44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1718 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1718  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0414729  hitchhiker  0.0000333205 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2666  hypothetical protein  98.81 
 
 
252 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.141618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2745  hypothetical protein  96.83 
 
 
252 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.284126 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2631  hypothetical protein  96.03 
 
 
252 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1610  hypothetical protein  73.15 
 
 
251 aa  370  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000546178  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1584  hypothetical protein  48.02 
 
 
238 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.753254  normal  0.316977 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1590  hypothetical protein  48.44 
 
 
234 aa  229  3e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.124163 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1523  hypothetical protein  46.83 
 
 
234 aa  227  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3571  hypothetical protein  46.83 
 
 
212 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0786  hypothetical protein  38.93 
 
 
233 aa  161  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1720  hypothetical protein  37.83 
 
 
224 aa  145  9e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.851625  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2811  hypothetical protein  33.74 
 
 
226 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.255962  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1784  hypothetical protein  34.92 
 
 
231 aa  137  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.215532  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2355  hypothetical protein  33.73 
 
 
256 aa  123  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06645  hypothetical protein  30.95 
 
 
239 aa  108  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001140  putative secreted protein  30.71 
 
 
239 aa  106  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2129  hypothetical protein  26.46 
 
 
208 aa  97.1  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.116207  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0107  hypothetical protein  29.3 
 
 
211 aa  94  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3483  hypothetical protein  26.5 
 
 
194 aa  79.7  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532841  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1444  hypothetical protein  25.11 
 
 
224 aa  78.2  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000075829  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1761  hypothetical protein  26.54 
 
 
223 aa  66.6  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0748188  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003961  putative secreted protein  27.67 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004185  hypothetical protein  31.13 
 
 
197 aa  58.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.737127  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01270  hypothetical protein  29.66 
 
 
198 aa  55.8  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2432  hypothetical protein  26.32 
 
 
234 aa  54.7  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2534  hypothetical protein  26.52 
 
 
226 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000238326  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3206  hypothetical protein  26.52 
 
 
226 aa  50.8  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00873811  normal  0.0205878 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2623  hypothetical protein  26.52 
 
 
226 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.515334  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00968  hypothetical protein  25.44 
 
 
220 aa  44.7  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.554756  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00975  hypothetical protein  25.44 
 
 
220 aa  44.7  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2679  conserved hypothetical protein  25.44 
 
 
220 aa  44.7  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.430544  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1128  hypothetical protein  25.44 
 
 
220 aa  44.7  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.52869  normal  0.229343 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2351  hypothetical protein  25.44 
 
 
220 aa  44.7  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.300281  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2155  hypothetical protein  25.44 
 
 
220 aa  44.7  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.257613  normal  0.348745 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1079  hypothetical protein  25.44 
 
 
220 aa  44.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928447  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1232  hypothetical protein  22.35 
 
 
243 aa  43.9  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1186  hypothetical protein  24.8 
 
 
220 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal  0.698742 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1476  hypothetical protein  22.92 
 
 
220 aa  43.9  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2632  hypothetical protein  25.44 
 
 
220 aa  43.5  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.521459  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2659  hypothetical protein  25.7 
 
 
236 aa  43.1  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1073  hypothetical protein  25.44 
 
 
220 aa  43.5  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00226171  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1152  hypothetical protein  23.32 
 
 
220 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1118  hypothetical protein  23.32 
 
 
220 aa  42  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000226557 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1140  hypothetical protein  23.32 
 
 
220 aa  42  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.704245 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>