30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0787 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0787  DoxX family protein  100 
 
 		 148 aa  270  5.000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.639865  hitchhiker  0.00402989 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0844  DoxX family protein  97.3 
 
 		 174 aa  224  4e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.450101  normal  0.144011 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5136  hypothetical protein  50.98 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2616  DoxX family protein  51.39 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0141703  normal  0.011068 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4763  DoxX family protein  56.04 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5798  hypothetical protein  39.04 
 
 		 169 aa  70.5  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.233745 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2608  hypothetical protein  37.5 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1649  hypothetical protein  36.64 
 
 		 174 aa  67  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4341  hypothetical protein  37.67 
 
 		 171 aa  60.8  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.440484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4122  membrane protein-like protein  37.5 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1790  membrane protein  30.97 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0469935  hitchhiker  0.000576942 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1742  hypothetical protein  32.43 
 
 		 116 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4296  DoxX family protein  36.61 
 
 		 133 aa  53.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.170558 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4712  hypothetical protein  37.86 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.880265  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53830  hypothetical protein  42.68 
 
 		 131 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.623323  normal  0.810149 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2315  hypothetical protein  32.46 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.20145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1635  DoxX family protein  33.63 
 
 		 168 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.364562 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2365  membrane protein-like protein  26.05 
 
 		 118 aa  47.8  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2209  hypothetical protein  32.38 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2171  membrane protein-like protein  32.38 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1317  hypothetical protein  32.5 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000855908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5051  hypothetical protein  35.06 
 
 		 115 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.780189 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4384  membrane protein-like protein  34.02 
 
 		 140 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3912  membrane protein-like protein  34.02 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622055 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2311  hypothetical protein  32.97 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15890  hypothetical protein  39.29 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.294177  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4279  membrane protein-like protein  34.02 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.566511 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2150  membrane protein-like  30.53 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0271562 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3783  membrane protein-like protein  35.8 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00217188  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3443  hypothetical protein  33.82 
 
 		 158 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.1066  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>