260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0896 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0896  ybaK/ebsC protein  100 
 
 
158 aa  318  1.9999999999999998e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000040826  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1602  ybaK/ebsC protein  54.79 
 
 
162 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.378112  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0105  YbaK/ebsC protein  52.7 
 
 
157 aa  158  3e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1378  YbaK/ebsC protein  53.69 
 
 
160 aa  157  5e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0222157  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1631  YbaK/ebsC protein  55.1 
 
 
158 aa  157  7e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4879  ybaK/ebsC protein  50.33 
 
 
162 aa  154  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.262878  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2119  ybaK/ebsC protein  48.05 
 
 
157 aa  154  7e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.443897  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2028  ebsC protein  50.34 
 
 
169 aa  149  2e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0129565 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4590  hypothetical protein  48.65 
 
 
156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.938781  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2562  ybaK/ebsC protein  48.32 
 
 
157 aa  144  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09630  ybaK/ebsC protein  52.21 
 
 
161 aa  139  9.999999999999999e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443287  hitchhiker  0.00251062 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0170  ybaK/ebsC protein  47.3 
 
 
161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1566  ybaK/ebsC protein  44.16 
 
 
161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0327966  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1356  ybaK/ebsC protein  44.16 
 
 
161 aa  137  7e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00173308  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1766  hypothetical protein  46.26 
 
 
158 aa  135  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.547358  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3222  ybaK/ebsC protein  43.54 
 
 
161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0940  ybaK/ebsC protein  42.77 
 
 
169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0583  ybaK/ebsC protein  41.14 
 
 
158 aa  128  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0355  ebsC protein, putative  41.94 
 
 
168 aa  127  9.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3053  ybaK/ebsC protein  44.37 
 
 
158 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3347  ybaK/ebsC family protein  42.38 
 
 
158 aa  123  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.297019  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3116  transcriptional regulator  42.38 
 
 
158 aa  123  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3129  ybaK/ebsC family protein  42.38 
 
 
158 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328487  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3021  transcriptional regulator  42.38 
 
 
158 aa  122  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3375  ybaK/ebsC family protein  42.38 
 
 
158 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.870558  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3350  ybaK/ebsC family protein  41.72 
 
 
158 aa  121  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1903  ybaK/ebsC family protein  41.72 
 
 
158 aa  121  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3328  ybaK/ebsC family protein  41.72 
 
 
158 aa  121  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3353  ybaK/ebsC family protein  41.72 
 
 
158 aa  120  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.261499  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0622  ybaK/ebsC protein  37.82 
 
 
158 aa  117  7e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966718  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0737  ybaK/ebsC protein  41.78 
 
 
160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0721  ybaK/ebsC protein  41.78 
 
 
160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1956  ybaK/ebsC protein  42.57 
 
 
164 aa  114  5e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.145688  hitchhiker  0.00991863 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1957  ybaK/ebsC protein  43.45 
 
 
161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000134669  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08460  ybaK/ebsC protein  44.52 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.466447  normal  0.283555 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1609  ybaK/prolyl-tRNA synthetases associated domain-containing protein  48.54 
 
 
112 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0985663  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3903  hypothetical protein  41.56 
 
 
156 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.531772  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4530  hypothetical protein  41.5 
 
 
156 aa  104  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666338  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3195  ybaK/ebsC protein  40.25 
 
 
161 aa  103  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.827708  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1106  ybaK/ebsC protein  40.82 
 
 
156 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3039  hypothetical protein  37.66 
 
 
156 aa  103  7e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1696  ybaK/ebsC protein  38.78 
 
 
168 aa  103  9e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0180556 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4335  ybaK/ebsC protein  40.82 
 
 
156 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.319378  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0021  YbaK/EbsC protein  36.6 
 
 
155 aa  103  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000866016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1077  ybaK/ebsC protein  40.82 
 
 
156 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593377  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1461  ybaK/ebsC protein  37.84 
 
 
155 aa  102  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1118  ybaK/ebsC protein  40.82 
 
 
156 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.081988  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4166  ybaK/ebsC protein  42.28 
 
 
156 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1348  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  38.31 
 
 
159 aa  102  3e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0192059  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2376  ybaK/ebsC protein  38.51 
 
 
169 aa  100  7e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0625  ybaK/ebsC protein  40.69 
 
 
157 aa  100  8e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0361405 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3844  ybaK/ebsC protein  43.62 
 
 
160 aa  100  8e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2065  ybaK/ebsC protein  44.2 
 
 
154 aa  100  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17990  hypothetical protein  40.14 
 
 
156 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.020982  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1563  hypothetical protein  40.14 
 
 
156 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1441  ybaK/ebsC protein  42.86 
 
 
162 aa  98.2  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1005  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  37.78 
 
 
158 aa  98.2  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4234  ybaK/ebsC protein  42.38 
 
 
160 aa  98.2  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253359  normal  0.089415 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1012  ybaK/ebsC protein  36.81 
 
 
157 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3047  ybaK/ebsC protein  36.36 
 
 
163 aa  95.9  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326078  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14010  hypothetical protein  41.04 
 
 
155 aa  95.1  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2906  YbaK/EbsC protein  37.82 
 
 
166 aa  95.5  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334796  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0967  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  39.86 
 
 
161 aa  95.5  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0057885  normal  0.753698 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6293  ybaK/ebsC protein  40.13 
 
 
160 aa  95.1  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5733  ybaK/ebsC protein  36.91 
 
 
165 aa  93.2  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10900  ybaK/ebsC protein  37.78 
 
 
170 aa  93.2  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.882195 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0018  ybaK/ebsC protein  38.82 
 
 
155 aa  92.4  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021851 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3090  ybaK/ebsC protein  37.96 
 
 
155 aa  92  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00342065  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0113  ybaK/ebsC protein  36.11 
 
 
155 aa  92  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4290  ybaK/ebsC protein  34.84 
 
 
157 aa  92  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.780598 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1120  hypothetical protein  36.13 
 
 
157 aa  92  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14060  ybaK/ebsC protein  32.26 
 
 
163 aa  91.3  4e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00161017  normal  0.469226 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1431  ybaK/ebsC protein  42.65 
 
 
164 aa  91.3  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.867561 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0016  ybaK/ebsC protein  39.46 
 
 
154 aa  91.7  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0587946  normal  0.636311 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0012  ybaK/ebsC protein  38.89 
 
 
157 aa  90.9  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0187594 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3668  hypothetical protein  35.62 
 
 
157 aa  90.9  7e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1105  ybaK/ebsC protein  41.32 
 
 
162 aa  90.5  7e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0228  hypothetical protein  37.68 
 
 
169 aa  90.5  8e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.822642  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0414  hypothetical protein  37.4 
 
 
155 aa  90.1  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0854  hypothetical protein  32 
 
 
170 aa  88.6  3e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000580569  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0955  ybaK/ebsC protein  40 
 
 
158 aa  88.2  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0993  ybaK/ebsC protein  40 
 
 
158 aa  88.2  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.206645  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0785  ybaK/ebsC protein  40.56 
 
 
157 aa  87.8  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0957  ybaK/ebsC protein  40 
 
 
158 aa  87.8  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3346  ybaK/ebsC protein  42.86 
 
 
156 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1201  ybaK/ebsC protein  33.55 
 
 
155 aa  87.4  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00297582  hitchhiker  0.00069795 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3539  ybaK/ebsC protein  38.46 
 
 
158 aa  87  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115352  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10700  ybaK/ebsC protein  31.79 
 
 
172 aa  86.3  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00787885  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2973  ybaK/ebsC protein  39.16 
 
 
158 aa  86.3  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1040  ybaK/ebsC protein  38.46 
 
 
158 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0196148  hitchhiker  0.0000171099 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1124  hypothetical protein  40 
 
 
158 aa  85.1  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3321  ybaK/ebsC protein  38.46 
 
 
158 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3413  ybaK/ebsC protein  38.46 
 
 
158 aa  85.1  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0703981  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1181  ybaK/ebsC protein  35.42 
 
 
166 aa  84.7  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0675087  normal  0.344163 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2421  ybaK/ebsC protein  31.43 
 
 
157 aa  84.3  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.332084 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0416  hypothetical protein  34.48 
 
 
159 aa  84  7e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3129  ybaK/ebsC protein  34.48 
 
 
159 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.393401  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00437  hypothetical protein  34.48 
 
 
159 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.34185  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0520  hypothetical protein  34.48 
 
 
159 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0558  hypothetical protein  34.48 
 
 
159 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>