78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0688 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0688  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 115 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0658  thioredoxin domain-containing protein  92.17 
 
 		 115 aa  221  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0678  thioredoxin domain-containing protein  91.96 
 
 		 119 aa  217  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0689  thioredoxin domain-containing protein  84.07 
 
 		 121 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0534025  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3375  thioredoxin domain-containing protein  70 
 
 		 120 aa  165  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0578  thioredoxin domain-containing protein  68.7 
 
 		 120 aa  165  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3546  hypothetical protein  65.18 
 
 		 117 aa  159  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0503  thioredoxin domain-containing protein  55.24 
 
 		 113 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0732  hypothetical protein  66.25 
 
 		 80 aa  118  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3583  thioredoxin domain-containing protein  50 
 
 		 110 aa  115  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0886  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  38.46 
 
 		 110 aa  88.6  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1211  hypothetical protein  38.32 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2226  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  33.01 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000281908  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0342  thioredoxin-like  33.33 
 
 		 106 aa  72.4  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000844877  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  29.52 
 
 		 310 aa  50.4  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2062  thioredoxin domain-containing protein  27.18 
 
 		 111 aa  50.1  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228901  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  28.57 
 
 		 280 aa  50.1  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  30.48 
 
 		 281 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3283  thioredoxin  29.13 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  30.48 
 
 		 281 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  27.37 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0504  thioredoxin  27.96 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235096 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  30.77 
 
 		 297 aa  48.5  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  26.88 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0651  thioredoxin  26.6 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2559  YdfQ  30 
 
 		 122 aa  47.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  5.5439e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0588  thioredoxin  24.74 
 
 		 141 aa  47  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.99153  normal  0.710013 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  27.27 
 
 		 280 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0889  glutaredoxin 2  28.41 
 
 		 91 aa  45.4  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.816837  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0471  Thioredoxin domain  27.5 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4857  thioredoxin  29.87 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0651815  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  29.55 
 
 		 289 aa  44.7  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1332  thioredoxin  29.87 
 
 		 159 aa  44.3  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1254  thioredoxin  28.72 
 
 		 144 aa  44.3  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  26.67 
 
 		 280 aa  43.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0928  thioredoxin  24.69 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0499  hypothetical protein  29.03 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  30 
 
 		 282 aa  42.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1123  thioredoxin  29.76 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0618  thioredoxin  25.97 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0739  thioredoxin  30.95 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.186683  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  27.71 
 
 		 282 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  30 
 
 		 282 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  27.88 
 
 		 269 aa  42.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  27.71 
 
 		 287 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  29.55 
 
 		 285 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4872  hypothetical protein  26 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1700  glutaredoxin 2  26.67 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.947077  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28227  predicted protein  33.33 
 
 		 547 aa  42.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0120159 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1048  thioredoxin domain-containing protein  28.4 
 
 		 331 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157412  normal  0.991017 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  32.35 
 
 		 124 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3683  thioredoxin-related  29.63 
 
 		 329 aa  41.6  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0430  hypothetical protein  25 
 
 		 104 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1252  thioredoxin domain-containing protein  32.14 
 
 		 106 aa  42  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000389642  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  32.35 
 
 		 124 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0452  hypothetical protein  28.12 
 
 		 104 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0707435  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2559  hypothetical protein  26.92 
 
 		 118 aa  41.2  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2612  hypothetical protein  26.92 
 
 		 118 aa  41.2  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1645  glutaredoxin 2  30.49 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88514  predicted protein  29.11 
 
 		 555 aa  41.2  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0364  thioredoxin  26.04 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.968334  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0361  thioredoxin  25 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  32.97 
 
 		 287 aa  41.2  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0500  hypothetical protein  26.04 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  33.33 
 
 		 277 aa  40.8  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0326  Thioredoxin domain protein  31.71 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0373  hypothetical protein  25 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0387  hypothetical protein  25 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.910777  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0368  hypothetical protein  28.26 
 
 		 104 aa  40.4  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0102  thioredoxin  23.91 
 
 		 140 aa  40.4  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4209  thioredoxin  29.63 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558513 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  29.41 
 
 		 282 aa  40.4  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2371  thioredoxin domain-containing protein  28.21 
 
 		 303 aa  40.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3396  putative thioredoxin  25.64 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.950013  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0243  thioredoxin  22.64 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122972  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1981  thioredoxin reductase  31.75 
 
 		 460 aa  40  0.009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0833552 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  25 
 
 		 302 aa  40.4  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3067  thioredoxin 2  25 
 
 		 139 aa  40.4  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110629 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>