68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0982 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_3438  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  83.56 
 
 		 444 aa  773    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0116179  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0938  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  83.78 
 
 		 444 aa  776    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000225132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2539  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  77.93 
 
 		 444 aa  722    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.289464  normal  0.687458 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0924  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  83.56 
 
 		 444 aa  773    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0108933  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0949  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  87.61 
 
 		 444 aa  799    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00658767  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2881  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  82.43 
 
 		 444 aa  761    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0069433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0974  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  83.33 
 
 		 444 aa  772    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000147177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0936  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  83.33 
 
 		 444 aa  772    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00150423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0940  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  84.91 
 
 		 444 aa  786    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000241394  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0982  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  100 
 
 		 444 aa  905    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00150334  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3431  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  81.31 
 
 		 444 aa  756    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.210332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3103  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  80.63 
 
 		 444 aa  748    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3366  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  83.33 
 
 		 444 aa  773    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00916796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3563  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  83.78 
 
 		 444 aa  775    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0832128  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1103  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  83.78 
 
 		 444 aa  770    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3617  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  79.95 
 
 		 472 aa  747    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00607859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0452  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  67.04 
 
 		 457 aa  632  1e-180  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.441683  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1080  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  64.04 
 
 		 445 aa  598  1e-170  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03275  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  63.31 
 
 		 466 aa  588  1e-167  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1884  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  63.53 
 
 		 462 aa  589  1e-167  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000568593  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00745  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  62.33 
 
 		 446 aa  580  1e-164  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1693  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  62.19 
 
 		 446 aa  573  1.0000000000000001e-162  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002707  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  62.47 
 
 		 428 aa  562  1.0000000000000001e-159  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000207238  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0949  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  61.43 
 
 		 446 aa  564  1.0000000000000001e-159  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3305  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  60.63 
 
 		 453 aa  553  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.478432  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0746  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  59.42 
 
 		 446 aa  548  1e-155  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.122906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3166  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  60.4 
 
 		 447 aa  549  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.544269  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3317  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  60.4 
 
 		 447 aa  550  1e-155  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000807334 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0953  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  61.47 
 
 		 449 aa  530  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.870804  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0902  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  58.94 
 
 		 456 aa  527  1e-148  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1797  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  57.27 
 
 		 447 aa  526  1e-148  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1931  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  56.92 
 
 		 451 aa  522  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3272  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  58.94 
 
 		 456 aa  522  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0849  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  58.57 
 
 		 456 aa  521  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.423652  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0748  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  58.94 
 
 		 456 aa  522  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1711  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  57.3 
 
 		 445 aa  522  1e-147  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.282478  normal  0.0341241 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3378  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  58.5 
 
 		 456 aa  520  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3582  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  57.75 
 
 		 453 aa  519  1e-146  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3405  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  57.4 
 
 		 456 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.315952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1595  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  59.06 
 
 		 445 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.051744  normal  0.253691 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2709  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  58.97 
 
 		 456 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000704045 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0811  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  58.93 
 
 		 446 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3564  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  57.08 
 
 		 457 aa  511  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.440257  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2160  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  58.39 
 
 		 445 aa  510  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.952196  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3685  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  57.52 
 
 		 457 aa  510  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.627974  normal  0.0175665 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0754  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  57.08 
 
 		 457 aa  510  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.765141  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3495  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  57.08 
 
 		 457 aa  510  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25280  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  57.72 
 
 		 445 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1573  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  55.78 
 
 		 453 aa  503  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.167063  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1569  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  55.8 
 
 		 449 aa  501  1e-140  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272419  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14590  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  55.48 
 
 		 445 aa  490  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3211  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  55.19 
 
 		 459 aa  483  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0179113  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2389  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  54.77 
 
 		 452 aa  482  1e-135  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.226253  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2981  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  52.31 
 
 		 455 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0100  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  49.67 
 
 		 454 aa  436  1e-121  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.178382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2424  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  50.99 
 
 		 450 aa  428  1e-119  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2104  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  50.55 
 
 		 450 aa  425  1e-118  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3417  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  48.66 
 
 		 447 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12163  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  33.93 
 
 		 449 aa  263  4e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2385  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  33.11 
 
 		 451 aa  261  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2138  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  33.85 
 
 		 448 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000022983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0043  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  33.56 
 
 		 451 aa  244  1.9999999999999999e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2182  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  31.49 
 
 		 451 aa  221  1.9999999999999999e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2536  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  28.83 
 
 		 446 aa  189  9e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.892294  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0002  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  28.39 
 
 		 465 aa  156  7e-37  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0988  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  20.59 
 
 		 441 aa  45.8  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1155  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  20.75 
 
 		 441 aa  45.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.47563 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2510  electron transport complex protein RnfC  20.54 
 
 		 790 aa  44.3  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>