90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3610 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3610  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3857  hypothetical protein  85.26 
 
 		 275 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4037  hypothetical protein  85.71 
 
 		 261 aa  435  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3921  hypothetical protein  84.9 
 
 		 261 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3828  hypothetical protein  84.9 
 
 		 261 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.23857 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0100  hypothetical protein  85.48 
 
 		 259 aa  422  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4202  protein of unknown function DUF548  85.48 
 
 		 248 aa  421  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4241  hypothetical protein  85.08 
 
 		 248 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4375  hypothetical protein  85.48 
 
 		 248 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0164  hypothetical protein  82.04 
 
 		 258 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.119512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4047  hypothetical protein  81.27 
 
 		 253 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0144  hypothetical protein  80.24 
 
 		 262 aa  408  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3647  hypothetical protein  80.82 
 
 		 259 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3564  hypothetical protein  77.22 
 
 		 248 aa  373  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4658  hypothetical protein  87.69 
 
 		 195 aa  350  2e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001949  SAM-dependent methyltransferase  69.23 
 
 		 259 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00529  SAM-dependent methyltransferase  68.83 
 
 		 259 aa  324  8.000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2441  hypothetical protein  65.32 
 
 		 292 aa  313  1.9999999999999998e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2945  hypothetical protein  70.12 
 
 		 260 aa  307  1.0000000000000001e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4700  putative methyltransferase  65.79 
 
 		 248 aa  301  6.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0117  putative methyltransferase  66.96 
 
 		 256 aa  301  8.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4038  putative methyltransferase  66.96 
 
 		 256 aa  300  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3796  putative methyltransferase  65.2 
 
 		 252 aa  295  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3967  putative methyltransferase  65.2 
 
 		 252 aa  295  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3863  putative methyltransferase  65.2 
 
 		 252 aa  295  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.980604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3906  putative methyltransferase  65.2 
 
 		 252 aa  294  9e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3825  putative methyltransferase  64.76 
 
 		 250 aa  294  9e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3979  putative methyltransferase  64.76 
 
 		 250 aa  294  1e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0219  putative methyltransferase  64.76 
 
 		 250 aa  294  1e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3697  putative methyltransferase  64.76 
 
 		 250 aa  294  1e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3786  putative methyltransferase  64.76 
 
 		 252 aa  294  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.711834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4844  putative methyltransferase  64.76 
 
 		 250 aa  294  1e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3786  putative methyltransferase  64.76 
 
 		 250 aa  294  1e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03299  hypothetical protein  64.76 
 
 		 250 aa  294  1e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.487194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0218  protein of unknown function DUF548  64.76 
 
 		 250 aa  294  1e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3910  putative methyltransferase  64.76 
 
 		 254 aa  293  1e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03346  predicted SAM-dependent methyltransferase  64.76 
 
 		 250 aa  294  1e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.428516  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0006  putative methyltransferase  63.4 
 
 		 250 aa  278  8e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84846  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0138  hypothetical protein  60.58 
 
 		 272 aa  276  2e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2836  hypothetical protein  60.34 
 
 		 253 aa  275  6e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.574935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4480  putative methyltransferase  61.97 
 
 		 248 aa  268  5e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0305  SAM-dependent methyltransferase  61.24 
 
 		 254 aa  267  1e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4197  putative methyltransferase  61.54 
 
 		 248 aa  265  4e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0009  putative methyltransferase  64.94 
 
 		 248 aa  263  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0354  hypothetical protein  54.24 
 
 		 282 aa  225  4e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00159  hypothetical protein  52.52 
 
 		 258 aa  219  3.9999999999999997e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1325  hypothetical protein  51.28 
 
 		 269 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0554428 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1515  hypothetical protein  51.28 
 
 		 287 aa  217  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1118  hypothetical protein  53.22 
 
 		 258 aa  215  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39240  hypothetical protein  51.28 
 
 		 277 aa  214  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4209  hypothetical protein  53.78 
 
 		 258 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.461905 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1513  hypothetical protein  53.78 
 
 		 258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4104  hypothetical protein  53.78 
 
 		 258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1077  hypothetical protein  47.43 
 
 		 281 aa  210  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16770  hypothetical protein  51.65 
 
 		 261 aa  209  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1459  hypothetical protein  53.51 
 
 		 261 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0432  hypothetical protein  51.57 
 
 		 245 aa  207  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.759141  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3353  hypothetical protein  52.02 
 
 		 268 aa  205  6e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1199  hypothetical protein  53.85 
 
 		 255 aa  199  3e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2612  hypothetical protein  48 
 
 		 269 aa  193  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.368816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1259  hypothetical protein  55.44 
 
 		 264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.872111 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2229  hypothetical protein  47.89 
 
 		 278 aa  186  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.552505  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0860  hypothetical protein  48.77 
 
 		 256 aa  186  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.301804  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1058  hypothetical protein  48.84 
 
 		 254 aa  186  3e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.019854  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2080  hypothetical protein  49.3 
 
 		 254 aa  186  3e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0819658  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0108  SAM-dependent methyltransferase  48.84 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1990  hypothetical protein  46.57 
 
 		 276 aa  174  9.999999999999999e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.287455  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1046  hypothetical protein  48.73 
 
 		 205 aa  159  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.183803  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3348  hypothetical protein  42.86 
 
 		 220 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.870462  normal  0.145853 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1343  protein of unknown function DUF548  46.59 
 
 		 276 aa  145  8.000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2042  hypothetical protein  44.04 
 
 		 218 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1882  hypothetical protein  42.44 
 
 		 253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1802  hypothetical protein  36.52 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1801  hypothetical protein  36.84 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4001  protein of unknown function DUF548  44.27 
 
 		 204 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17290  Protein of unknown function (DUF548)  43.82 
 
 		 214 aa  121  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.559869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2240  hypothetical protein  39.91 
 
 		 264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0893  protein of unknown function DUF548  39.7 
 
 		 250 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412052 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45482  predicted protein  37.61 
 
 		 362 aa  105  7e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2074  hypothetical protein  40 
 
 		 267 aa  104  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1704  hypothetical protein  33.01 
 
 		 296 aa  88.2  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.498266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1982  hypothetical protein  30.73 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.582001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0542  hypothetical protein  29.15 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0494744  unclonable  0.00000000143432 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2731  protein of unknown function DUF548  35.98 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000173864  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1923  protein of unknown function DUF548  26.7 
 
 		 261 aa  54.7  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1767  hypothetical protein  30.72 
 
 		 277 aa  53.5  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00162689  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2129  protein of unknown function DUF548  29.14 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0247639  normal  0.0288385 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0978  hypothetical protein  26.88 
 
 		 258 aa  45.8  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000585304  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1488  protein of unknown function DUF548  36.17 
 
 		 266 aa  42.7  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2180  hypothetical protein  27.15 
 
 		 258 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>