More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3299 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_3299  protein-glutamate O-methyltransferase  100 
 
 
275 aa  567  1e-161  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0783  protein-glutamate O-methyltransferase  56.02 
 
 
269 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.827996  normal  0.901412 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0910  chemotaxis protein methyltransferase CheR  55.64 
 
 
269 aa  314  9e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1146  MCP methyltransferase, CheR-type  55.89 
 
 
270 aa  312  2.9999999999999996e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.492811  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3546  MCP methyltransferase, CheR-type  51.88 
 
 
267 aa  288  5.0000000000000004e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.203132  normal  0.882443 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0904  MCP methyltransferase, CheR-type  51.53 
 
 
267 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1320  MCP methyltransferase, CheR-type  45.72 
 
 
269 aa  277  1e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.711153  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04754  CheR methyltransferase, SAM binding domain  48.28 
 
 
268 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584849  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2325  chemotaxis protein methyltransferase CheR  46.27 
 
 
275 aa  248  6e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0635  MCP methyltransferase, CheR-type  44.24 
 
 
301 aa  235  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0626  MCP methyltransferase, CheR-type  44.24 
 
 
301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.325159  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1565  protein-glutamate O-methyltransferase  41.35 
 
 
269 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.724121  normal  0.553309 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0645  protein-glutamate O-methyltransferase  42.59 
 
 
302 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0464454  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0601  MCP methyltransferase, CheR-type  43.12 
 
 
299 aa  229  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0335  MCP methyltransferase, CheR-type  41.73 
 
 
280 aa  219  5e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1528  MCP methyltransferase, CheR-type  41.6 
 
 
266 aa  216  4e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.168715 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0428  MCP methyltransferase, CheR-type  40.74 
 
 
275 aa  213  2.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1143  chemotaxis protein methyltransferase CheR  37.5 
 
 
292 aa  206  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0207024  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0661  MCP methyltransferase, CheR-type  39.93 
 
 
271 aa  206  4e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1415  MCP methyltransferase, CheR-type  39.26 
 
 
281 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.299383  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1731  MCP methyltransferase, CheR-type  38.35 
 
 
290 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2420  MCP methyltransferase, CheR-type  36.24 
 
 
289 aa  198  6e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.503139  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0878  MCP methyltransferase, CheR-type  41.26 
 
 
275 aa  196  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2618  MCP methyltransferase, CheR-type  36.3 
 
 
292 aa  195  7e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1595  MCP methyltransferase, CheR-type  36.67 
 
 
284 aa  194  9e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2984  protein-glutamate O-methyltransferase  38.97 
 
 
285 aa  193  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1539  protein-glutamate O-methyltransferase  36.4 
 
 
291 aa  193  3e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1610  MCP methyltransferase, CheR-type  36.63 
 
 
274 aa  192  5e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2815  MCP methyltransferase, CheR-type  39.78 
 
 
275 aa  187  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.904459  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4819  MCP methyltransferase, CheR-type  39.48 
 
 
282 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.728077  hitchhiker  0.00962017 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0466  MCP methyltransferase, CheR-type  35.9 
 
 
295 aa  186  3e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.176521 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2244  protein-glutamate O-methyltransferase  37.84 
 
 
281 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00847323  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0614  MCP methyltransferase, CheR-type  38.69 
 
 
275 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0483798 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4421  protein-glutamate O-methyltransferase  38.89 
 
 
277 aa  183  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0141  MCP methyltransferase, CheR-type  38.97 
 
 
280 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0351158  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0183  protein-glutamate O-methyltransferase  34.96 
 
 
280 aa  183  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1587  chemotaxis methyltransferase, CheR2  39.25 
 
 
278 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0239  protein-glutamate O-methyltransferase  39.25 
 
 
278 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2146  MCP methyltransferase, CheR-type  35.42 
 
 
271 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2115  protein-glutamate O-methyltransferase  37.74 
 
 
281 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2361  protein-glutamate O-methyltransferase  37.45 
 
 
281 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0163  MCP methyltransferase, CheR-type  36.47 
 
 
280 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22590  Protein-glutamate O-methyltransferase  39.26 
 
 
309 aa  181  8.000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0875  MCP methyltransferase, CheR-type  34.69 
 
 
271 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2105  MCP methyltransferase, CheR-type  35.06 
 
 
283 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2101  MCP methyltransferase, CheR-type  37.45 
 
 
281 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.60784  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2215  MCP methyltransferase, CheR-type  36.68 
 
 
276 aa  181  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.556164  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0757  MCP methyltransferase, CheR-type  35.19 
 
 
275 aa  180  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1884  MCP methyltransferase, CheR-type  36.29 
 
 
276 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0878954 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2090  MCP methyltransferase, CheR-type  36.29 
 
 
276 aa  179  4e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.853389 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0295  chemotaxis protein methyltransferase CheR  38.89 
 
 
277 aa  178  7e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.468009  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3943  MCP methyltransferase, CheR-type  37.69 
 
 
290 aa  178  7e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.331314  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2166  protein-glutamate O-methyltransferase  38.08 
 
 
292 aa  178  7e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00016475  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4027  MCP methyltransferase, CheR-type  37.31 
 
 
290 aa  178  9e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000815784 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1043  MCP methyltransferase, CheR-type  37.65 
 
 
283 aa  178  9e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0089  MCP methyltransferase, CheR-type  34.07 
 
 
283 aa  177  1e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0110  MCP methyltransferase, CheR-type  35.23 
 
 
288 aa  177  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3139  protein-glutamate O-methyltransferase  37.64 
 
 
291 aa  177  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1300  chemotaxis methyltransferase CheR  39.29 
 
 
286 aa  176  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000891589 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0267  protein-glutamate O-methyltransferase  38.87 
 
 
278 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.647736 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1756  MCP methyltransferase, CheR-type  39.29 
 
 
286 aa  176  4e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0553359  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2622  chemotaxis methyltransferase CheR  39.29 
 
 
286 aa  176  4e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000206628 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1748  chemotaxis methyltransferase CheR  39.29 
 
 
286 aa  176  4e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1980  chemotaxis methyltransferase CheR  39.29 
 
 
286 aa  176  4e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2177  chemotaxis methyltransferase CheR  39.29 
 
 
286 aa  176  4e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2124  chemotaxis protein methyltransferase CheR  35.98 
 
 
277 aa  175  6e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01855  chemotaxis regulator, protein-glutamate methyltransferase  39.29 
 
 
286 aa  175  7e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.435118  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01844  hypothetical protein  39.29 
 
 
286 aa  175  7e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.370669  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2117  chemotaxis methyltransferase CheR  38.89 
 
 
286 aa  175  7e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.396301  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4669  MCP methyltransferase, CheR-type  38.1 
 
 
283 aa  175  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.225745  normal  0.563767 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3218  MCP methyltransferase, CheR-type  36.59 
 
 
295 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.108561 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1405  MCP methyltransferase, CheR-type  37.82 
 
 
284 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.216379  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0152  chemotaxis protein methyltransferase CheR  36.76 
 
 
276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7834  MCP methyltransferase, CheR-type  36.26 
 
 
275 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3267  MCP methyltransferase, CheR-type  38.15 
 
 
277 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.335431  hitchhiker  0.0000324119 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0040  CheR methyltransferase, SAM binding domain protein  38.41 
 
 
283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1077  MCP methyltransferase, CheR-type  34.6 
 
 
300 aa  172  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329536 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0625  MCP methyltransferase, CheR-type  34.15 
 
 
290 aa  172  5e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0730  MCP methyltransferase, CheR-type  35.36 
 
 
300 aa  171  9e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0443063  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2118  MCP methyltransferase, CheR-type  37.91 
 
 
283 aa  171  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0777  MCP methyltransferase, CheR-type  37.26 
 
 
297 aa  171  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6731  MCP methyltransferase, CheR-type  34.56 
 
 
273 aa  170  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079631  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3788  MCP methyltransferase, CheR-type  35.23 
 
 
297 aa  169  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3302  protein-glutamate O-methyltransferase  35.47 
 
 
265 aa  169  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3855  MCP methyltransferase, CheR-type  36.23 
 
 
291 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3062  MCP methyltransferase, CheR-type  34.85 
 
 
297 aa  168  8e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.509251  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1382  MCP methyltransferase, CheR-type  35.79 
 
 
303 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3204  MCP methyltransferase, CheR-type  37.01 
 
 
285 aa  168  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.25041  normal  0.841939 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2073  chemotaxis methyltransferase CheR  35.23 
 
 
288 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.50771  hitchhiker  0.000251677 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2078  chemotaxis methyltransferase CheR  35.23 
 
 
288 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.687941  hitchhiker  2.73756e-16 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1327  chemotaxis methyltransferase CheR  35.23 
 
 
288 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000151288 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0808  MCP methyltransferase, CheR-type  35.77 
 
 
272 aa  166  4e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2133  chemotaxis methyltransferase CheR  35.23 
 
 
288 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000021864 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1204  chemotaxis methyltransferase CheR  35.23 
 
 
288 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1371  MCP methyltransferase, CheR-type  36.68 
 
 
268 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.214752  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1932  MCP methyltransferase, CheR-type  36.69 
 
 
283 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4031  MCP methyltransferase, CheR-type  35.88 
 
 
287 aa  165  8e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.236096  normal  0.66198 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3916  MCP methyltransferase, CheR-type  35.77 
 
 
289 aa  165  9e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186094  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1710  MCP methyltransferase, CheR-type  34.83 
 
 
285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3811  MCP methyltransferase, CheR-type  35.34 
 
 
318 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>