206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2688 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2688  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 151 aa  298  2e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1321  hypothetical protein  40 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3271  putative signal-transduction protein with CBS domains  34.03 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2203  hypothetical protein  39.23 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1649  signal-transduction protein  36.11 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0859  XRE family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 170 aa  80.9  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5213  hypothetical protein  31.94 
 
 		 142 aa  80.1  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  0.0487848 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2153  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.268313  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3897  CBS domain containing protein  33.33 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2661  signal-transduction protein  35.25 
 
 		 177 aa  77.4  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63207  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2052  putative signal transduction protein with CBS domains  33.83 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1852  putative signal transduction protein with CBS domains  33.83 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260866  normal  0.0125119 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3128  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1044  putative signal transduction protein with CBS domains  34.72 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0824  CBS domain containing membrane protein  34.33 
 
 		 143 aa  73.6  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1046  signal-transduction protein  32.26 
 
 		 142 aa  73.6  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.460697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2362  signal-transduction protein  29.17 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  32.62 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  32.62 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4635  signal-transduction protein  34.04 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  0.318433 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1107  signal-transduction protein  34.31 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3033  signal-transduction protein  32.86 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0966775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1938  CBS domain-containing protein  31.65 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704039  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3231  signal-transduction protein  33.57 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00933533  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1391  CBS domain-containing protein  33.59 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.769563 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2961  CBS domain-containing proteins  35.16 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.195076  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1607  signal-transduction protein  35.16 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0484541 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1217  CBS domain-containing protein  30.94 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4477  signal-transduction protein  32.06 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.458256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1087  signal-transduction protein  32.64 
 
 		 142 aa  67  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0884607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0352  putative signal transduction protein with CBS domains  31.43 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014797 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2704  CBS domain containing protein  33.33 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0801095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1745  hypothetical protein  32.28 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.87888 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3907  signal-transduction protein  32.09 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5124  putative signal transduction protein with CBS domains  34.04 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.922703  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0705  putative transcriptional regulator, XRE family  35.43 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  32.2 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2019  putative signal transduction protein with CBS domains  38.1 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80054  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1915  signal-transduction protein  32.03 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2670  signal-transduction protein  32.26 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0199897  normal  0.983064 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3616  signal-transduction protein  31.3 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2526  signal-transduction protein  31.03 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.526316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0774  putative signal transduction protein with CBS domains  30.56 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1650  signal-transduction protein  27.91 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1580  signal-transduction protein  31.85 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0967784 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2247  putative signal transduction protein with CBS domains  32.09 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000297093  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2198  signal-transduction protein  35.38 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0268449  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0153  signal-transduction protein  30.22 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4974  putative signal-transduction protein with CBS domains  33.61 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0816417 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3725  signal-transduction protein  28.78 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  28.47 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  28.79 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1676  signal-transduction protein  32.77 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.780489  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2114  CBS domain-containing protein  30.16 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4121  signal-transduction protein  31.72 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2374  signal-transduction protein  33.04 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425597  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1616  putative CBS domain-containing signal transduction protein  30.6 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3241  signal-transduction protein  30.16 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.484063 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  25.9 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3078  CBS domain containing protein  28.28 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12434  hypothetical protein  29.5 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.651384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1245  signal-transduction protein  30.89 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  29.31 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3539  signal-transduction protein  32.8 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1679  putative signal-transduction protein with CBS domains  34.62 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0332032  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3250  signal-transduction protein  24.46 
 
 		 174 aa  53.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0271263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03090  CBS domain-containing protein  28.35 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  hitchhiker  0.000000481482 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  29.57 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1750  putative signal transduction protein with CBS domains  34.62 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0985787  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0335  hypothetical protein  28.35 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1350  CBS domain-containing protein  28.46 
 
 		 154 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0725634  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2480  CBS domain-containing protein  28.46 
 
 		 154 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1515  CBS domain-containing protein  27.94 
 
 		 153 aa  51.6  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2323  putative signal transduction protein with CBS domains  30.77 
 
 		 145 aa  51.6  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.170904  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0334  CBS domain-containing protein  28.46 
 
 		 154 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0612  CBS domain-containing protein  28.46 
 
 		 154 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735232  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1290  CBS domain-containing protein  28.46 
 
 		 154 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427954  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1218  CBS domain-containing protein  28.46 
 
 		 154 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0957  CBS domain-containing protein  28.46 
 
 		 154 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1972  CBS  28.91 
 
 		 898 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.03578  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3686  CBS domain containing protein  25.38 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  29.57 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3735  signal transduction protein  29.37 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5550  signal-transduction protein  27.64 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0016  signal-transduction protein  26.19 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3635  signal-transduction protein  27.64 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295786  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4732  signal-transduction protein  27.64 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820406  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  27.83 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  26.02 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1409  signal-transduction protein  29.37 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3004  signal-transduction protein  29.01 
 
 		 139 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.159612  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4587  signal-transduction protein  26.83 
 
 		 153 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00378118  hitchhiker  0.00177049 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2035  hypothetical protein  24.64 
 
 		 148 aa  50.4  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1026  signal-transduction protein  26.83 
 
 		 153 aa  50.4  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0490462 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2095  hypothetical protein  30.65 
 
 		 164 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.040556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3268  CBS domain-containing protein  29.23 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4123  signal-transduction protein  26.83 
 
 		 153 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00087962  normal  0.0202046 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3943  signal-transduction protein  27.64 
 
 		 153 aa  50.4  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.69222 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3204  putative signal transduction protein with CBS domains  29.01 
 
 		 139 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.585184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>