89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3354 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0352  LppC family lipoprotein  50.65 
 
 		 634 aa  655    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.184471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3684  LppC family lipoprotein  54.26 
 
 		 627 aa  683    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0261  LppC family lipoprotein  54.66 
 
 		 628 aa  689    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0389  LppC family lipoprotein  51.6 
 
 		 607 aa  644    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.743997  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3880  LppC family lipoprotein  54.34 
 
 		 627 aa  687    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0981735 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3354  putative lipoprotein  100 
 
 		 595 aa  1220    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4099  LppC family lipoprotein  53.08 
 
 		 634 aa  676    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0227  LppC family lipoprotein  53.07 
 
 		 634 aa  672    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.238094 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3692  LppC family lipoprotein  54.76 
 
 		 616 aa  674    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348011  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4069  LppC family lipoprotein  52.6 
 
 		 634 aa  674    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3989  LppC family lipoprotein  52.6 
 
 		 634 aa  671    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0300  putative lipoprotein  55.81 
 
 		 619 aa  690    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4251  LppC family lipoprotein  52.81 
 
 		 626 aa  664    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.945552  hitchhiker  0.0000000616017 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0252  LppC family lipoprotein  53.78 
 
 		 624 aa  666    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.625916  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4187  LppC family lipoprotein  52.6 
 
 		 634 aa  672    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0273  LppC putative lipoprotein  52.36 
 
 		 603 aa  633  1e-180  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000539466  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00891  hypothetical protein  30.98 
 
 		 603 aa  295  2e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004501  LppC putative lipoprotein  31.07 
 
 		 555 aa  282  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000349106  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0113  putative lipoprotein  29.54 
 
 		 653 aa  279  9e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2654  putative lipoprotein LppC  29.73 
 
 		 603 aa  276  1.0000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1177  LppC family lipoprotein  28.84 
 
 		 677 aa  234  4.0000000000000004e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.055728 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3693  LppC putative lipoprotein  28.83 
 
 		 658 aa  207  5e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0356  LppC putative lipoprotein  28.87 
 
 		 629 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0539  LppC family lipoprotein  29.45 
 
 		 657 aa  200  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1120  hypothetical protein  29.45 
 
 		 689 aa  200  7e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0475  putative LppC lipoprotein  29.45 
 
 		 689 aa  199  9e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4432  hypothetical protein  27.22 
 
 		 721 aa  195  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4419  lipoprotein, putative  28.75 
 
 		 604 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0598181  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57480  putative lipoprotein  27.83 
 
 		 604 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4113  LppC putative lipoprotein  27.83 
 
 		 604 aa  191  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4995  putative lipoprotein  27.83 
 
 		 604 aa  190  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.713572  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0911  LppC family lipoprotein  28.51 
 
 		 602 aa  189  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217114  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3066  hypothetical protein  27.17 
 
 		 603 aa  186  9e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0757  LppC family lipoprotein  30.98 
 
 		 635 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2463  LppC family lipoprotein  28.17 
 
 		 617 aa  185  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.36704  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3145  ATPase  26.49 
 
 		 661 aa  182  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2923  hypothetical protein  27.11 
 
 		 603 aa  181  4e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4684  LppC putative lipoprotein  26.19 
 
 		 603 aa  179  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2204  LppC family lipoprotein  30.13 
 
 		 628 aa  172  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.972417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13140  LppC lipoprotein  27.24 
 
 		 607 aa  171  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3624  LppC family lipoprotein  28.01 
 
 		 680 aa  170  6e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0740  LppC precursor  24.59 
 
 		 604 aa  169  1e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.164476  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2200  LppC putative lipoprotein  28.57 
 
 		 596 aa  167  5e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4399  LppC family lipoprotein  26.8 
 
 		 605 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.204458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0933  LppC family lipoprotein  26.8 
 
 		 605 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4523  LppC family lipoprotein  26.4 
 
 		 605 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1325  LppC family lipoprotein  26.75 
 
 		 605 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.967741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2102  LppC family lipoprotein  26.03 
 
 		 631 aa  155  1e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03355  putative lipoprotein  24.92 
 
 		 666 aa  154  5e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1933  putative lipoprotein  27.99 
 
 		 394 aa  153  1e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.814696  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0260  lipoprotein antigen  27.99 
 
 		 396 aa  153  1e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0185  putative lipoprotein  26.66 
 
 		 625 aa  148  3e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0314  LppC family lipoprotein  30.08 
 
 		 672 aa  146  9e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.92899  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3782  LppC family lipoprotein  31.36 
 
 		 682 aa  141  3.9999999999999997e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0529967  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4336  LppC family lipoprotein  30.54 
 
 		 674 aa  139  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.765962  normal  0.192423 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3522  LppC superfamily  30.63 
 
 		 680 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.173213  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0308  LppC family lipoprotein  30.79 
 
 		 672 aa  139  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3619  LppC family protein  30.3 
 
 		 680 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3453  LppC superfamily  30.33 
 
 		 680 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3451  LppC superfamily  30.03 
 
 		 680 aa  136  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3559  LppC superfamily  30.03 
 
 		 680 aa  136  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3584  LppC family lipoprotein  30.15 
 
 		 704 aa  134  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.129912 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2394  putative lipoprotein-like protein  23.01 
 
 		 617 aa  127  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.527391  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0551  LppC family lipoprotein  28.61 
 
 		 678 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.551185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02965  hypothetical protein  28.61 
 
 		 678 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0558  LppC family lipoprotein  28.61 
 
 		 678 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03014  hypothetical protein  28.61 
 
 		 678 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3442  putative lipoprotein  28.11 
 
 		 678 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3339  putative lipoprotein  28.61 
 
 		 678 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3625  putative lipoprotein  28.7 
 
 		 678 aa  118  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4466  putative lipoprotein  28.7 
 
 		 678 aa  118  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3629  putative lipoprotein  29.05 
 
 		 678 aa  118  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0676  LppC family lipoprotein  26.22 
 
 		 705 aa  115  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1694  putative lipoprotein-like  27.97 
 
 		 525 aa  108  4e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.97529  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2212  LppC family lipoprotein  25.73 
 
 		 621 aa  105  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.228557 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2282  putative lipoprotein-like protein  25.06 
 
 		 510 aa  105  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0590  LppC family lipoprotein  28.21 
 
 		 573 aa  86.7  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.990028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04379  LppC superfamily  23.82 
 
 		 576 aa  80.9  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.418769  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0316  Putative lipoprotein-like protein  23.96 
 
 		 612 aa  79.3  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.915463  hitchhiker  0.000474295 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0143  lipoprotein, putative  23.96 
 
 		 612 aa  79.3  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1675  LppC family lipoprotein  26.77 
 
 		 576 aa  70.1  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1749  hypothetical protein  34.78 
 
 		 576 aa  68.2  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2085  extracellular ligand-binding receptor  23.4 
 
 		 356 aa  55.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.137371  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1484  hypothetical protein  22.61 
 
 		 481 aa  49.7  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1763  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  23.89 
 
 		 677 aa  47.4  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0264  extracellular ligand-binding receptor  28.91 
 
 		 378 aa  45.1  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.241284  normal  0.379489 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1534  putative lipoprotein-like protein  24.38 
 
 		 402 aa  45.1  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.75635  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1583  extracellular ligand-binding receptor  27.78 
 
 		 450 aa  44.7  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0190  hypothetical protein  24.7 
 
 		 407 aa  44.7  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.613594  normal  0.386647 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>