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1391  Redoxin domain protein  31.93 
 
 
165 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1647  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.53 
 
 
184 aa  56.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227241  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  31.19 
 
 
107 aa  55.8  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1661  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.97 
 
 
192 aa  55.5  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3631  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.63 
 
 
187 aa  55.5  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.540722  normal  0.6253 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1146  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  34.38 
 
 
433 aa  55.1  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299964  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  30 
 
 
403 aa  55.5  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1852  thioredoxin family protein  29.73 
 
 
184 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.056942  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3231  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.97 
 
 
160 aa  55.1  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0496837 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1627  thioredoxin family protein  29.73 
 
 
184 aa  55.1  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000123929  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1829  thioredoxin family protein  29.73 
 
 
184 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1597  thioredoxin family protein  29.73 
 
 
184 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0109831  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  31.78 
 
 
182 aa  55.1  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0691  thioredoxin  29.91 
 
 
105 aa  54.7  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5008  Redoxin domain protein  33.88 
 
 
248 aa  54.7  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437471  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  31.62 
 
 
109 aa  54.7  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0510  putative secreted protein  31.62 
 
 
209 aa  54.3  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113668  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1798  thioredoxin domain-containing protein  33.68 
 
 
90 aa  54.7  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.317909  normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3647  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  23.23 
 
 
178 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732955  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3484  redoxin domain-containing protein  26.32 
 
 
180 aa  54.7  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.234166  normal  0.21665 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1024  Thioredoxin domain protein  30.53 
 
 
91 aa  54.3  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  29.09 
 
 
403 aa  54.3  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37 
 
 
196 aa  54.3  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3298  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.45 
 
 
191 aa  53.9  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61408  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  29.25 
 
 
107 aa  53.9  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4318  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.96 
 
 
204 aa  53.9  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.077918 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4321  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  23.23 
 
 
178 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0760  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37 
 
 
228 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3632  ahpC/TSA family protein  27.27 
 
 
191 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0183092  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.21 
 
 
169 aa  53.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  24.09 
 
 
170 aa  53.9  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  34.62 
 
 
105 aa  53.5  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3774  thiol-disulfide isomerase-like protein  27.63 
 
 
173 aa  53.9  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166782  normal  0.0186728 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2789  thiol:disulfide interchange protein  31.34 
 
 
269 aa  53.9  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1546  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  23.23 
 
 
178 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.756281 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1904  thioredoxin family protein  28.83 
 
 
184 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000368388  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003119  putative thiol:disulfide oxidoreductase nitrite reductase complex assembly  31.36 
 
 
153 aa  53.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>