218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0745 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001304  ANIA_07388  Catalase-peroxidase (CP)(EC 1.11.1.6)(EC 1.11.1.7)(Peroxidase/catalase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q96VT4]  59.38 
 
 
739 aa  845    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5331  catalase/peroxidase HPI  61.74 
 
 
729 aa  902    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.850303  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6389  catalase  65.25 
 
 
726 aa  911    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03828  catalase/hydroperoxidase HPI(I)  57.52 
 
 
726 aa  787    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4043  catalase/peroxidase HPI  57.38 
 
 
726 aa  786    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2100  catalase/peroxidase  60.72 
 
 
727 aa  868    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.407281  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3668  catalase/peroxidase HPI  60.32 
 
 
751 aa  875    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0509082  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10808  catalase/peroxidase  59.78 
 
 
740 aa  886    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.661719  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1585  catalase/peroxidase HPI  64.08 
 
 
737 aa  961    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1344  catalase/peroxidase HPI  67.12 
 
 
740 aa  1043    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.814085  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0725  catalase/peroxidase HPI  78.97 
 
 
741 aa  1179    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4405  catalase/peroxidase HPI  55.97 
 
 
728 aa  801    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4530  catalase/peroxidase HPI  60.27 
 
 
756 aa  900    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2391  catalase/peroxidase HPI  62.81 
 
 
728 aa  939    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.347658  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0252  catalase-peroxidase  64.46 
 
 
749 aa  1020    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2454  catalase-peroxidase KatB  55.52 
 
 
721 aa  787    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0250  catalase-peroxidase  64.73 
 
 
749 aa  1025    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2313  catalase-peroxidase KatB  55.39 
 
 
721 aa  783    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1166  catalase/peroxidase  56.98 
 
 
724 aa  805    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.801479  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2061  catalase/peroxidase HPI  60.19 
 
 
751 aa  872    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4208  haem catalase/peroxidase  60.95 
 
 
756 aa  918    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260904  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3836  heme catalase/peroxidase  61.59 
 
 
736 aa  830    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.141049  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1635  heme catalase/peroxidase  60.91 
 
 
751 aa  890    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1741  heme catalase/peroxidase  63.25 
 
 
728 aa  900    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0030  haem catalase/peroxidase  62.99 
 
 
729 aa  892    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.187858 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3366  catalase/peroxidase HPI  62.81 
 
 
728 aa  941    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.336723  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2201  haem catalase/peroxidase  60.78 
 
 
755 aa  906    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1175  catalase/peroxidase HPI  60.98 
 
 
739 aa  897    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3814  haem catalase/peroxidase  64.34 
 
 
728 aa  924    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.915162  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0386  haem catalase/peroxidase  62.78 
 
 
733 aa  937    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0181  catalase/peroxidase HPI  57.38 
 
 
729 aa  811    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.877422  normal  0.0695553 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1656  catalase/peroxidase HPI  54.66 
 
 
720 aa  778    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.83061 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1282  catalase/peroxidase HPI  62.4 
 
 
728 aa  941    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1918  catalase/peroxidase HPI  63.14 
 
 
744 aa  933    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0108605  normal  0.336609 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0610  catalase/peroxidase HPI  61.86 
 
 
732 aa  863    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2909  catalase/peroxidase HPI  70.11 
 
 
747 aa  993    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2433  catalase/peroxidase HPI  64.69 
 
 
718 aa  933    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1586  catalase/peroxidase HPI  56.67 
 
 
735 aa  839    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.711142  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3888  catalase  63.18 
 
 
738 aa  982    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.691403  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0361  catalase/peroxidase HPI  62.91 
 
 
732 aa  892    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0678  catalase/peroxidase HPI  64.99 
 
 
731 aa  955    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.627364  normal  0.640869 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0772  haem catalase/peroxidase  60.81 
 
 
753 aa  875    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.468633  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1384  catalase/peroxidase HPI  52.97 
 
 
720 aa  749    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0223  catalase/peroxidase HPI  62.43 
 
 
732 aa  864    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.125237 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0159  catalase/peroxidase HPI  52.87 
 
 
717 aa  742    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0037  catalase/peroxidase HPI  61.28 
 
 
729 aa  877    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539585  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5371  catalase/hydroperoxidase HPI(I)  62.41 
 
 
726 aa  865    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849549  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1356  catalase/peroxidase HPI  64.48 
 
 
752 aa  941    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2791  catalase/peroxidase HPI  58.88 
 
 
738 aa  857    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.258603 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2146  catalase/peroxidase HPI  56.47 
 
 
731 aa  753    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.423847  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0242  catalase/peroxidase HPI  63.14 
 
 
728 aa  915    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.698456  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3169  catalase/peroxidase HPI  62.68 
 
 
728 aa  889    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2682  catalase/peroxidase HPI  61.15 
 
 
749 aa  875    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.463482  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1975  catalase/peroxidase HPI  65.62 
 
 
753 aa  996    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0626  catalase/peroxidase HPI  63.21 
 
 
726 aa  909    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11937  catalase-peroxidase katG  59.04 
 
 
740 aa  808    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4032  catalase/peroxidase HPI  57.32 
 
 
726 aa  796    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.514139 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3881  catalase/peroxidase HPI  59.83 
 
 
716 aa  820    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.653665  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0311  catalase/peroxidase HPI  55.69 
 
 
728 aa  811    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3379  catalase/peroxidase HPI  79.51 
 
 
739 aa  1222    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0574  catalase/peroxidase HPI  79.24 
 
 
739 aa  1213    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3713  catalase/peroxidase HPI  55.69 
 
 
728 aa  802    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1522  catalase/peroxidase HPI  55.1 
 
 
723 aa  780    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.329951  normal  0.447043 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1917  catalase/peroxidase HPI  56.2 
 
 
738 aa  795    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.151995  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3122  catalase/peroxidase HPI  65.51 
 
 
757 aa  967    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2686  catalase/peroxidase HPI  55.27 
 
 
724 aa  749    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0616  catalase/peroxidase HPI  63.56 
 
 
728 aa  918    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.246482  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5842  catalase/peroxidase HPI  66.26 
 
 
741 aa  969    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0726  catalase/peroxidase HPI  63.14 
 
 
728 aa  915    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5199  catalase/peroxidase HPI  62.68 
 
 
728 aa  889    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0332501 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0306  catalase/peroxidase HPI  55.28 
 
 
728 aa  785    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.20325 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3549  catalase/peroxidase HPI  80.05 
 
 
739 aa  1232    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1387  catalase/peroxidase HPI  59.94 
 
 
736 aa  861    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665875  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0755  catalase/peroxidase HPI  60.5 
 
 
732 aa  854    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0577026  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2497  catalase/peroxidase HPI  55.35 
 
 
725 aa  766    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0875  catalase/peroxidase HPI  61.65 
 
 
760 aa  850    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0745  catalase  100 
 
 
738 aa  1516    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3270  catalase  54.07 
 
 
718 aa  759    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2727  catalase/peroxidase HPI  61.15 
 
 
749 aa  875    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.295293 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2142  catalase/peroxidase HPI  53.9 
 
 
724 aa  773    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.501664  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2984  catalase/peroxidase HPI  53.48 
 
 
737 aa  759    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156049  normal  0.603966 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3208  catalase/peroxidase HPI  61.06 
 
 
747 aa  877    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.996485  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1056  catalase/peroxidase HPI  53.52 
 
 
723 aa  752    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3132  catalase/peroxidase HPI  59.34 
 
 
743 aa  858    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0936782  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0308  catalase/peroxidase HPI  62.81 
 
 
728 aa  939    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0547  catalase/peroxidase HPI  53.15 
 
 
724 aa  758    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.474968  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3740  catalase  60.48 
 
 
715 aa  849    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.150597 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1169  catalase/peroxidase HPI  62.81 
 
 
728 aa  939    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1851  catalase/peroxidase HPI  63.56 
 
 
728 aa  904    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0415  catalase/peroxidase HPI  56.56 
 
 
728 aa  816    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0875  catalase/peroxidase HPI  63.78 
 
 
721 aa  935    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00113495  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3322  catalase/peroxidase HPI  62.81 
 
 
728 aa  939    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3356  catalase/peroxidase HPI  62.81 
 
 
728 aa  939    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0335715  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2713  catalase/peroxidase HPI  61.15 
 
 
749 aa  875    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.451958 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2578  catalase/peroxidase HPI  62.81 
 
 
728 aa  939    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0709  catalase/peroxidase HPI  64.58 
 
 
756 aa  967    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3451  catalase/peroxidase HPI  61.23 
 
 
748 aa  895    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3306  hypothetical protein  55.93 
 
 
724 aa  780    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.706262  normal  0.467266 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3897  catalase/peroxidase HPI  60.41 
 
 
757 aa  903    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2044  catalase/peroxidase HPI  54.79 
 
 
717 aa  771    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.73931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>