37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2718 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1839  hypothetical protein  92.67 
 
 		 391 aa  686    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157174  normal  0.968592 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2718  hypothetical protein  100 
 
 		 384 aa  764    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2502  hypothetical protein  91.88 
 
 		 394 aa  711    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.156303  hitchhiker  0.000706101 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1658  hypothetical protein  95.83 
 
 		 384 aa  711    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0600351  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3272  hypothetical protein  78.01 
 
 		 392 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.388567  normal  0.10012 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3423  hypothetical protein  78.22 
 
 		 392 aa  608  1e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3785  hypothetical protein  78.48 
 
 		 390 aa  570  1e-161  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2681  hypothetical protein  26.18 
 
 		 405 aa  153  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.433082  hitchhiker  0.00146512 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4593  hypothetical protein  24.07 
 
 		 394 aa  143  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3954  hypothetical protein  23.54 
 
 		 394 aa  140  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0238  hypothetical protein  23.54 
 
 		 394 aa  140  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3743  hypothetical protein  25.13 
 
 		 393 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0396479 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3670  hypothetical protein  25.13 
 
 		 393 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.279689  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3841  hypothetical protein  25.13 
 
 		 393 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2271  hypothetical protein  25 
 
 		 393 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.223417  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3778  hypothetical protein  25.13 
 
 		 393 aa  135  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.974681 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3670  hypothetical protein  24.87 
 
 		 393 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0348  major facilitator superfamily MFS_1  24.6 
 
 		 393 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0509  hypothetical protein  22.54 
 
 		 397 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3833  hypothetical protein  24.6 
 
 		 393 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0348  hypothetical protein  24.34 
 
 		 393 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3646  hypothetical protein  24.87 
 
 		 393 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.865659  hitchhiker  0.000149858 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3560  hypothetical protein  24.34 
 
 		 393 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3740  hypothetical protein  24.34 
 
 		 393 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4675  hypothetical protein  24.6 
 
 		 393 aa  133  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.398829 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3713  hypothetical protein  23.16 
 
 		 380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03215  hypothetical protein  24.34 
 
 		 393 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03167  hypothetical protein  24.34 
 
 		 393 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3791  hypothetical protein  23.42 
 
 		 394 aa  123  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0183324 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0551  hypothetical protein  21.94 
 
 		 398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09450  major facilitator superfamily MFS_1  22.78 
 
 		 422 aa  72.8  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00253075  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  24.11 
 
 		 395 aa  62.8  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 		 433 aa  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3527  major facilitator transporter  26.11 
 
 		 428 aa  47.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0989887 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1994  major facilitator transporter  21.6 
 
 		 397 aa  46.6  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4936  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  18.52 
 
 		 409 aa  43.9  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2632  major facilitator transporter  19.91 
 
 		 402 aa  43.1  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  0.954997 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>