38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0188 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0188  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 248 aa  506  9.999999999999999e-143  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0250391  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0318  rod shape-determining protein MreC  47.41 
 
 		 234 aa  226  3e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.462848  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0869  rod shape-determining protein MreC  44.53 
 
 		 251 aa  223  3e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1351  rod shape-determining protein MreC  46.05 
 
 		 248 aa  221  8e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.457737  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2126  rod shape-determining protein MreC  48.24 
 
 		 239 aa  209  3e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.582677  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1693  rod shape-determining protein MreC  40.57 
 
 		 249 aa  199  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0326  rod shape-determining protein MreC  40.16 
 
 		 249 aa  196  3e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0336673  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0304  rod shape-determining protein MreC  41.2 
 
 		 236 aa  193  2e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1396  rod shape-determining protein MreC  40.89 
 
 		 246 aa  185  6e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1466  rod shape-determining protein MreC  36.25 
 
 		 253 aa  158  9e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  24.4 
 
 		 281 aa  52.4  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  40.45 
 
 		 283 aa  50.8  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  31.13 
 
 		 277 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1380  rod shape-determining protein MreC  25.93 
 
 		 276 aa  50.1  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04261  rod shape-determining protein MreC  40.51 
 
 		 448 aa  50.1  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410208  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1249  rod shape-determining protein MreC  26.67 
 
 		 333 aa  49.3  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0216084  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  32.29 
 
 		 272 aa  48.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  32.56 
 
 		 302 aa  47.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  31.71 
 
 		 315 aa  47.8  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  35.71 
 
 		 357 aa  47.8  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  34.02 
 
 		 274 aa  47.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  37.21 
 
 		 292 aa  47.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0471  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 285 aa  47.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  29.77 
 
 		 272 aa  47.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0163  rod shape-determining protein MreC  37.33 
 
 		 296 aa  45.8  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  24.9 
 
 		 267 aa  44.7  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  22.87 
 
 		 283 aa  44.7  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2821  rod shape-determining protein MreC  33.96 
 
 		 319 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  29.52 
 
 		 292 aa  43.5  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3453  rod shape-determining protein MreC  34.25 
 
 		 407 aa  43.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.968542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 		 286 aa  43.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 		 274 aa  43.1  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  32.95 
 
 		 296 aa  42.7  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  27.32 
 
 		 285 aa  42.7  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  34.83 
 
 		 273 aa  42.7  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  32.95 
 
 		 299 aa  42.7  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1733  Rod shape-determining protein MreC  30 
 
 		 256 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000284211  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0299  rod shape-determining protein MreC  34.78 
 
 		 249 aa  42  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>