21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0743 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0743  Sodium:galactoside symporter  100 
 
 		 273 aa  543  1e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2828  hypothetical protein  30 
 
 		 239 aa  65.9  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4258  hypothetical protein  34.38 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.175632 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0014  hypothetical protein  25.13 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000507536  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_14  lipoprotein  27.43 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0014  hypothetical protein  26.47 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.151106  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_13  hypothetical protein  27.94 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0013  hypothetical protein  25.21 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0188958  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0015  putative lipoprotein  25.37 
 
 		 264 aa  53.5  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0890287  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1809  hypothetical protein  23.81 
 
 		 239 aa  52.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4257  phage shock protein C, PspC  26.15 
 
 		 847 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198729 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0902  hypothetical protein  19.92 
 
 		 250 aa  51.2  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000720917  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3536  hypothetical protein  21.89 
 
 		 234 aa  50.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.189372 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2419  hypothetical protein  19.49 
 
 		 248 aa  50.1  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000101688  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11208  hypothetical protein  24.9 
 
 		 244 aa  48.9  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0737166  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3568  hypothetical protein  21.88 
 
 		 235 aa  47.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.781941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1828  hypothetical protein  28.39 
 
 		 236 aa  45.8  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0106311  normal  0.19296 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2749  hypothetical protein  20.43 
 
 		 240 aa  44.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.641222  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0893  hypothetical protein  38.81 
 
 		 251 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1903  hypothetical protein  21.12 
 
 		 237 aa  43.9  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0745  hypothetical protein  31.88 
 
 		 250 aa  42.7  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.664891 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>