61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0816 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0816  rhomboid family protein  100 
 
 		 217 aa  419  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0338425 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0870  rhomboid family protein  84.72 
 
 		 217 aa  354  5e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.474351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0267  Rhomboid family protein  45.88 
 
 		 224 aa  149  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0999  membrane protein-like protein  47.27 
 
 		 214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4537  Rhomboid family protein  41.81 
 
 		 211 aa  126  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1292  Rhomboid family protein  41.59 
 
 		 218 aa  126  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2931  hypothetical protein  42.77 
 
 		 209 aa  125  6e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0637  rhomboid-like protein  36.02 
 
 		 191 aa  124  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00193081 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2687  Rhomboid family protein  39.88 
 
 		 195 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2245  Rhomboid family protein  41.42 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.927336  normal  0.19661 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29150  uncharacterized membrane protein  44.89 
 
 		 192 aa  123  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.77593 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0445  Rhomboid family protein  45.06 
 
 		 199 aa  121  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0458  Rhomboid family protein  45.06 
 
 		 199 aa  121  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365759  normal  0.0342055 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0440  Rhomboid family protein  48.57 
 
 		 194 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0836383  normal  0.594708 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1014  Rhomboid family protein  47.17 
 
 		 211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1968  Rhomboid family protein  41.52 
 
 		 209 aa  115  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.579025  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0518  rhomboid family protein  46.76 
 
 		 210 aa  115  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137461  normal  0.0721678 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11367  hypothetical protein  42.94 
 
 		 240 aa  112  6e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000159255  normal  0.565329 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1699  Rhomboid family protein  36.79 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0109717  normal  0.288911 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0810  Rhomboid family protein  34.36 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4290  rhomboid family protein  36.31 
 
 		 225 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235195 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1835  hypothetical protein  46.81 
 
 		 208 aa  99  5e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.210618 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2355  rhomboid family protein  36.79 
 
 		 225 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.481734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3921  rhomboid family protein  36.9 
 
 		 229 aa  95.1  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3847  rhomboid-like protein  36.9 
 
 		 229 aa  95.1  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3833  rhomboid family protein  36.9 
 
 		 229 aa  95.1  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.123516 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01334  Rhomboid-like protein  41.25 
 
 		 179 aa  94.4  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.902393  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1218  rhomboid-like protein  38.57 
 
 		 192 aa  93.2  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0855  hypothetical protein  38.89 
 
 		 199 aa  92  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0886  hypothetical protein  39.58 
 
 		 199 aa  91.7  7e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1166  rhomboid family protein  38.16 
 
 		 203 aa  84.3  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.270459  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3288  rhomboid family protein  33.79 
 
 		 188 aa  83.6  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.419904  normal  0.14136 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1781  rhomboid-like protein protein  40.68 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.138273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2190  rhomboid-like protein  30.73 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05645  hypothetical protein  31.95 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03495  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  35.44 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3785  rhomboid family protein  35.52 
 
 		 185 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4037  Rhomboid family protein  35.04 
 
 		 256 aa  78.2  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6253 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3473  hypothetical protein  35.67 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000477638  normal  0.0111497 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1694  rhomboid-like protein  38.1 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.534876  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0409  rhomboid family protein  33.74 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.48547  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1238  Rhomboid family protein  41.57 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000294506 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05140  uncharacterized membrane protein  42.86 
 
 		 215 aa  72  0.000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0193508  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0020  Rhomboid family protein  32.43 
 
 		 242 aa  65.1  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.430888  normal  0.257082 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3385  rhomboid family protein  37.67 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.861601 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2256  rhomboid-like protein  31.58 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.250731  normal  0.0526301 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17631  rhomboid family protein  35.17 
 
 		 193 aa  52.4  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.97289 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2134  rhomboid family protein  35.29 
 
 		 198 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00873022  decreased coverage  0.000000167975 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5574  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 228 aa  46.6  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1048  rhomboid family protein  43.02 
 
 		 511 aa  44.3  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0760  hypothetical protein  34.04 
 
 		 180 aa  44.3  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3067  Rhomboid family protein  30.2 
 
 		 248 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00769632  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1208  rhomboid family protein  30.71 
 
 		 219 aa  42.7  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102271  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1899  hypothetical protein  34.27 
 
 		 179 aa  43.1  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.173429  normal  0.681573 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  36.23 
 
 		 554 aa  43.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  38.46 
 
 		 232 aa  42.4  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0012  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 282 aa  42.4  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1145  rhomboid-like protein  42.25 
 
 		 209 aa  42.4  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.062247  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0937  rhomboid family protein  28.57 
 
 		 202 aa  42.4  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  33.6 
 
 		 279 aa  42  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  32.08 
 
 		 290 aa  41.6  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>